键序参数分析程序——Bond Order Parameters

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今天给大家分享自己检索到的一篇文献,是关于键序参数分析的一个程序,感兴趣的可以看一下,官网里有详细的介绍。

文章题目:Melting of icosahedral gold nanoclusters from molecular dynamics simulations

文章链接:http://dx.doi.org/10.1063/1.1917756

Program title: Bond Order Parameters (bop)

软件网址: 

http://www.pas.rochester.edu/~wangyt/algorithms/bop/

操作系统: Linux/Unix

编程语言:C

键序参数法(Bond-orientational Order Parameter,BOP)是通过分析原子构型的对称性来识别不同构型的原子。为了确定体系的最终构型,采用基于球谐函数的键序参数Ql来区分固体构型和液体构型,其范围是从0到1。为了进一步考察晶体熔化前后的微观结构,BOP是Steinhardt等提出研究熔化的常用分析手段,也被用来表征全局原子结构和长程结晶顺序。通过计算平均键合取向序参量Qlm,可以方便地得到第二阶Ql和第三阶Wl的旋转不变量。

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Figure 1

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Figure 2

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Figure 3

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Figure 4

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Figure 5

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Figure 6

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Figure 7

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Figure 8

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Figure 9

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Figure 10

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