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项目一:fmriprep 用于预处理各种 fMRI 数据的易用pipeline
fMRIPrep 是一种功能性磁共振成像 (fMRI) 数据预处理管道,旨在提供易于访问的、最先进的接口,该接口可对扫描采集协议的变化非常可靠,并且需要最少的用户输入,同时提供易于解释和全面的误差和输出报告。它执行基本处理步骤(核心、规范化、解曲线、噪声成分提取、分割、头骨跳闸等),提供可轻松提交到各种组级分析的输出,包括基于任务或静止状态的 fMRI、图形理论测量、表面或基于体积的统计等。
fMRIPrep 管道使用来自知名软件包的工具的组合,包括FSL_、ANTs_、FreeSurfer_和AFNI_。此管道旨在为每个预处理状态提供最佳的软件实现,并将随着更新和更好的神经成像软件的可用而更新。
此工具允许您轻松执行以下操作:
- 将 fMRI 数据从原始数据从原始到完全预处理
- 实现不同软件包的工具
- 通过使用可用的最佳工具实现最佳的数据处理
- 生成预处理质量报告,用户可以通过这些报告轻松识别异常
- 接收有关每个主题的预处理阶段(包括有意义的错误)
- 自动和并行化处理步骤,从典型的线性手动处理中显著加快速度。
fMRIPrep 围绕三