GEO数据库GEO2R分组问题：实验组在前，对照组在后

进入GEO数据库官网https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/

点开感兴趣的基因集，点击“Analyze with GEO2R”，利用GEO2R进行在线分析

在分析时，需要对实验组和对照组进行分组，组的顺序应该如何定义？

在官网的具体说明中可以找到答案

官网在说明中明确指出，先定义实验组，再定义对照组，这样分析得到的LogFC就是实验组相对于对照组的变化。相对于对照组，LogFC>0,表明该基因在实验组中表达升高；LogFC<0,表明该基因在实验组中表达下降。