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一、下载mimic数据
链接:https://pan.baidu.com/s/174E6r84o2MN_6_GFrMR7Fw
提取码:wnuq
二、安装前的软件准备
①安装PostgreSQL;
②安装Navicat(Navicat_Keygen_Patch激活);
③将下载好的文件解压放置在D盘,如下图即可,文件解压后大小为43.3GB,空间不足可放置在其他盘,但注意更换文件路径,脚本命令也需要做出相应的调整
三、MIMIC III数据库导入
使用SQL Shell进行数据库安装
输入四次回车,看到"用户 postgres 的口令:"则输入密码,如下登录成功
开始安装:总共11个步骤,每个步骤对应一条代码,按照顺序将以下代码一条一条复制-粘贴-回车(注意:以下代码是以安装到我的本地目录(D:\mimic)为例)
第一步:drop数据库mimic
DROP DATABASE IF EXISTS mimic;
第二步:创建数据库mimic
CREATE DATABASE mimic OWNER postgres;
第三步:连接上数据库mimic
\c mimic;
第四步:输入一个新模式mimiciii到当前数据库中
CREATE SCHEMA mimiciii;
第五步:添加新模式mimiciii到search_path
set search_path to mimiciii;
第六步:执行mimiciii建表语句,创建所有数据表
\i D:/mimic/postgres_create_tables.sql
第七步:设置遇到错误停止
\set ON_ERROR_STOP 1
第八步:添加csv文件数据的存放路径
\set mimic_data_dir 'D:/mimic/mimicd/data'
第九步:执行mimiciii表数据导入(注意:此步骤持续时间极长,我持续了7个小时才将数据全部导入,如下代表导入成功,请耐心等待。。。)
\i D:/mimic/postgres_load_data.sql
第十步:执行mimiciii索引创建,创建所有数据索引(注意:此步骤持续时间较长,我持续了15分钟创建了所有索引,请耐心等待。。。)
\i D:/mimic/postgres_add_indexes.sql
第十一步:执行csv文件和pg库数据量比对语句
\i D:/mimic/postgres_checks.sql
查询为26行行记录,并且row_count_check全部为PASSED,代表安装成功
温馨提示:
安装成功第一件事情请将解压后的文件删除掉,避免43.3GB的本地资源浪费,如果硬盘资源充足的,请忽略!!!