孟德尔随机化问题:Error in if (nrow(d) == 0) return(NULL) : argument is of length zero

R语言中应用ieu数据库(IEU OpenGWAS project)进行在线分析,发现报错 “Error in if (nrow(d) == 0) return(NULL) : argument is of length zero” ,应如何解决这一问题?

自2024年5月之后都需要设置 token 才可以继续访问ieu服务器。具体详见:Perform fast queries against a massive database of complete GWAS summary data • ieugwasr

步骤一:登录 https://api.opengwas.io/profile/
步骤二:生成一个新令牌<token> 
步骤三:在R中更新TwoSampleMR包和ieugwasr包,并加载这两个包

#更新TwoSampleMR包和ieugwasr包
devtools::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR")
install.packages("ieugwasr")
#加载R包
library(TwoSampleMR) 
library(ieugwasr)

步骤四:复制粘贴token 

#将获取的token复制在token处
Sys.setenv(OPENGWAS_JWT="token") 

完成以上四步后,即可使用ieu的数据进行分析。再次分析重复以上复制粘贴token即可。

若仍无法使用,可以查看token是否过期。若token过期,则重新在官网申请即可。

#查看token信息
ieugwasr::user()

  • 9
    点赞
  • 7
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值