多元统计分析基于R——对应分析

文章介绍了对应分析的基本思想和原理,它用于处理变量X和Y不独立的情况,通过中心化和标准化的过渡矩阵进行因子分析。文中提供了一个使用R语言的案例,通过读取数据、卡方检验和corresp函数进行对应分析,并绘制了分析图来初步分类样本。
摘要由CSDN通过智能技术生成

一、对应分析的基本思想

        对应分析和主成分分析和因子分析方法有着密切的联系。对应分析主要适用于变量X和变量Y之间不独立的情形,是从R型因子分析出发直接获得Q型因子分析的结果,从而克服由于样本容量大所带来的困难。具体来说,从原始数据矩阵eq?X_%7Bn*p%7D出发构建过渡矩阵eq?Z_%7Bn*p%7D,在得变量的协方差矩阵eq?S_%7BR%7D和样品的协方差eq?S_%7BQ%7D(其非零特征值相同,其特征根之间存在特定关系)。eq?S_%7BR%7D%2CS_%7BQ%7D特征值是各个公共因子的方差,可用相同的因子轴同时表示变量点和样本点。

二、对应分析的原理

原始数据样本矩阵为     eq?X%3D%28x_%7Bij%7D%29_%7Bn*p%7D 且假设样本矩阵中所有的元素均大于0

样本矩阵行和列分别作和所得         eq?x_%7Bi%5Ccdot%20%7D%3D%5Csum_%7Bj%7D%7Bx_%7Bij%7D%7D%2Cx_%7B%5Ccdot%20j%7D%3D%5Csum_%7Bi%7D%7Bx_%7Bij%7D%7D

某种属性出现的“概率”         x_%7Bi%5Ccdot%7D 称该矩阵为对应矩阵

过渡矩阵eq?Z%3D%28z_%7Bij%7D%29 这由对应矩阵对应变化(中心化和标准化)后而得

最后对过渡矩阵进行因子分析即可

三、对应分析的入门实例

#读入数据################################
case8.1<-read.csv('eg8.1.csv',heading=T)
Z=case8.1[,-1]#第一行为地名等文字信息,不能参与分析
chisq.test(Z)##对样本数据进行卡方检验,若p值小,则可认为不独立,可进行对应分析

#做对应分析,计算行和列的得分##############
library(MASS)
ca1=corresp(Z,nf=2)
ca1

#绘制对应分析图##########################
rownames(ca1$rscore)=case8.1[,1]
biplot(ca1,cex=0.55)#行命名为第一列样本名称
abline(v=0,h=0,lty=3)#作图并分象限

0h5jNjkRFDG9OCTLNUmMZwBwsA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPT5P6J01DUeAbC4AAAAAElFTkSuQmCC0h5jNjkRFDG9OCTLNUmMZwBwsA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPT5P6J01DUeAbC4AAAAAElFTkSuQmCC0h5jNjkRFDG9OCTLNUmMZwBwsA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPTBMtAHy0AfLAN9sAz0wTLQB8tAHywDfbAM9MEy0AfLQB8sA32wDPT5P6J01DUeAbC4AAAAAElFTkSuQmCC5ab036d379c74a8188854ed9272c0dde.png

 

根据图示可以将样本初步分类

 

本篇文章是笔者学习所得,若有不妥谬误之处还望温和批评指正

 

 

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