Datawhale-AI夏令营深度学习（药物药效预测）

集成学习是一种机器学习范式，通过结合多个模型来改善预测性能，通常比单个模型的表现更优。在你的项目中，可以采用以下几种常见的集成学习方法：

1. Bagging（自助聚合）：通过在原始数据集上进行多次重采样来创建多个子集，分别训练多个模型，最后进行平均或多数投票决策。

2. Boosting：训练多个模型，每个模型都尝试纠正前一个模型的错误，通常是序列处理。

3. Stacking：训练多个不同的模型，然后再训练一个新的模型来综合这些模型的输出。

3. 混合学习

在解决复杂的生物信息学问题，如siRNA效果的预测中，机器学习与深度学习的混合方法可以提供强大的工具。这种混合方法可以结合深度学习的特征学习能力和传统机器学习模型的效率与解释性。以下是一种结合机器学习和深度学习的策略，包括两个主要部分：一个用于特征提取的深度学习模型（如卷积神经网络），以及一个传统的机器学习模型（如LightGBM）来进行最终的决策。这里提供一个示例，展示如何使用PyTorch构建深度学习部分，然后将输出特征传递给LightGBM进行分类或回归。

其他思路

• 外部数据集： 集成额外的生物信息学数据库来丰富特征，这可能有助于提高模型的泛化能力。（比赛可以使用，但是需要说明出处）

• 特征选择：实施自动化的特征选择流程，以剔除不重要的特征，减少模型的复杂性并避免过拟合。

• 动态学习率调整：除了基于性能衰退调整学习率外，还可以尝试使用学习率预热（warm-up）和循环学习率等策略，这可能有助于改进模型收敛速度和质量。

• 多目标优化：考虑将多个评价指标整合到模型的优化过程中，如同时优化MAE和F1，或者设计一个更全面的评价函数，以更好地反映siRNA的实验效果。