【程序分享2】LAMMPS + OVITO + 晶体缺陷识别 + 点缺陷 + 分子动力学模拟

第2个程序

 Compute style ‘‘frenkel’’ and dump style ‘‘frenkel’’无后处理的分子动力学模拟中的并行点缺陷识别:lammps的计算和转储方式 。

关键词：

1. Cascade damage

2. Frenkel pair

3. Parallel

4. Molecular dynamics

5. LAMMPS

6. Point defect

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主要内容

“介绍了两类分子动力学程序LAMMPS——一类是计算型，一类是转储型——旨在识别、计数和输出级联损伤和相关分子动力学模拟中的点缺陷。计算是在多个MPI进程中并行完成的，并且可以与原始模拟同时进行。由于无需对系统中的每个原子进行后处理，这大大降低了存储需求。通过适当选择参考晶格，可以从输出中消除非立方晶格、自由表面和大空隙。这些类源自LAMMPS的Dump和Compute类，如果不使用它们，不会给LAMMPS带来额外的开销。”——取自文章摘要。

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Figure 4

Figure 5

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