【复杂网络分析-gephi导入数据与可视化】

前言

        本文讲解了使用gephi软件导入网络数据并进行可视化，Gephi是一款开源的网络可视化软件，可以帮助用户导入网络数据并进行可视化分析。

一、准备CSV格式的节点和边文件

        gephi支持多种格式的文件导入，这里以CSV文件格式为例子，进行导入CSV格式的节点和边文件，这里要求边文件必须包含源节点和目标节点，节点文件必须包含一个唯一标识节点的ID列。

        这里我以专利实体共引数据进行展示，在专利实体共引中，每个节点表示一个专利文件，节点之间的边通过实体共引关系构建，其中边文件结构如下，source列表示源节点,target表示目标节点，sim_score是相似度得分,inter_count和union_count是边附属数据。

        注意:gephi要求边文件必须包含source,target列，否则无法识别边数据文件。节点需要包含id列。

        其中，节点文件结构如下,其中id列和上述的边文件的source,target列对应，其他的列为节点的属性。

二、使用gephi导入上述边和节点文件

1.打开gephi软件，新建项目

        打开gephi软件，点击File->New Project创建项目，进入到gephi的工作主页面。

2.导入边数据

        创建完成项目之后，选择Data Laboratory进行数据导入，选择Import Spreadsheet导入Excel/CSV格式的网络文件(node或者edge文件),        

        下面是导入边文件数据，Import AS应该选择为Edge table，表示将当前导入文件视为边数据文件。

、        点击Next之后，然后是设置数据格式，这里自行根据对应的数据类型设置即可。

        接着点击Finish完成边文件导入，然后配置图的相关数据，Graph Type用来配置图是否为有向图或者无向图。

        最后完成边的导入，此时的节点属性还没有导入进去，下一步需要进行节点数据的导入。

3.节点文件数据导入

        和导入边文件一样，此时Import As选择Nodes table，表示将导入的CSV文件识别为节点数据。

        接下是选设置图属性，这里需要设置Append to existing workspace，否则导入节点数据的时候会将之前的边数据覆盖。

4.进行数据可视化

点击Overview即可进入可视化界面，在左边属性栏可以自定义节点颜色。

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总结

        本文讲解了使用gephi软件导入网络数据并进行可视化，Gephi是一款开源的网络可视化软件，可以帮助用户导入网络数据并进行可视化分析。