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今天给大家分享自己检索到的一篇文献,是关于键序参数分析的一个程序,感兴趣的可以看一下,官网里有详细的介绍。
文章题目:Melting of icosahedral gold nanoclusters from molecular dynamics simulations
文章链接:http://dx.doi.org/10.1063/1.1917756
Program title: Bond Order Parameters (bop)
软件网址:
http://www.pas.rochester.edu/~wangyt/algorithms/bop/
操作系统: Linux/Unix
编程语言:C
键序参数法(Bond-orientational Order Parameter,BOP)是通过分析原子构型的对称性来识别不同构型的原子。为了确定体系的最终构型,采用基于球谐函数的键序参数Ql来区分固体构型和液体构型,其范围是从0到1。为了进一步考察晶体熔化前后的微观结构,BOP是Steinhardt等提出研究熔化的常用分析手段,也被用来表征全局原子结构和长程结晶顺序。通过计算平均键合取向序参量Qlm,可以方便地得到第二阶Ql和第三阶Wl的旋转不变量。
Figure 1
Figure 2
Figure 3
Figure 4
Figure 5
Figure 6
Figure 7
Figure 8
Figure 9
Figure 10
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