Drosophila Activity Monitoring System（DAMS)果蝇行为监测系统数据分析

最新推荐文章于 2024-10-03 09:00:56 发布

猪头2021

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文章标签： python

本文链接：https://blog.csdn.net/m0_61106484/article/details/119830806

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本文介绍了利用Python对Drosophila Activity Monitoring System（DAMS）果蝇行为监测系统产生的大量原始数据进行分析，包括睡眠时间、清醒时间、运动次数和睡眠碎片等关键指标的计算。尽管作者对Python不熟悉，但通过编写代码成功实现了数据处理，并表示未来会持续更新研究进展，欢迎同行交流讨论。

摘要由CSDN通过智能技术生成

果蝇行为监测系统是我在果蝇实验中用到的一个模块，主要用于监测果蝇的运动状态、睡眠昼夜节律等情况。由于没有找到设备原装的分析软件，且原始数据量比较大，excel不太好实现，所以自己写了一些代码用于分析数据。

目前可以分析的指标有果蝇的睡眠时间、清醒时间、总运动次数和睡眠碎片等。

代码我会贴在下方。虽然本人对于python比较生疏，不过最后跑出来结果还是很不错的！以后如果有新进展我也会继续更新在这里。

如果各位同道有更好的想法或者解决方案交流欢迎回帖，谢谢！

f = '%d'
d = pd.DataFrame(df,columns = ['date'],index = [331610]) 
e = pd.DataFrame(df,columns = ['date'],index = [0]) 
f = d.values - e.values
days = f.astype('timedelta64[D]')
for j in range(0,777):    
    deltaday = days - j
    datenow = e + deltaday
    datenow = pd.to_datetime(datenow['date'],format = '%Y-%m-%d')
    datenow = datenow.min()
    testdf = df[(df['date'] == datenow)]
    testdf = tes