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RNA-seq分析
文章平均质量分 83
收集普通转录组数据分析相关笔记
红鲤绿与鱼
一名CAAS在读硕士研究生
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猪_RNA_seq的Clean_data上游分析&下游分析总结
STAR昨天拿到了公司测序的转录组数据,已经进行了数据清洗,可以直接比对基因组,基因组文件和注释文件之前都已经下载过了,可以直接用,参考上篇推文。原创 2024-06-13 19:21:51 · 229 阅读 · 0 评论 -
小鼠RNA_seq数据上游分析学习总结&流程
出现该界面,按回车出现这些内容就按键盘上的 q 键输入yes出现这个界面就按回车键,就会进入安装状态,可能需要一些时间输入yes,安装完成然后退出登录,重新进行登录登录以后再输入命令的地方最前面会多出一个(base),这就说明安装好了如果我们想安装某个软件,可以首先用命令搜索一下这个软件在anaconda中是否存在比如转录组数据处理中经常用的比对软件hisat2conda有些软件安装不上,可能是因为用的命令不对例如,下载bowtie2conda。原创 2024-06-11 21:18:22 · 1169 阅读 · 0 评论 -
猪转录组数据上游&下游分析(关于IMF)——丝滑流程
已发布在这篇推文。原创 2024-07-01 19:10:42 · 333 阅读 · 0 评论 -
小鼠RNA_seq数据下游分析学习总结&流程
R。原创 2024-06-18 18:07:36 · 461 阅读 · 0 评论