基于R语言的Meta分析【全流程、不确定性分析】方法与Meta机器学习技术应用

Meta分析是针对某一科研问题,根据明确的搜索策略、选择筛选文献标准、采用严格的评价方法,对来源不同的研究成果进行收集、合并及定量统计分析的方法,最早出现于“循证医学”,现已广泛应用于农林生态,资源环境等方面。R语言拥有完整有效的数据处理、统计分析与保存机制,可以对数据直接进行分析和显示,命令格式简单、结果可读性强,包含众多针对Meta分析软件包,是进行Meta整合分析及评价的有效平台。本教程针对Meta分析原理、公式、操作步骤及结果分析,进阶应用进行详细解析,结合多个例子,熟练掌握Meta分析全流程和不确定性分析,并结合机器学习等方法讲解Meta分析在文献大数据的延伸应用

【学习教程】基于R语言的Meta分析【全流程、不确定性分析】方法与Meta机器学习技术应用 (qq.com)

一、

Meta分析的选题与检索

1 Meta分析的选题与文献检索

  1. 什么是Meta分析
  2. Meta分析的选题策略
  3. 文献检索数据库
  4. 精确检索策略,如何检索全、检索准
  5. 文献的管理与清洗,如何制定文献纳入排除标准
  6. 文献数据获取技巧
  7. 文献计量分析CiteSpace及研究热点分析 

 

二、

Meta分析与R语言基础

2 Meta分析的常用软件与R语言基础

  1. R语言做Meta分析的优势及其《Nature》、《Science》经典案例应用
  2. R语言基本操作
  3. R语言数据清洗方法
  4. R语言Meta分析常用包及相关插件介绍与安装

自编程计算到调用Meta包meta、metafor、dmetar、esc、metasens、metamisc、meta4diaggemtcrobvisnetmetabrms等),全程分析如何进行meta计算、meta诊断、贝叶斯meta、网状meta、亚组分析、meta回归及作图

三、

R语言Meta分析与作图

3 R语言Meta分析

  1. R语言Meta分析的流程
  2. 各类meta效应值和累计效应值计算

连续资料的RR、MD与SMD

分类资料的RR和OR

  1. Meta亚组分析
  2. R语言图形可视化基础
  3. 如何用ggplot2绘制漂亮的森林图

四、

R语言Meta回归分析

4 R语言Meta回归分析

  1. Meta回归统计分析理论及应用
  2. Meta回归和普通回归分析的异同
  3. 固定效应与随机效应分析
  4. 泡泡图(bubble)的绘制

五、

R语言Meta诊断分析

5 R语言Meta诊断进阶

  1. Meta诊断分析(t2、I2、H2、Q等统计量)
  2. 异质性检验
  3. 敏感性分析
  4. 偏倚分析
  5. 风险分析

 

六、

R语言Meta分析的不确定性

6 R语言Meta分析的不确定性

  1. 网状Meta分析
  2. 贝叶斯理论
  3. R语言贝叶斯工具StanJAGSbrms
  4. 贝叶斯Meta分析及不确定性分析

七、

机器学习在Meta分析中的应用

7 机器学习在Meta分析中的应用

  1. 机器学习基础以及Meta机器学习的优势
  2. Meta加权随机森林(MetaForest)的使用
  3. 使用Meta机器学习对文献中的大数据进行整合
  4. 使用机器学习进行驱动因子分析

 CENTURY模型应用 (qq.com)

 

   CENTURY模型,主要基于过程的陆地生态系统生物地球化学循环模型。主要用于模拟不同土壤-植被系统间C、N、P和S的长期动态。根据土壤有机质的分解速率,CENTURY模型将土壤总有机碳(TOC)分成了三个碳库,即活性、慢性和惰性有机碳库。

  通过详细的讲解,让学员熟练掌握CENTURY的模型应用,通过完整的案例分析,加深学员在实际项目中的理解应用。由于“碳中和”备受关注,案例的选择上,重点在内容上围绕碳方面展开,更符合大家的研究热点的需求。

CENTURY 模型介绍与 安装
1.1 关系模型的构建与应
1.2 CENTURY 模型原理
1.3 CENTURY 模型的结
1.4 模型的安装及注意事
1.1 讲解关系模型的特点、优势、构建过程、以
及应用时的注意事项;
1.2 讲解 CENTURY 模型的开发及原理;
1.3 详细讲解 CENTURY 模型各个模块的结构,
并根据结构解释内涵。
1.4 下载并安装 CENTURY 模型软件,进入安装
目录;
CENTURY 模 型 文 件 系 统及运行
2.1 模型的文件系统
2.2 模型的运行
2.3 实践演练
2.1 详细讲解 CENTURY 模型安装目录下的文件 系统;
2.2 进入模型操作界面,熟悉操作命令,运行模 型;
2.3 设定特定生态系统的土地变化历史,使用 CENTURY 模型进行模拟实践。
CENTURY 模 型 的 参 数 系统
3.1 输入数据
3.2 参数设定
3.3 输出数据
3.4 情景演练
3.1 对模型的输入数据进行详细讲解,掌握如何 按照要求的格式准备输入数据;
3.2 讲解如何根据待模拟生态系统的土地利用和 管理历史,设定参数,进行模拟;
3.3 详细讲解模型的输出数据,并掌握输出结果 提取方法
3.4 依据不同土地利用情景,调整参数,进行模 拟实践。
CENTURY 模 型 应 用 实
4.1 Switchgrass 生物量的 模拟
4.2 柠条灌木林生产力的 模拟
4.3 CENTURY 模型应用 实践——以柠条灌木林生 产力模拟为例
4.1 讲解相关文献中对 Switchgrass 生物量的模拟 过程;
4.2 讲解文献中对柠条生产力的模拟过程;
4.3 熟悉 CENTURY 模型使用的全过程,包括数
据整理、模型校正验证、模型预测:通过使用柠
条生物量的数据,通过参数校正和验证,获得适
合模拟柠条生产力的参数系统,并对柠条的生长
进行预测。

 

 

 

 

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