【学习WRF笔记2】安装WRF

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【学习WRF笔记1】Linux环境搭建
【学习WRF笔记2】安装WRF

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前言

官网安装教程 https://www2.mmm.ucar.edu/wrf/OnLineTutorial/compilation_tutorial.php
在Linux环境基础上，安装WRF所必须的依赖库，包括zlib/hdf5/libpng/jasper/netcdf-c/netcdf-fortran，了解软件安装时常用文件夹作用。测试库的兼容性。安装WRF、WPS，以及安装所需WRF后处理软件，如ncl/ARWpost/Grads。

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一、系统环境测试

利用官方测试文件Fortran_C_tests.tar，测试gfortran、gcc编译器，csh、perl、sh 3种脚本语言。

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二. 依赖库安装

—系统：
Ubuntu 16.04.6 LTS (GNU/Linux 4.15.0-58-generic x86_64)
—编译器：
Intel 2013.3.163
—所需软件安装包：
zlib-1.2.7.tar.gz
libpng-1.6.37.tar.gz
hdf5-1.8.11.tar.gz
jasper-1.900.1.zip
netcdf-4.4.1.1.tar.gz
netcdf-fortran-4.4.4.tar.gz
WPSV3.9.1.TAR.gz
WRFV3.9.1.1.TAR.gz
ARWpost_V3.tar.gz
ncl_ncarg-6.6.2-Debian9.8_64bit_nodap_gnu630.tar.gz（cnmap.tar.gz）

0）文件夹结构和用途

· /bin：二进制可执行命令。
/bin目录包含了引导启动所需的命令或普通用户可能用的命令(可能在引导启动后)。这些命 令都是二进制文件的可执行程序(bin是binary的简称)，多是系统中重要的系统文件。
· /lib：标准程序设计库，又 叫动态链接共享库，作用类似windows里的.dll文件。
/lib目录是根文件系统上的程序所需的共享库，存放了根文件系统程序运行所需的共享文件。这些文件包含了可被许多程序共享的代码，以避免每个程序都包含有相同的子程序的副本，故可以使得可执行文件变得更小，节省空间。
· /etc：系统管理和配置文件。
· /usr/include：linux下开发和编译应用程序所需要的头文件。

1）zlib

将库安装压缩包复制到~/tmp下面

tar zxvf zlib-1.2.7.tar.gz
cd zlib-1.2.7
export CC=icc
./configure --prefix=$HOME/Software/zlib-intel
make #编译
make check
make install

zlib-intel/lib/下面软件存在，安装成功。

2）hdf5【重要，大，耗时10min】

tar zxvf hdf5-1.8.11.tar.gz
cd hdf5-1.8.11
./configure --prefix=$HOME/Software/hdf5-intel CC=icc FC=ifort --enable-fortran --with-zlib=$HOME/Software/zlib-intel
make
make check
make install

hdf5安装成功。

3）libpng

tar zxvf libpng-1.6.37.tar.gz
cd libpng-1.6.37
./configure --prefix=$HOME/Software/libpng-intel CC=icc LDFLAGS=-L$HOME/Software/zlib-intel/lib LIBS=-lz CPPFLAGS=-I$HOME/Software/zlib-intel/include
make
make check
make install

libpng安装成功。

4）jasper

unzip jasper-1.900.1.zip
cd jasper-1.900.1
./configure --prefix=$HOME/Software/jasper-intel CC=icc
make
make check
make install

5）netcdf-c

netcdf先安装c后安fortran

tar zxvf netcdf-4.4.1.1.tar.gz
cd netcdf-4.4.1.1
./configure --prefix=$HOME/Software/netcdf-intel CC=icc --disable-dap --disable-netcdf-4
make
make check
make install

6）netcdf-fortran

tar zxvf netcdf-fortran-4.4.4.tar.gz
cd netcdf-fortran-4.4.4
./configure --prefix=$HOME/Software/netcdf-intel CC=icc FC=ifort F77=ifort LDFLAGS=-L$HOME/Software/netcdf-intel/lib CPPFLAGS=-I$HOME/Software/netcdf-intel/include LIBS=-lnetcdf
make
make check
make install

多了netcdf-fortran，安装成功。

7）设置环境变量

######### set envirment for WRF #####
export JASPERLIB=$HOME/Software/jasper-intel/lib
export JASPERINC=$HOME/Software/jasper-intel/include
export NETCDF=$HOME/Software/netcdf-intel
export PATH=$NETCDF/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$NETCDF/lib:$LD_LIBRARY_PATH
#export HDF5=$HOME/Software/hdf5-intel
#export PATH=$HDF5/bin:$PATH
#export LD_LIBRARY_PATH=$HDF5/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export WRF_EM_CORE=1
#################################

hdf5在安装WRF时没有用到，即HDF5涉及到的3句，可设为注#释。

source ~/.bashrc
echo $NETCDF #测试下

三、依赖库兼容性测试

官方测试文件Fortran_C_NETCDF_MPI_tests.tar测试netcdf和mpi编译器

四、编译WRF模块

需要用到：WRFV3.9.1.1.TAR.gz

tar zxvf WRFV3.9.1.1.TAR.gz
cd WRFV3

WRFV3.9.1.1.TAR.gz解压缩WRFV3内

./configure #选【15】和默认【1】

./compile em_real >& compile.log #编译WRF【大约需要30min】
cat compile.log #查看日志，编译成功，4个可执行文件

注：编译选择real case有4个.exe，编译选择idealized case有2个.exe（wrf.exe ideal.exe）。可执行文件可以从两个地方运行WRF，WRF/run和WRF/test/em_real。

五、安装WPS

tar zxvf WPSV3.9.1.TAR.gz
cd WPS

WPSV3.9.1.TAR.gz解压缩WPS内

./configure #选【17】

vi configure.wps

在新生成configure.wps中增加COMPRESSION_LIBS和COMPRESSION_INC中jasper/libpng/zlib路径信息

修改后：

./compile #编译WPS

六、安装后处理软件

grads-2.0.1.tar.gz
ncl_ncarg-6.6.2-Debian9.8_64bit_nodap_gnu630.tar.gz
ARWpost_V3.tar.gz

1）ARWpost

WRF/文件夹下安装

tar zxvf ARWpost_V3.tar.gz
cd ARWpost
./configure #选2

src/Makefile中19行添加netcdff库，如下所示
因为装netcdf时分开装的c和fortran两个，要人为加上去一个。

./compile

2）Grads

系统也自带

tar zxvf grads-2.0.1.tar.gz #解压即安装

将安装目录添加到环境变量里

######### set envirment for grads #####
export PATH=$HOME/Software/grads-2.0.1/bin:$PATH
export GADDIR=$HOME/Software/grads-2.0.1/dat
export GASCRP=$HOME/Software/grads-2.0.1/lib
#################################

32位软件在64位系统中可能出现错误

sudo apt install libx11-6:i386

3）ncl

mkdir ncl-6.6.2
cd ~/tmp/ncl-6.6.2/
tar zxvf …/ncl_ncarg-6.6.2-Debian9.8_64bit_nodap_gnu630.tar.gz
mv ncl-6.6.2/ ~/Software/ #解压即安装

将安装目录添加到环境变量里

######### set envirment for ncl #####
export NCARG_ROOT=$HOME/Software/ncl-6.6.2
export NCARG_LIB=$NCARG_ROOT/lib
export NCARG_INC=$NCARG_ROOT/include
export PATH=$NCARG_ROOT/bin:$PATH
#################################

另：安装ncl脚本的高亮显示：

wget http://www.ncl.ucar.edu/Applications/Files/ncl_gedit_xml.tgz #下载到tmp/
tar zxvf ncl_gedit_xml.tgz
cd ncl_gedit_xml
./install.sh 3

另：cnmap绘制中国底图的扩展包，解压后放到/home/tian/Software/ncl-6.6.2/lib/ncarg/nclscripts下面

总结

就此，WRF模式算是搭建好了，可以开始正式的把模式运行起来了~接下来利用实例对模式各个步骤进行理解和应用。

WRF和WPS在虚拟机上安装过多次，算是比较熟悉。但自从装了新编译器就遇到各种软件打不开、不适配的问题。。。还不能完美解决，所以这次索性就再重新开一个系统，装上最初安装的版本，专心搞WRF