整理论文基线数据的function

本文介绍了一种在R语言中处理临床论文基线数据的方法,特别是针对分类变量如性别、种族和合并症等。作者编写了一个function,能够高效整理这些数据,输出每个组的数值和百分比,并提供了P值进行统计显著性检验,可根据数据量选择卡方检验或Fisher精确检验。
摘要由CSDN通过智能技术生成

在做临床论文,整理基线数据的时候,遇到很多分类变量,比如说性别,种族,合并症,用药等等,一个一个整理比较麻烦,就写了一个function,可以比较方便地整理数据。

原始数据的样式:

在这里插入图片描述

这个function设置了3个参数:需要整理的表格名,要整理的列,作为分类依据的变量

baselinetable <- function(table_name, cols, index){
   
  table_name <- as.data.frame(table_name)
  temp_table <- data.frame()
  for (i in cols) {
   
    temp <- table(table_name[,i], table_name[,index])
    temp2 <- chisq.test(temp, correct = TRUE) #可以根据需要换成 fisher.test()
    temp_0 <-
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