生物信息学个人电脑系统配置（Ubuntu 20.04）

生物信息学个人电脑系统配置（Ubuntu 20.04）

起因:

本人目前研二在读（明年就转博士了），去年配了一台电脑， 准备认真的搞搞深度学习和生物信息领域阶的结合。但是由于一些原因导致我不得不先使用 Windos 系统一段时间。讲实话，大半年的使用让我的体验感很差，因为我没有打游戏也没有别的娱乐。手头上已经有一套 MBP 但是奈何 MAC 不支持 CUDA 导致我只能自己组一台。并且由于种种原因（其中最大的原因就是生信大部分的上游流程都只能在 linux 或者 MAC 系统下跑），虽然尝试过 WSL 但是真的很难受，于是昨天晚上彻底决定。将电脑重新安装Ubuntu做为工作机。

前前后后配置了大约有 3 个小时左右，现在作为记录以便下一次安装提速

准备工作:

首先需要准备一个大约 16G 的u盘

然后下载如下两个文件

• 启动盘制作软件

根据不同时期的版本选择,下载最粗的那个

• ubuntu20.04

Ubuntu 选择下载桌面版的

制作启动盘:

插入 U 盘（尽可能的插在主板上而不是机箱上），打开 Rufus 软件，软件会自动识别硬盘，然后选择下载好的 iso 文件写入即可，如图

注意备份好数据

Ubuntu 系统安装:

然后关机电脑，一直按 F12，直到进入选择启动盘界面，如下：

根据自己的 U 盘名称选择启动盘（我实际上选的是 UEFI 金士顿的，鼠标的位置不是实际的选择）

然后就会跳转到安装界面，使用默认的一直点击就可以，如果需要清除磁盘的话那边有中文提示，很简单就不放图了

安装结束后，记得有提示拔掉 U 盘后在按回车，切记不要按的太快！！！！

配置:

基础驱动配置，打开终端

# 配置 3090 显卡驱动
sudo add-apt-repository ppa:graphics-drivers/ppa

sudo apt update
sudo ubuntu-drivers autoinstall

# 然后关机重启

# 因为我的是 27 寸的显示器,所以分辨率会导致字很小,可是系统自带的只能整数倍放大,因此也要进行调整
# 运行下面两句代码,在设置窗口就会出现 focus 按钮,这时候就可以放大 150%
gsettings set org.gnome.mutter experimental-features "['scale-monitor-framebuffer']"
gsettings set org.gnome.mutter experimental-features "['x11-randr-fractional-scaling']"

# https://www.omgubuntu.co.uk/2019/06/enable-fractional-scaling-ubuntu-19-04

然后其他配置

• 安装 Anaconda3

  这个实在过于简单，进入官网后，选择最新版本的，最大的然后复制下载链接，wget 下载后 zsh 编译即可

• 安装 pytorch

  切记不要使用 conda 安装,选择 pip

• 配置中文输入法

• 安装 R 语言

• 安装 ZSH 编译器

  这里稍微注意一下，不要安装太多没用的插件，到时候会很卡，仅建议安装高亮和语法提示

• jupyter 添加 R 内核 这里一定要注意如下几个细节

  安装包的时候要使用 R app 安装而不是直接在终端输入 R

  IRkernel::installspec(user = FALSE) 这时候不能用 R app 装，得用终端打开

• 配置 Q2ray

安装微信

下载优麒麟

http://archive.ubuntukylin.com/software/pool/partner/ 根据网站查询最新版本软件

# 下载wine
wget -c http://archive.ubuntukylin.com/software/pool/partner/ukylin-wine_70.6.3.25_amd64.deb

# 下载微信
wget -c http://archive.ubuntukylin.com/software/pool/partner/ukylin-wechat_3.0.0_amd64.deb

chmod +x ukylin-wechat_3.0.0_amd64.deb
chmod +x ukylin-wine_70.6.3.25_amd64.deb

# 修改微信分辨率
WINEPREFIX=~/.ukylin-wine/wechat /usr/bin/ukylin-wine winecfg

调整网易云分辨率

sudo vim /opt/netease/netease-cloud-music/netease-cloud-music.bash

# 对文件作如下修改
#!/bin/sh
HERE="$(dirname "$(readlink -f "${0}")")"
export QT_SCALE_FACTOR=2
export LD_LIBRARY_PATH="${HERE}"/libs
export QT_PLUGIN_PATH="${HERE}"/plugins
export QT_QPA_PLATFORM_PLUGIN_PATH="${HERE}"/plugins/platforms
exec "${HERE}"/netease-cloud-music $@

配置共享文件夹

sudo apt-get install samba

sudo useradd username

sudo smbpasswd -a username