dplyr-aggregate数据框聚合

最新推荐文章于 2025-03-07 06:12:43 发布

倪桦

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分类专栏： R语言：数值分析文章标签： r语言

本文链接：https://blog.csdn.net/nh_code/article/details/125459973

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这篇博客介绍了如何使用R语言对数据框的行和列进行聚合操作。通过`aggregate`函数，分别展示了按行聚合求和以及按列聚合计算平均值的过程，最后将结果转换为合适的表格形式。这在数据分析中是非常常见的步骤。

摘要由CSDN通过智能技术生成

> counts
       cell.1 cell.2 cell.3 cell.4 cell.5
gene.1      2      4      3      3      3
gene.2      6      4      3      3      0
gene.3      1      2      3      3      3
gene.4      8      9      0      3      0

对数据框的行进行聚合

row.agg.list <- c('x_1','x_2','x_1','x_3')
counts %>% data.table::data.table() %>% aggregate(by=list(row.agg.list), FUN=sum) %>% 
    tibble::column_to_rownames(var = "Group.1") 
#######################################
    cell.1 cell.2 cell.3 cell.4 cell.5
x_1      3      6      6      6      6
x_2      6      4      3      3      0
x_3      8      9      0      3      0

对数据框的列进行聚合

col.agg.list <- c('cll.a','cll.a','cell.b','cell.c','cell.c')
counts %>% t() %>% data.table::data.table() %>% aggregate(by=list(col.agg.list), FUN=mean) %>% 
    tibble::column_to_rownames(var = "Group.1") %>% t()
#######################################
       cell.b cell.c cll.a
gene.1      3    3.0   3.0
gene.2      3    1.5   5.0
gene.3      3    3.0   1.5
gene.4      0    1.5   8.5