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原创 rna-seq分析—py+linux
太久不用了啥都忘了 一步步走..1.重新下载ubuntu就花了好久....2.下好了以后关联python3命令到python3.9.6(习惯)3.下载4.建库5.文件位置/mnt/e/转录组全部原始数据/DZOE2024011942-b1#双端文件比对mapping到参考基因组排序。
2024-03-21 09:22:23 185
原创 WIN下配置Annaconda的下载路径
并且生产配置文件C:\Users\用户\.condarc 文件 用于管理。在虚拟环境下使用pip install也会下载包到虚拟环境下。虚拟环境也在annaconda/env内进行存储。在环境内使用pip命令发现下载的路径去了C盘。创建虚拟环境的存储路径也不正确。使用create激活环境之后。使用conda info查看。
2023-04-02 01:29:38 417
原创 win安装miniconda
找到用户目录下的.condarc文件(C:\Users\“username”)conda默认的包与虚拟环境设置。之后运行配置文件(带镜像)2.安装后加入到环境变量。conda创建虚拟环境。
2023-03-30 16:54:33 209
原创 python 基于opencv实现玉米籽粒计数
有效避免籽粒摆放紧密而导致识别不准确的问题背景采用黑色卡纸(不反光即可)称重后可以进行百粒重计算import timeimport cv2,osimport numpy as npdef myfunc(img): # img = cv2.imread(t_) font = cv2.FONT_HERSHEY_COMPLEX kernel = np.ones((5,5), np.uint8) h,w,c = img.shape im.
2022-05-29 18:45:18 2040
原创 今天的py文件打包报错
解决问题的时候首先是pip不能用了去设置里依次点击了Modify和repair得到修复使用 pyinstaller -F gg.py 时显示upx不可用 重装了 pyinstaller没用去官网Release UPX 3.96 · upx/upx · GitHub下载了upx并保存在pyinstaller的路径下发现绝对路径打包报错了66 INFO: PyInstaller: 5.166 INFO: Python: 3.9.677 INFO: Platform: Wi
2022-05-26 20:03:43 296
原创 opencv 学习 图像形态学处理
import cv2#默认bgrimport matplotlib.pyplot as pltimport numpy as np"""ret,dst = cv2.threshold(src,thresh,maxcal,type)四个参数:src:原始的图像, threshold:实际值-如127,maxcal:255(最大值),type:处理的功能和方法cv2.THRESH_BINARY——二值法 大于某个阈值取一个值 小于阈值取某一个值cv2.THRESH_BINARY_INV)——.
2022-05-21 12:27:51 255
原创 opencv学习 图像基本操作
导入模块和cv_show() 通用功能import cv2#默认bgrimport matplotlib.pyplot as pltimport numpy#plt.show()#test图片way = 'C:\\Users\\ZKY\\Desktop\\images\\'img = cv2.imread(way+'1.jpg')#def cv_show(image): cv2.imshow('',image) cv2.waitKey(0)打开一张图片:
2022-05-19 18:40:01 360
原创 生信 使用SRA Toolkit下载SSR数据
https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/srasoftware --download 下载了NCBI SRA Toolkit解压后得到2进制的exe工具包快捷键win+R,sysdm.cpl,打开配置path,环境变量,系统变量-path,新建,把存放sratoolkit的路径复制黏贴加上在powershell中cd D:\sratoolkit.3.0.0-win64\bin到路径到工具包路径数据下载1.从ncbi的s
2022-05-08 19:58:29 639
原创 爬虫实践 官网博导导师资料...
import requests#一个数据请求模块import reimport parselimport osclass PA:#具体页面的内容 def __init__(self): pass def xieru(self, url): response = requests.get(url) response.encoding = "utf-8" Name = re.findall(r' <span.
2022-05-07 13:39:32 103
原创 pdf文献的错误格式 文献引用和文前的数字序列去除
学python以来第一次做的小脚本 用于把pdf文献的错误格式 文献引用和文前的数字序列去掉这个怎么上传pyside2的ui文件呀 想一起记录下来来着...import reimport numpyfrom PySide2.QtWidgets import QApplicationfrom PySide2.QtUiTools import QUiLoaderimport pyperclip #实现复制文本到剪贴板import sysclass A:#清除空白行 de...
2022-05-05 17:57:06 863
空空如也
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