一个由大型语言模型驱动的端到端自动化学合成开发平台-CSDN博客

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本文介绍了一个基于大型语言模型（LLM）的自动化学合成开发平台——LLM-RDF（LLM-Based Reaction Development Framework）。该平台通过六个专门的LLM代理（包括文献搜索、实验设计、硬件执行、光谱分析、分离指导和结果解读等）实现了化学合成全流程的自动化。研究以铜/TEMPO催化的有氧醇氧化反应为模型反应，展示了从文献搜索到产物纯化的端到端合成开发能力，并在其他三种反应中验证了其通用性。该研究为利用LLM技术实现全自动化学合成开发提供了一种可行路径。

背景介绍

化学合成反应的开发是药物发现和工艺开发中的核心任务之一，通常需要大量时间和成本。传统的合成路线设计依赖于专家化学家和工程师的经验，通过迭代的“设计-制造-测试-分析”循环来确定高效的合成路线。然而，这一过程复杂且难以用算法解决。近年来，机器学习技术在加速合成设计的多个子任务中展现出巨大潜力，但现有的机器学习方法大多只能作为专家使用的单一工具，而完全自动化的端到端合成反应设计和开发仍然是一个未实现的目标。随着大型语言模型（如GPT-4）的出现，其强大的知识储备和灵活的决策能力为实现全自动合成开发提供了新的可能性。

图文解析

图1：LLM-RDF系统概述。图1a：展示了LLM技术在化学合成开发流程中的应用，与现有文献中报道的工作相比，LLM-RDF涵盖了从文献搜索到产物纯化的全流程。图1b：描述了人类化学家与LLM代理之间的交互方式。化学家通过自然语言描述任务，LLM代理则通过预训练的模型完成指定任务。图1c：展示了基于LLM-RDF的Web应用程序界面，化学家可以通过自然语言与自动化实验平台交互，无需编程技能。

图2：LLM代理助力文献搜索和信息提取。图2a：展示了文献搜索和信息提取的工作流程，由Literature Scouter代理完成。图2b：展示了人类化学家与Literature Scouter的交互对话。通过自然语言查询，Literature Scouter从Semantic Scholar数据库中提取相关文献，并推荐了最适合实际应用的方法（Cu/TEMPO催化体系）。图2c：展示了Literature Scouter从文献中提取的实验步骤和设计空间，为后续实验提供了基础。

图3：LLM代理助力底物范围和条件筛选。图3a：展示了底物范围和条件筛选的工作流程，涉及Experiment Designer、Hardware Executor、Spectrum Analyzer和Result Interpreter四个代理。图3b：展示了自然语言描述的高通量筛选（HTS）任务，Experiment Designer将其转化为标准化的实验设计。图3c：展示了Spectrum Analyzer如何自动分析GC-FID-MS数据，识别反应物和产物的色谱峰，并计算产率。图3d-e：展示了Spectrum Analyzer如何通过质谱数据识别反应物和产物的特征碎片信号。图3f：展示了Spectrum Analyzer如何通过FID信号积分计算反应产率。

图4：底物范围和条件筛选结果。图4a-b：展示了单醇和二醇在不同条件下的氧化反应结果。图4c-d：展示了部分底物和产物的结构式。图4e-f：展示了不同铜催化剂和碱组合下的产率热图，Result Interpreter总结了反应规律。

图5：LLM代理助力反应动力学研究。图5a：展示了反应动力学研究的工作流程，涉及Experiment Designer、Hardware Executor、Spectrum Analyzer和Result Interpreter。图5b：展示了不同溶剂对反应选择性的影响。图5c：展示了Experiment Designer设计的采样时间表。图5d：展示了Spectrum Analyzer如何分析1H NMR数据以确定反应物和产物的浓度。图5e：展示了Result Interpreter拟合的动力学模型曲线。

图6：LLM代理助力反应条件优化。图6a：展示了基于LLM代理的自驱动反应条件优化系统。图6b：展示了优化过程中产率的变化趋势。图6c-d：展示了Result Interpreter在不同实验阶段对优化停止的建议。

图7：LLM代理助力反应放大和产物纯化。图7a：展示了反应放大和产物纯化的工作流程。图7b：展示了Experiment Designer提出的放大策略和Separation Instructor优化洗脱液组成的过程。图7c：展示了不同高产率条件的比较。图7d：展示了纯化后目标产物的1H NMR谱图。

图8：LLM-RDF在其他合成任务中的应用。图8a-c：展示了LLM代理在SNAr反应动力学研究中的应用。图8d：展示了SNAr反应的机制。图8e-h：展示了LLM代理在光催化C-C偶联反应条件优化中的应用。图8i-l：展示了LLM代理在异质光电化学反应放大设计中的应用。

总结展望

本文通过构建LLM-RDF平台，展示了大型语言模型在化学合成全流程中的应用潜力。该平台通过六个专门的LLM代理实现了从文献搜索到产物纯化的自动化开发，并在多种反应中验证了其通用性。尽管LLM技术在化学领域的应用仍处于初级阶段，但本研究为未来更深入地利用LLM技术进行化学合成开发提供了一种可行的路径。未来的研究需要进一步提高LLM代理的可靠性、专业知识水平和数学运算能力，以实现更高效的自动化化学研究。

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