摘要:本文主要研究基于FabH酶的新的抑菌剂。虽然目前已经有很多的抗生素,但是细菌的对目前抗生素的耐药性越来越强,开发新型的抗生素是非常迫切的。FabH可以作为新的抑菌剂的靶点。本文根据已有的报道基于吡唑和苯丙咪唑,酰胺合成出27个新的抑制FabH酶活性的小分子,并通过实验验证了这些分子的抑菌效果。其中31号化合物活性最好,通过DS中的ADMET模块对这些化合物的药代动力学性质进行了评价,同时通过CDOCKER模块将31号化合物对接到FabH酶中,研究了其作用机制。
分子对接(molecular docking)是基于结构药物设计的核心模拟手段,依据受体与配体作用时的几何匹配和能量匹配过程,模拟受体-配体相互作用,预测两者间最佳的结合模式和结合亲和力。采用分子对接模拟技术,科研人员可以进行基于结构的药物虚拟筛选,药物分子的结构改造,药靶相互作用的机理研究等工作,从而大大提高实验效率。在Discovery Studio这一分子模拟的综合平台中,共有四种对接程序,包含Libdock、CDOCKER、FlexibleDocking,这三种对接算法各有优势,能够满足广大科研工作者的多种应用需求,为其提供配体受体间相互识别的“利器”。
新型抑菌剂-FabH抑制剂的研究
ref:European Journal of Medicinal Chemistry,Volume 171, 1 June 2019, Pages 209-220;IF=4.816
链接: https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2019.03.026.
虽然发现了多种抗菌药物并用于临床治疗,但微生物对抗菌药物耐药的发生率不断被报道。因此,开发新型抗菌药物是一项非常重要的任务,许多研究工作都是围绕高效新型抗菌药物的设计展开的。近年来,研究的重点是开发新的抗菌药物与新的靶标。脂肪酸合成酶(FAS)通路是一个很有前途的靶标。FabH在FAS通路中起到非常关键的作用,抑制FabH的活性可以阻断细菌中脂肪酸的合成,抑制细菌生长。本文根据已有的报道基于吡唑和苯丙咪唑,酰胺合成出27个新的抑制FabH酶活性的小分子,并通过实验验证了这些分子的抑菌效果。其中31号化合物活性最好,通过DS中的ADMET模块对这些化合物的药代动力学性质进行了评价,同时通过CDOCKER模块将31号化合物对接到FabH酶中,研究了其作用机制。
图一 27个化合物的ADMET性质评价。
图二 31号化合物与FabH的相互作用模拟。
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