[bowtie2, libtbb.so.2]error while loading shared libraries: libtbb.so.2: cannot open shared object

在进行DNA甲基化分析的时候,运用bismark做比对。

  1. 建立索引:
#bismark_genome_preparation用于建立索引
bismark_genome_preparation --path_to_aligner 
/.conda/envs/py3.7/bin/ --verbose 
/brassica/methylation/clean/
#--path_to_aligner 选择bowtie2的文件夹,--verbose输出文档


but,遇到问题输出error报错:error while loading shared libraries: libgd.so.2: cannot open shared object

error while loading shared libraries: libgd.so.2: cannot open shared object

各种建立软链接的方式都用了,结果又报错

symbol lookup error: /lustre/home/acct-
/.conda/envs/py3.7/bin/bowtie2-build-s: undefined symbol: _ZTIN3tbb4taskE

最后,通过查阅,降低libtbb的版本:

conda install tbb=2020.2

即可解决,提前删掉本有的tbb噢在环境文件夹lib中的。

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