细胞凋亡的流式检测?实验步骤+结果解读,速戳! | MCE

凋亡如何测?流式图看不懂?简简单单教你读懂凋亡流式图!!!!做个流式小能手~~

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什么是凋亡?

细胞凋亡 (Apoptosis),或者说是程序性细胞死亡,是细胞遵循自身基因指令进行的一种有条不紊的自我毁灭过程。这个过程在生物体的正常发育和维持健康状态中扮演着重要角色,并且在一些疾病状态下也会发生[1]。

细胞凋亡会产生什么样的变化呢?

早期阶段,你会看到细胞开始皱缩变小,细胞核会破裂成碎片,同时细胞表面会出现一些泡泡状的小突起,最终这些突起会分离出来,形成含有细胞内部物质的小包,我们称之为“凋亡小体”。有趣的是,尽管细胞正在分解,但它的外层膜仍然保持完整,确保了细胞内容物不会随意泄漏出去。

图 1. 细胞凋亡过程。

除此之外,细胞内部还会发生一系列化学反应,例如激活特定的酶 (Caspase),这些酶会进一步切割其他蛋白质,像 PARP 这样的底物。还有,线粒体中的细胞色素 c 会被释放到细胞质中,DNA 会被切割成小片段。细胞膜也会发生变化,比如位于膜内侧的磷脂酰丝氨酸 (PS) 会翻转到外侧,同时线粒体膜电位也会改变。最后,调控细胞生死命运的蛋白家族成员,如 BaxBidBcl-2 等,它们的表达量也会有所调整,以促进或抑制细胞凋亡的过程[1][2][3]。

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如何检测凋亡呢?

那怎么检测细胞凋亡呢?我们在这介绍了两种流式检测方法,如果你感兴趣的话让我们一起看下去吧~

首先,最常用的细胞凋亡检测方法是 Annexin V/PI 双染法。

Annexin V 是一种依赖钙离子的蛋白质,能特异性地绑定到细胞膜上的磷脂酰丝氨酸 (PS)。在健康细胞中,PS 位于细胞膜内侧;而在凋亡早期,PS 会移到外侧。因此,用荧光标记 (如 FITC) 的 Annexin V 可以检测到这个变化,表明细胞开始凋亡。

PI (碘化丙啶) 是一种红色荧光染料,它不能进入活细胞或早期凋亡细胞,但可以进入已经死亡或晚期凋亡细胞,因为这些细胞的膜已经破损。

所以,通过 Annexin V 和 PI 的结合使用,我们可以区分早期凋亡、晚期凋亡和坏死的细胞。这种方法可以通过流式细胞仪或荧光显微镜轻松完成检测。

其次,我们还可以检测线粒体跨膜电位 (∆ΨM),在具有较高 ∆ΨM 的健康细胞中,JC-1 染料可进入细胞并在线粒体中积累,形成 J-aggregates 发出橙红色荧光。在凋亡细胞中,∆ΨM 较低,JC-1 染料进入线粒体较少,以单体形式存在发出绿色荧光。

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案例: Annexin V/PI 法检测

接下来,让我们一起来看看 Annexin V/PI 法检测实战吧!

案例一

为了探究敲低 MUC16 对鼻咽癌细胞系 C666-1 和 HK-1 的糖酵解以及免疫逃逸能力的影响,作者利用Annexin V-FITC/PI 凋亡检测试剂盒 (HY-K1073) 评估了鼻咽癌细胞在不同处理条件下的凋亡情况[4]。

图 2. 流式细胞术显示 C666-1 和 HK-1 细胞中 MUC-16 的缺失诱导了细胞凋亡[4]。

a. 活细胞中,不可检测到 Annexin V-FITC/PI 的荧光。因为活细胞的细胞膜完整,不结合 Annexin V-FITC,PI 也无法穿过细胞膜进入细胞,不发光。

b. 早期凋亡细胞中,可以检测到 Annexin V-FITC 的荧光,但不可检测到 PI 的荧光。因为细胞膜磷脂酰丝氨酸 (PS) 外翻,Annexin V 可以结合,但细胞膜完整,PI 无法穿过细胞膜进入细胞,显示出绿色荧光。

c. 晚期凋亡细胞中,均可以检测到 Annexin V-FITC/PI 的荧光。因为细胞膜的完整性被破坏,Annexin V-FITC/PI 都可以进入细胞,显示出绿色和红色荧光。

d. 流式图的纵坐标是 PI,在左上 (Q1-UL) 区域,发出红色荧光,红色荧光越强,表示细胞死亡越严重。流式图的横坐标是 Annexin V-FITC,在右下 (Q1-LR) 区域发出绿色荧光,绿色荧光越强,表示早期凋亡细胞越多。左下 (Q1-LL) 是正常细胞,不发光。右上 (Q1-UR) 是晚期凋亡细胞和坏死细胞,发出绿色和红色两种荧光。

案例二

为了评估不同浓度的 1,25(OH)2D3 对头肾巨噬细胞 (HKMs) 细胞活力的影响,作者利用 Annexin V-iFluor 488/PI (HY-K1080) 检测细胞凋亡[5]。

图 3. 流式细胞术检测 1,25-(OH)2D3 对 HKMs 细胞凋亡的影响[5]。

a. 1,25(OH)2D3 未处理组活细胞百分比为 24.8%。

b. 1 nM 处理组肝细胞百分比为 36.1%。

c. 10 nM 处理组活细胞百分比为 56.3%。

d. 100 nM 处理组活细胞百分比为 40.8%。

e. 流式图的横坐标是 FL1-H (FITC-H) 代表 Annexin V-iFluor 488 的荧光强度。Annexin V-iFluor 488 用于检测早期凋亡细胞。流式图纵坐标是 SSC-H (SSC-H) 代表侧向散射光强度,用于检测细胞的颗粒性和细胞内结构的复杂性,侧向散射光强度通常与细胞内颗粒物的大小和数量有关。

f. 低侧向散射 (SSC-H) 和低 Annexin V-iFluor 488 荧光强度 (FL1-H)。通常代表活细胞。高侧向散射 (SSC-H) 和高 Annexin V-iFluor 488 荧光强度 (FL1-H)。通常代表细胞凋亡晚期或坏死细胞。高侧向散射 (SSC-H) 和低 Annexin V-iFluor 488 荧光强度 (FL1-H)。通常代表细胞凋亡早期。低侧向散射 (SSC-H) 和高 Annexin V-iFluor 488 荧光强度 (FL1-H)。通常代表细胞凋亡早期。

Annexin V/PI 法检测实验步骤和注意事项

(以 HY-K1073 为例)

1. 细胞与 Annexin V-FITC 和 PI 孵育

1.1 收集细胞:收集 1-5 × 105 个细胞。

  • 悬浮细胞:1000 g 离心 5 min,弃去上清。加入 1 mL 预冷的 PBS 轻轻重悬细胞沉淀,1000 g 离心 5 min,弃去上清,保留细胞沉淀。
  • 贴壁细胞:小心吸取细胞培养液保存备用。加入 PBS 洗涤后,加入适量胰酶消化液 (尽量不含 EDTA,以免影响 Annexin V 和 PS 的结合) 消化细胞。加入前面收集的培养液,轻轻吹打细胞,制成单细胞悬液,1000 g 离心 5 min,弃去上清。加入 1 mL 预冷的 PBS 轻轻重悬细胞沉淀,1000 g 离心 5 min,弃去上清,保留细胞沉淀。注:建议胰酶消化液不含 EDTA。

2. 加入 195 μL Binding Buffer,轻轻重悬细胞。

3. 加入 5 μL Annexin V-FITC,轻轻混匀。

4. 加入 10 μL PI Stain,轻轻混匀。

5. 室温下避光孵育 10-20 min。

注:孵育过程中可轻轻颠倒数次以加强染色效果。

6. 流式细胞仪检测:用流式细胞仪检测荧光强度。

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注意事项

a. 流式检测时,Annexin V-FITC 最大激发波长为 488 nm,最大发射波长为 525 nm,在 FL1 通道检测;PI-DNA 最大激发波长为 535 nm,最大发射波长为 617 nm,在 FL2 或FL3 通道检测。

b. 建议设置三组对照:未染色组、PI 单染组及 Annexin V-FITC 单染组。

c. 所有操作应尽量快速,避免细胞长时间暴露于非生理条件下。

d. 染色后的样本需尽快分析,以防止染料信号减弱影响结果准确性。

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案例:

JC-1 法检测线粒体跨膜电位

那么 JC-1 法检测线粒体跨膜电位是怎么做的呢?一个案例带你读懂 JC-1 法!

文献中为了检测人参皂苷 Rd 在高糖条件下对细胞状态的影响,利用 JC-1 (HY-15534) 检测线粒体膜电位变化[6]。

图 4. 流式细胞术显示人参皂苷 Rd 和 NAC 对高糖诱导的线粒体功能障碍具有保护作用[6]。

a. 高糖处理 (HG) 导致线粒体膜电位下降,表现为绿色荧光增加。

b. 人参皂苷 Rd 和 NAC 均能部分或完全恢复高糖处理导致的线粒体膜电位下降,表现为绿色荧光减少,红色荧光增加。

c. 人参皂苷 Rd 的效果随着浓度的增加而增强。

实验步骤与注意事项

一、JC-1 染色液的配制

  • 制备储存液

用 DMSO 配制 5 mg/mL 的 JC-1。如用 1 mL DMSO 溶解 5 mg JC-1。

注意:1) JC-1 储存液建议分装后于 -20℃ 或 -80℃ 避光保存。

  • 工作液的配制

用预热好的无血清细胞培养基或 PBS 稀释储存液,配制成 1-20 μg/mL 的 JC-1 工作。

注意:

1) 请根据实际情况调整 JC-1 工作液浓度,且现用现配。

2) 如果 JC-1 进入细胞的效果不好,可向工作也液中加入适量 20% Pluronic F127 溶液,终浓度为 0.02-0.05%,Pluronic F127 可以防止 JC-1 在缓冲液中聚合并帮助其进入细胞。

二、JC-1 染色

1. 以 6 孔板为例进行细胞铺板,密度为 5×105 cells/mL。37℃,5% CO2 培养箱培养过夜。

注意:进行凋亡诱导时的细胞密度建议不超过 1×106/mL,也可根据自己的细胞类型培养至合适的密度。

2. 取 0.5 mL 细胞悬液至无菌的离心管内。

3. 400 g 离心 3-5 min;弃上清。

4. 用 1 mL JC-1 工作液重悬细胞,于 37℃,5% CO2 培养箱孵育 15-30 min。

5. 室温条件 400 g 离心 5 min;吸掉上清。

6. 用 2 mL 细胞培养液或者缓冲液重悬细胞,之后室温条件 400 g 离心 5 min;弃上清,重复两次。

7. 用 1 mL 新鲜培养液或者缓冲液重悬细胞,立刻进行后续的流式分析或荧光显微镜观察。

8. 数据分析 (流式细胞仪):含有红色 JC-1 聚集物的健康细胞线粒体用 FL2 通道检测;含有绿色 JC-1 单体的凋亡或不健康细胞用 FL1 (FITC) 通道检测。

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小结

用流式细胞术检测细胞凋亡,你学会了吗?如果你觉得这篇干货满满的凋亡检测方法有帮助,记得动动小手点赞收藏哦!!!我们下期见,为大家带来更多的科研小干货~

萌家细胞凋亡相关产品推荐

[1] Susan Elmore, et al. Apoptosis: a review of programmed cell death. Toxicol Pathol. 2007 Jun;35(4):495-516.

[2] Rebecca C Taylor, et al. Apoptosis: controlled demolition at the cellular level. Nat Rev Mol Cell Biol. 2008 Mar;9(3):231-41.

[3] Anna Chmurska, et al. Two Faces of Autophagy in the Struggle against Cancer. Int J Mol Sci. 2021 Mar 15;22(6):2981.

[4] Yueyang Liu, et al. Hypomethylation-associated ELF3 helps nasopharyngeal carcinoma to escape immune surveillance via MUC16-mediated glycolytic metabolic reprogramming. Am J Physiol Cell Physiol. 2024 Sep 2;327(4):C1125–C1142.

[5] Fengxia Zhao, et al. Oral administration of high-dose vitamin D3 can effectively suppress Nocardia seriolae infection in largemouth bass (Micropterus salmoides). Aquaculture. Volume 595, Part 2, 30 January 2025, 741643.

[6] Kai Tang, et al. Ginsenoside Rd ameliorates high glucose-induced retinal endothelial injury through AMPK-STRT1 interdependence. Pharmacol Res. 2022 May:179:106123.

<think>我们正在分析用户关于dmesg输出中'mce'相关日志的问题,特别是"core: using 10 mce banks"的含义。首先,我们需要明确MCE(Machine Check Exception)是什么,以及它在系统中的作用。 MCE是硬件(主要是CPU)检测到严重错误(如硬件故障)时触发的一种机制。当CPU内部发生不可纠正的错误(如缓存错误、总线错误等)时,会触发MCE,由操作系统处理。Linux内核通过MCE机制来报告这些硬件错误。 现在,我们来看用户提供的日志信息:"core: using 10 mce banks"。这里的"core"指的是CPU核心,"mce banks"是指MCE寄存器组。每个CPU核心都有一组MCE寄存器(称为banks),用于记录不同类型的硬件错误。每个bank对应一个特定的错误类型,例如内存错误、缓存错误等。 在系统启动时,内核会检测CPU支持的功能,包括MCE banks的数量。日志"core: using 10 mce banks"表示当前CPU核心支持10个MCE寄存器组(即可以监控10种不同类型的硬件错误)。 接下来,我们需要考虑如何帮助用户理解这条日志的含义以及相关MCE日志的重要性。我们可以从以下几个方面展开: 1. **MCE机制简介**:解释MCE的作用和触发条件。 2. **MCE banks的含义**:说明banks是CPU提供的硬件错误记录寄存器,每个bank对应一种错误类型。 3. **日志解析**:说明该日志是正常启动信息,表明内核检测到CPU支持10个MCE banks,并已启用对这些错误的监控。 4. **相关MCE日志**:介绍其他常见的MCE日志,如错误类型、严重程度等。 此外,我们还需要提醒用户,如果dmesg中出现其他MCE错误日志(特别是标记为"uncorrected"的错误),则可能表示存在严重的硬件问题,需要进一步排查。 最后,我们可以生成一些相关问题,帮助用户深入理解MCE日志和硬件错误处理。 下面,我们按照上述思路组织回答。</think>### `dmesg` 输出 "core: using 10 mce banks" 含义解析 该日志是 **Linux 内核启动时对 CPU 硬件错误检测功能的初始化信息**,具体含义如下: #### 1. **核心组件解析** | 关键词 | 含义 | |--------------|----------------------------------------------------------------------| | **`mce`** | **Machine Check Exception**(机器检查异常),CPU硬件错误检测机制[^2] | | **`banks`** | CPU内部记录硬件错误信息的寄存器组,每个bank对应特定错误类型 | | **`10`** | 当前CPU核心支持的硬件错误监控寄存器数量(不同CPU型号数量不同) | #### 2. **技术背景说明 - **MCE机制作用**:当CPU检测到硬件级错误(如内存ECC错误、缓存损坏、总线故障等)时触发中断 - **典型错误类型**: ```mermaid graph LR A[硬件错误] --> B[内存错误] A --> C[缓存错误] A --> D[总线错误] A --> E[微码错误] A --> F[过热保护] ``` - **banks工作原理**: $$ \text{错误发生时} \rightarrow \text{CPU写入bank寄存器} \rightarrow \text{触发MCE中断} \rightarrow \text{内核记录日志} $$ #### 3. **日志关联分析 该日志通常伴随其他关键信息(需结合上下文): ```bash # 典型完整日志示例 [ 0.320456] mce: CPU supports 10 MCE banks [ 0.320789] mce: [Hardware Error]: CPU 0: Machine Check: 0 Bank 5: bea0000000000108 [ 0.321153] mce: [Hardware Error]: TSC 0 ADDR 1ffff00011000 ``` - ✅ **正常情况**:仅显示"using X MCE banks"表示硬件功能正常启用 - ⚠️ **警告情况**:若出现"Hardware Error"或"corrected/uncorrected"需立即排查 #### 4. **操作建议 1. **检查完整错误日志**: ```bash dmesg | grep -i "mce\|hardware error" -A 5 ``` 2. **查看CPU微码状态**: ```bash grep microcode /proc/cpuinfo | uniq # 输出示例:microcode : 0xca ``` 3. **更新CPU微码**(Intel示例): ```bash sudo apt install intel-microcode sudo update-initramfs -u ``` 4. **监控硬件健康**: ```bash # 安装检测工具 sudo apt install mcelog lm-sensors # 实时监控 sudo mcelog --ascii --syslog sensors | grep Core ``` > **关键区别**: > - `core: using 10 mce banks` → **正常功能初始化** > - `mce: [Hardware Error]` → **存在实际硬件故障**(需紧急处理)[^3] --- ###
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