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生信干货
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生信漫谈
生信漫谈,认识生信,学习生信,跨越生信入门路上的障碍,从而利用生信技术解决科研学习路上的绊脚石!
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重点关注 | 2024年博士后科学基金第75批面上资助,公示了
通过以上步骤是否学会了呢?生信漫谈,认识生信,学习生信,跨越生信入门路上的障碍,从而利用生信技术解决科研学习路上的绊脚石!2024年度中国博士后科学基金第75批面上资助拟资助人员名单进行公示的通知,大家先一睹为快!今天就先给大家介绍到这里,希望大家的科研能有所帮助!重点关注 | 2024年博士后科学基金第75批面上资助,公示了。原创 2024-07-21 19:33:10 · 901 阅读 · 0 评论 -
2024年博士后科学基金第17批特别资助,公示
2024年博士后科学基金第17批特别资助,公示。原创 2024-07-21 19:29:19 · 449 阅读 · 0 评论 -
2024年最新SCI影响因子发布,植物领域 Molecular Plant排名领先
2024年最新SCI影响因子发布,植物领域 Molecular Plant排名领先2024年SCI影响因子刚刚发布,不同领域影响因子有涨有跌,大家先一睹为快!植物领域我们关注的国产之光,原创 2024-06-20 13:52:14 · 1694 阅读 · 0 评论 -
中国科学院植物研究所宋献军课题组揭示不同的翻译后修饰协作调控水稻种子大小的新机制
中国科学院植物研究所宋献军课题组揭示不同的翻译后修饰协作调控水稻种子大小的新机制未来20年,我国将决战全面建成社会主义现代化国家,人们生活水平不断改善;这一国情决定我们未来农业的发展,既要高产稳产提高粮食安全,又要满足不断增长的优质粮需求。水稻是我国的主粮作物。籽粒大小决定稻米的产量和品质。在先前的研究中,中国科学院植物研究所宋献军研究组克隆了一个编码组蛋白乙酰化酶的基因GRAIN WEIGHT 6a (GW6a),正向调控水稻籽粒大小(粒长)和单株产量。原创 2024-05-25 17:41:30 · 705 阅读 · 0 评论 -
建议收藏 | 2023年生物学类SCI期刊影响因子最新预测,Molecular Plant遥遥领先
2023年生物学类SCI期刊影响因子最新预测,Molecular Plant遥遥领先,植物经典期刊Plant Physiology即将跌破7分,大部分一区杂志持续下跌,期待最新影响因子发布!生物学类期刊即时影响因子查看。原创 2024-05-25 11:32:40 · 614 阅读 · 0 评论 -
寓言一则,老师,您太极端了
来自饶议科学!【这是一则寓言,但是如果它与事实雷同,欢迎对号入座】学生:老师,我以前一直尊重您,但也对您有很大的意见,就是您在校外写的文章,有些批评太激烈,我们不相信学界如此不堪。老师:哦。我公开批评的是我所知的一小部分,有时实在忍无可忍。我们国家对科学的支持越来越多,而学界的道德滑坡却越来越快。我积极参与体制建设,但如果只有体制建设,没有学界的文化和道德改善,担心体制建设不足建立和维持可持续的改革。原创 2024-05-18 14:00:04 · 720 阅读 · 0 评论 -
李绍清教授团队在水稻耐盐研究领域取得新进展
由于工业污染的不断积累、化肥的大量使用以及全球气温上升等多重因素的影响,地球土壤盐碱化程度日益加剧,导致耕地资源遭到破坏,农业生产蒙受巨大损失,已成为一个世界性的生态难题。水稻作为世界上最重要的粮食作物,正面临着土壤盐碱化所带来的严峻威胁,严重影响水稻正常生产和产量稳定。因此,发掘水稻耐盐相关基因,揭示耐盐机理,对选育耐盐品种、提高水稻耐盐性、保障水稻产量具有重要意义。最近,武汉大学生命科学学院李绍清教授团队在国际著名植物学期刊和上分别发表了题为。原创 2024-05-18 13:52:59 · 679 阅读 · 0 评论 -
武汉大学李绍清教授团队揭示OsGRF7调控水稻耐盐新机制
由于工业污染的加剧、化肥的大量使用以及不合理灌溉等原因,全球土壤盐碱化程度日益加剧,导致耕地资源遭到破坏,农业生产蒙受巨大损失,已成为一个世界性的生态难题。水稻作为世界上最重要的粮食作物,正面临着土壤盐碱化所带来的威胁,严重影响水稻正常生长和产量稳定。近日,在国际著名植物学期刊上在线发表了题为的论文,揭示了转录因子OsGRF7调控水稻耐盐性和籽粒大小的分子机制。研究发现提高OsGRF7的表达(GRF7-OE)可促进水稻对盐胁迫的耐受性,而抑制其表达(GRF7-Ri)或敲除该基因(原创 2024-05-05 19:37:57 · 772 阅读 · 0 评论 -
生信小知识 | Seqlogo图快速绘制的必备技能
R语言绘制WeblogoTbtools得到图片也非常漂亮,基本可以直接使用了。原创 2024-05-05 19:33:34 · 890 阅读 · 0 评论 -
生信小知识 | 如何快速确定一个物种某一个基因家族全部基因数目
基因组数据库中获得。原创 2024-05-04 16:28:47 · 993 阅读 · 0 评论 -
建议收藏 | 2023年中国SCI期刊影响因子最新预测
经过Web of Science 官网对引用前50和IF排名前50的中国(包括香港、澳门和台湾)期刊以及中国主办或中国人主编的高影响力期刊进行了2023年影响因子预测。结果显示,108本中国期刊的2023年影响因子平均IF上升了,有54本增长,49本下降。其中,Chinese Science Bulletin-Chinese(科学通报)的IF增长最快,涨幅;其次是Rock and Soil Mechanics (岩土力学),涨幅。原创 2024-04-21 10:59:59 · 1855 阅读 · 0 评论 -
2023年中科院分区,大家博士毕业有底了,谁才是最后的大赢家?
2023年中科院分区,大家博士毕业有底了,谁才是最后的大赢家?2023年12月27日,中国科学院文献情报中心重磅更新公布的期刊表引起了大家的热烈讨论,据网上公布的数据有部分期刊晋升到1区,也有很多期刊被移出了1区跌落到2区,确实比较遗憾。前面大家主要关注的都是1区的期刊,1区的论文投稿需要的数据和投稿的周期都比较长,对大部分人都是不适合的。今天我们来看看较为大家熟悉的一些出版社和投稿比较迅速的期刊,这关系到你博士申请或者毕业的资格论文是否有托底了!原创 2024-01-01 10:10:38 · 1697 阅读 · 0 评论 -
零代码不求人,GWAS在线分析网站,建议收藏
最近得益于韩斌院士发表NG提供的最新杂交水稻资源构建的在线分析网站:http://ricehybridresource.cemps.ac.cn/#/,功能还是非常强大的(主页me哪里显示怪怪的,但是不影响分析)。相较于韩斌院士的杂交水稻GWAS分析网站,华中农业大学的这个网站,应该大部分比较熟悉,但还是有很多人不会使用。生信漫谈,认识生信,学习生信,跨越生信入门路上的障碍,从而利用生信技术解决科研学习路上的绊脚石!原创 2023-09-15 22:11:08 · 327 阅读 · 0 评论 -
给你一个国家杰青资助金额,你会进行韩斌院士水稻杂种优势的研究工作吗
生信漫谈生信漫谈。原创 2023-09-14 00:23:30 · 72 阅读 · 0 评论 -
如果浙江大学李兰娟院士在MDPI杂志发表的SCI论文结果不能复现,会怎么样?
希望不管是SCI的作者还是论文的审稿人,都需要认真对待,不合理的地方早日质疑,早日提出问题,解决问题。对待公共数据库的挖掘需要认真对待,认真对待每一行代码不要觉得分数低没人看,万一发生今天这样的事情是多么的尴尬呀!审稿人如果对文章内容不熟悉,不要贸然接受审稿,不然被人在网上指指点点还是有点不好!原创 2023-08-30 08:27:20 · 177 阅读 · 0 评论 -
紫色番茄可以延长小鼠寿命,张启发院士的黑色稻米有什么神奇功效?
生信漫谈生信漫谈紫色番茄可以延长小鼠寿命,张启发院士的黑色稻米有什么神奇功效?原创 2023-08-21 00:33:41 · 503 阅读 · 0 评论 -
浙江大学李兰娟院士在MDPI上发表SCI给我们的启示
生信漫谈生信漫谈浙江大学李兰娟院士在MDPI上发表SCI给我们的启示。原创 2023-08-20 16:20:46 · 595 阅读 · 0 评论 -
生物研究的一些常用在线生信工具建议收藏
生信漫谈生信漫谈。原创 2023-08-17 20:29:40 · 541 阅读 · 0 评论 -
顶尖学者纷纷加入西湖大学,颜宁什么时候加入施一公团队
施一公是一个带有传奇色彩的人物,很多人想了解他成长的故事,感情的故事,科研的故事,冷冻电镜的故事,很巧在B站看到有人在解析这本书,《自我突围》是施一公院士的首部作品,这本书写给教育科研工作者,写给青年学子,在追求理想的道路上步履不停,共同前行,想了解施一公的可以看看《自我突围》,也可以多多了解施一公团队的秘密,学习高效管理科研团队。待遇好,不差钱,只管搞科研,为什么不去呢,还有一个西湖大学的理念非常先进,真正的实现了破四维,不唯成果论,不唯成果高低大小论,这是国内其他顶级学者或者团队难以做到的。原创 2023-08-10 17:31:08 · 226 阅读 · 0 评论 -
生物博士互作蛋白研究收藏网站汇总
精读文献,挖掘资源,收集资源为自己服务也为大家服务,有好的学习资源欢迎大家积极提供,让大家科研少走弯路。上周末发表了一篇Cell杂志上关于互作蛋白预测筛选的推文,很多小伙伴给我留言说非常感兴趣,但是数据库库容量有限导致很多基因查找不到,这毕竟是一篇2020年发表的论文,数据可能有些落后于时代,粉丝朋友希望我多推荐几个预测查找互作蛋白的网站,完成一些重要功能的通路验证工作。生信漫谈,认识生信,学习生信,跨越生信入门路上的障碍,从而利用生信技术解决科研学习路上的绊脚石!关注我们,学习更多生信干货,原创不易,原创 2023-08-09 20:17:24 · 152 阅读 · 0 评论 -
超简单的比较基因组学Ka/Ks进化速率图绘制
生信漫谈生信漫谈超简单的比较基因组学Ka/Ks进化速率图绘制。原创 2023-08-05 20:07:15 · 633 阅读 · 0 评论 -
植物生物学生物分析资源网站,超多可以直接用的分析数据
今天分享科研必备网站之植物生物学生物分析资源网站,网站包含各种胁迫处理的定量分析数据,不同组织的基因表达谱数据,这岂不是为写基因家族,为写论文发愁的小伙伴提供大量的免费资源,关键是免费,不花时间分析转录组,动动手指就能得到你想要的表达量的数据。生信漫谈,认识生信,学习生信,跨越生信入门路上的障碍,从而利用生信技术解决科研学习路上的绊脚石!基因表达和蛋白质工具,将表达模式视为热图,探索启动子,识别蛋白质-蛋白质相互作用等等。其他的一些功能包括多序列比对,热图绘制,韦恩图等等。上述可以看到还有其他强大的功能。原创 2023-07-19 22:25:02 · 132 阅读 · 0 评论 -
生信漫谈送你超级好用的多序列拼接软件
Chromas Pro软件的功能介绍到这里,网上的免费版本也很多可以下载,建议百度搜索下载,生物专业用该软件去进行序列拼接超级超级好用,比测序公司推荐的拼接软件都好用,想要的关注,私信找我要Chromas Pro软件哈。作为科研人员(生物专业从业者,医学生,临床医生等),接触的各种测序非常多,那么怎么快速的分析你测序的结果呢,测了正向,测了反向序列,是不是测通了,只有拼接在一起才知道,科研真是费脑子。生信漫谈,认识生信,学习生信,跨越生信入门路上的障碍,从而利用生信技术解决科研学习路上的绊脚石!原创 2022-12-16 00:29:07 · 1460 阅读 · 1 评论 -
生信漫谈分析杨梅UDP-糖基转移酶基因家族
基因复制分析表明,两者是串联的和近端重复是MR UGT基因家族扩大的主要驱动因素。今天小白带大家来看一篇2022年9月份发表在SCI分区Q1区[Frontiers in Plant Science]的基因家族文献:杨梅UDP -糖基转移酶基因家族的全基因组分析及类黄酮糖基化相关成员的鉴定。其实作者通篇的分子实验主要是一个胁迫处理的定量,表达谱分析,以及后面挑选个别重要的基因进行一些指标的测定增加工作量,是一个基因家族分析的常规套路的延伸分析,相信有一定实验条件的同学都可以完成。每组的UGT蛋白数目不同。原创 2022-12-15 18:49:26 · 462 阅读 · 0 评论 -
生信漫谈如何分析菠萝WRKY基因家族
今天小白带大家来看一篇发表在SCI分区Q2区【BMC Genomics】杂志的基因家族文献:菠萝WRKY基因家族的全基因组研究:发育和逆境中的进化和表达谱。作者从背景介绍说明了WRKY蛋白是一个转录因子大家族,在许多生理过程和环境适应中发挥重要作用。然而,关于重要的热带水果菠萝(Ananas Comosus)的WRKY基因的信息却很少。公布的菠萝全基因组序列使我们能够对菠萝WRKY基因的组织和表达谱进行全基因组研究。文章主要的分析内容是比较套路化的,下面小白将其具体的分析内容列举出来,供大家参考。1、菠萝W原创 2022-12-03 21:38:30 · 348 阅读 · 0 评论 -
生信漫谈如何做出惊艳BOSS老板的进化树
初次接触生物的朋友,通过前期的构建进化树学习已经学会构建系统进化树了,但是这样的进化树只能作为一个简单的草图进行展示,如果需要达到发表级别,这是远远不够的,今天小白将给你展示发表级进化树如何美化。2、美化进化树,点击Annotation upload,可以上传,也可以在线输入命令,不懂的可以可以参考help,里面解释非常清晰明了,颜色设置,字体设置等等。生信漫谈,认识生信,学习生信,跨越生信入门路上的障碍,从而利用生信技术解决科研学习路上的绊脚石!生信漫谈,小知识,大智慧!小白,公众号:生信漫谈。原创 2022-12-02 23:10:28 · 434 阅读 · 0 评论 -
生信漫谈如何画出美美的SeqLogo图
勾选右边的Download to local drive,标题名字,序列的bar都可以自行选择,图片的输出格式有png,PDF,可以根据自己的选择进行下载就行。点击上面的红色圈圈创建,在空白窗口输入SeqLogo图的序列,这些序列一般是通过chip-seq,或者其他网站预测得到的序列。以上三种方法亲测有效,大家根据自己需求进行绘图,祝大家科研少走弯路,早日发paper!画出美美的SeqLogo图,下面介绍三种不同的方法,适用不同的人群的需求。点击开始,保存图片即可,也是有多种输出格式可以进行选择。原创 2022-11-30 17:48:05 · 970 阅读 · 0 评论 -
生信漫谈如何绘制蛋白序列的二级结构可视化图
现在进入ESPript / ENDscript网站,上传对应文件,采用初级 的默认功能进行图片可视化,再点击页面顶部的SUBMIT按钮即可。这是以第一条蛋白序列作为模型构建的PDB文件,序列跟其他的蛋白序列差异比较大,建议选择同源性高的序列进行可视化,效果会更好。生信漫谈,认识生信,学习生信,跨越生信入门路上的障碍,从而利用生信技术解决科研学习路上的绊脚石!在用该网站之前需要把序列进行比对,用MEGA7就能完成,把第一条序列用蛋白同源建模。示例数据用之前讲到的19条同源基因序列。生信漫谈,小知识,大智慧!原创 2022-11-30 17:30:32 · 1768 阅读 · 2 评论 -
生信漫谈如何做出美美的多序列比对图
由于软件的功能限制,一些比对软件生成的比对文件,如Clustalx的*.aln文件,可读性差,无法满足高水平文章的要求。做生信的小朋友看到别人文章里面的多序列比对图是不是感觉特别好看,特别养眼,但是让自己去做,出的图真是惨不忍睹,无法直视,被老板ds,没办法,因为你们没有找到好用的软件,还有你也没要找到正确的使用方法。生信漫谈,认识生信,学习生信,跨越生信入门路上的障碍,从而利用生信技术解决科研学习路上的绊脚石!以上的介绍够详细吧,相信你按着步骤也能做出美美的让老板羡慕的多序列比对图。原创 2022-11-24 08:58:33 · 2901 阅读 · 1 评论 -
生信漫谈如何利用MEGA7构建系统进化树
生物技术近年发展越来迅猛,掌握一门生信语言或者一个生信软件的使用,这将为我们的科研学习之路提供非常大的便利。2、序列的准备,必须是fasta结尾的格式,其他像txt格式,软件不能识别,以下以拟南芥SPL15基因的蛋白序列为例,进行同源序列查找。生信漫谈,认识生信,学习生信,跨越生信入门路上的障碍,从而利用生信技术解决科研学习路上的绊脚石!1、下面以MEGA7为例来进行讲解,下面是下载地址,大家根据自己的系统进行下载即可。选择其中同源序列高的前19条蛋白序列进行下载进行示范。以上任一种形式都可以。原创 2022-11-24 00:26:54 · 4315 阅读 · 0 评论