生物常用软件对HPC硬件的需求

于 2021-11-03 16:03:55 发布
阅读量253 收藏 1
点赞数
文章标签： hpc
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/m0_63832435/article/details/121123447
版权
领域 软件名称 简介 可扩展性 内存 IO 网络 生物信息学-DNA序列比对 BLAST、FASTA 序列相似性搜索软件 定点计算为主，计算任务相对独立，并发效果好 程序消耗内存大 IO要求高 通信较少， 用千兆...
摘要由CSDN通过智能技术生成

领域

软件名称

简介

可扩展性

内存

IO

网络

生物信息学-DNA序列比对

BLAST、FASTA
最低0.47元/天 解锁文章
m0_63832435
关注
  • 0
    点赞
  • 踩
  • 1
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
CAE常用软件对HPC硬件的需求
m0_63832435的博客
11-03 686
软件分类 软件名称 简介 可扩展性 内存 IO 网络 隐式有限元分析（IFEA） ANSYS 通用隐式有限元软件 <16CPU 16CPU时并行效率一般在50%以下 内存需求大 每100万自由度需要1-10GB内存 IO...
生物信息学软件_基因测序，生物信息学分析计算特点及工作站配置探讨202007
weixin_39587029的博客
11-28 476
（一）了解生物信息学生物信息学（Bioinformatics）利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法研究生物学的问题。生物信息学的研究材料和结果就是各种各样的生物学数据，其研究工具是计算机，研究方法包括对生物学数据的搜索（收集和筛选）、处理（编辑、整理、管理和显示）及利用（计算、模拟）。生物信息学典型工作流程这个过程是由一系列链接的步骤组成，这些步骤将原始输入（测序原始数据RAW）转换为有...
使用HPC进行生物医学建模的实际挑战
hdpai2018的博客
06-11 511
精准医学的基本概念是通过了解个体患者特征的影响，可以改善癌症等病理的预防，诊断和治疗。预测医学寻求通过机制模型得出这种理解，该模型描述了特定个体内疾病的原因和（潜在的）进展。这代表了计算生物医学的巨大挑战，因为它需要将高度变化的（并且可能是巨大的）定量实验数据集整合到复杂生物系统的模型中。 越来越清楚的是，这种挑战只能通过使用结合了不同分析的复杂工作流程来解决，而且由于对预测的了解，其设计必须伴随对不确定性的估计。通常，这种工作流程中的每个阶段都具有非常不同的计算要求。如果资助机构和HPC社区认真支持这种做
生物信息学个人电脑系统配置（Ubuntu 20.04）
qq_40966210的博客
03-04 4536
生物信息学个人电脑系统配置（Ubuntu 20.04） 起因: 本人目前研二在读（明年就转博士了），去年配了一台电脑， 准备认真的搞搞深度学习和生物信息领域阶的结合。但是由于一些原因导致我不得不先使用 Windos 系统一段时间。讲实话，大半年的使用让我的体验感很差，因为我没有打游戏也没有别的娱乐。手头上已经有一套 MBP 但是奈何 MAC 不支持 CUDA 导致我只能自己组一台。并且由于种种原因（其中最大的原因就是生信大部分的上游流程都只能在 linux 或者 MAC 系统下跑），虽然尝试过 WSL 但是
一文掌握 conda 安装配置生物信息软件
BioIT爱好者
11-27 2096
2.4 conda 安装配置生物信息软件 2.4.1 conda 安装和配置 ...
Windows下使用GraalVM+Maven+Picocli快速构建Java cli原生命令行工具
HoloLens的博客
11-22 2072
Windows下使用GraalVM+Maven+Picocli快速构建Java cli命令行工具 文章目录Windows下使用GraalVM+Maven+Picocli快速构建Java cli命令行工具前言环境准备安装Visual Studio 2019 Visual C++ Build Tools安装GraalVM Community 20.3.0安装native-image工具创建Maven quickstart项目添加Picocli Maven依赖添加Maven插件增加小工具逻辑编译运行源码总结 前言
基于Microsoft HPC的Magic迭代计算软件的并行化
06-07
首先利用HPC Pack进行集群的搭建，然后设置共享文件夹进行数据的存储与访问，最后使用Microsoft HPC Pack SDK中的API改写Magic迭代计算软件，实现将每代启动的Magic程序放到多台计算机上进行并行计算。通过测试表明...
精品软件工具--HPC平台上常用软件(库)安装工具，持续开发中.zip
02-17
"精品软件工具--HPC平台上常用软件(库)安装工具，持续开发中.zip"这个压缩包似乎是一个集合，旨在简化HPC环境中的软件部署工作。虽然没有具体的标签来进一步细化这些工具的类型，但我们可以基于HPC平台的一般需求来...
buildtest：HPC系统和软件测试框架
02-09
建立测试buildtest是一个HPC测试框架，可帮助设施更有效地编写验收测试。 Buildtest为在编写称为Buildspecs的工具提供了便利的框架，并且buildtest处理如何创建测试脚本并在系统上运行测试。 Buildtest利用来指定...
HPC触摸屏升级软件
12-04
【HPC触摸屏升级软件】是一款专为安徽省中小学班班通项目设计的维护工具，旨在提升教学设备的性能和稳定性，确保教育信息化进程中的顺畅使用。HPC（High Performance Computer）触摸屏通常应用于高端计算环境，如...
HPC资料合集.zip
05-08
HPC领域的一些资料 HPC领域的一些资料 HPC领域的一些资料 HPC领域的一些资料 HPC领域的一些资料 HPC领域的一些资料 HPC领域的一些资料 HPC领域的一些资料 HPC领域的一些资料 HPC领域的...
蛋白对接_RosettaDock4.0 : 蛋白蛋白复合物对接预测
weixin_40001519的博客
01-13 5364
参考1: Protein–Protein Docking with Backbone Flexibility参考2: Conformer Selection and Induced Fit in Flexible Backbone Protein–Protein Docking Using Computational and NMR Ensembles参考3: High-resoluti...
b050闲置图书分享-springboot+vue+elementui.zip（可运行源码+sql文件+文档）
07-23
本次开发的闲置图书分享平台实现了收货地址管理、字典管理、公告管理、留言板管理、图书管理、图书收藏管理、图书评价管理、图书订单管理、用户管理、管理员管理等功能。系统用到了关系型数据库中王者MySql作为系统的数据库，有效的对数据进行安全的存储，有效的备份，对数据可靠性方面得到了保证。并且程序也具备程序需求的所有功能，使得操作性还是安全性都大大提高，让闲置图书分享平台更能从理念走到现实，确确实实的让人们提升信息处理效率。 管理图书的数据，此页面主要实现图书的增加、修改、删除、查看的功能。公告信息管理页面提供的功能操作有：新增公告，修改公告，删除公告操作。公告类型管理页面显示所有公告类型，在此页面既可以让管理员添加新的公告信息类型，也能对已有的公告类型信息执行编辑更新，失效的公告类型信息也能让管理员快速删除。
《大学生职业生涯规划与就业指导》大一阶段课程作业
最新发布
07-24
《大学生职业生涯规划与就业指导》大一阶段课程作业
开题报告潮汕特产直销系统 已通过开题答辩的.doc
07-23
随着互联网的高速发展，人们的生活方式发生了翻天覆地的变化，在过去，人们想要购买很远地方的东西会非常麻烦，因为是通信和交通都不是十分的方便，而现在网络购物成为了人们日常生活中不可或缺的一部分。在这样的背景下，互联网与传统行业的融合已经成为了一种不可阻挡的趋势。对于中国特色的潮汕特产来说，这一趋势也带来了巨大的变革和发展机遇[1]。
Python性能优化：掌握性能分析工具的实战指南
07-23
Python是一种广泛使用的高级编程语言，由Guido van Rossum于1989年底发明，第一个公开发行版发行于1991年。Python的设计哲学强调代码的可读性和简洁的语法（尤其是使用空格缩进来区分代码块，而不是使用大括号或关键词）。这使得Python被认为是一种易于学习的语言，同时具备强大的功能，适合初学者和经验丰富的程序员。 Python的主要特点包括： 1. **易于学习**：Python有相对较少的关键字，结构简单，和一个明确定义的语法。 2. **易于阅读**：Python代码定义的清晰度使得它像可执行伪代码。 3. **易于维护**：Python的成功在于它的源代码是相当容易维护的。 4. **广泛的标准库**：Python的标凑库很庞大，包含用于互联网通信、网络通信、数据压缩、加密、系统管理等的模块。 5. **跨平台**：Python可以在多种操作系统上运行，包括但不限于Windows、Mac OS X、Linux等。 6. **解释型语言**：Python是一种解释型语言，这意味着开发过程中没有编译步骤。 7. **动态类型系统**：Python不会在编写
Android学习系列之gradle实战
07-23
Android学习系列之gradle实战
RFC 3261中文版技术文档
07-23
**标题与描述解析** 标题"RFC 3261 中文文档"指的是互联网请求评论（Request for Comments）3261的中文版本。RFC 3261是互联网工程任务组（IETF）发布的一个重要标准，它定义了SIP（Session Initiation Protocol，会话初始协议）的核心规范。SIP是一种用于建立、修改和终止多媒体通信会话的协议，广泛应用于VoIP（Voice over IP，IP语音）和统一通信系统中。 描述同样简洁明了，只强调了这是RFC 3261的中文翻译，意味着对于中文读者来说，这个文档提供了一个理解SIP协议的中文语言资源。 **标签解析** "RFC3261 中文"标签进一步确认了文档的内容，表明这是关于RFC 3261的中文资料，便于搜索和分类。 **压缩包子文件的文件名称列表** 文件名为"RFC3261 中文.mht"，这是一个单一网页文件，通常包含HTML、图像和其他资源，用于保存完整的网页内容。用户可以通过打开这个文件来查看RFC 3261的中文翻译。 **SIP协议详述** SIP协议是基于文本的，其设计类似于HTTP
"HPC LSF 用户指南：基本概念、常用命令、使用方法
以上是对HPC LSF的一些基本介绍和常用命令的简要说明，希望可以帮助用户更好地使用这一高性能计算作业管理软件。 总的来说，HPC LSF用户使用指南介绍了IBM Spectrum LSF Version 10 Release 1.0的基本概念、常用...
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值