Singularity容器安装与使用

Singularity容器技术

docker的缺点:

资源限制问题:Slurm利用cgroups实现资源分配，Docker通过ocker daemon无法实现。

权限问题:Docker daemon使用 root用户启动，HPC场录期望使用普通用户运行容器。
singuiarily主要是适合HPC中的普通用户，因其完全兼容docker，并且具有很好权限隔离，非常适合普通用户使用。docker因大多时候需变管理员的权眼，且普通用户进行数据卷的挂载时，容易导致其他不可访问的日录也被容器内访问，安全性较差。因此对于HPC的普通用户，建议使用singularity运行容器。

1、Singularity安装
step1:安装基础依赖包

apt-get install -y build-essential libssl-dev glib-2.0 libglib2.0-dev libfuse3-dev libfuse-dev uuid-dev libgpgme11-dev squashfs-tools libseccomp-dev wget pkg-config git cryptsetup

step2:安装go

export VERSION=1.20.4 OS=linux ARCH=amd64                        # 设置具体的环境变量
wget https://dl.google.com/go/go$VERSION.$OS-$ARCH.tar.gz      # 下载GO的安装包
tar -C /opt/software -xzvf go$VERSION.$OS-$ARCH.tar.gz    # 解压GO文件
rm go$VERSION.$OS-$ARCH.tar.gz                                 # 删除安装包
export PATH