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最近得益于韩斌院士发表NG提供的最新杂交水稻资源构建的在线分析网站：http://ricehybridresource.cemps.ac.cn/#/，功能还是非常强大的（主页me哪里显示怪怪的，但是不影响分析）。
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前期相关推文：给你一个国家杰青资助金额，你会进行韩斌院士水稻杂种优势的研究工作吗
1变异位点查询
其实这个网站的功能还是非常强大，可以查看杂交品种的变异位点，如下所示：
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结果如下所示：
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2样品信息查询
具体的样品代号信息可以通过这个查询：
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重点是这个GWAS部分
3 GWAS部分
通过输入物种信息，具体表型信息就可以得到结果：
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我们以分蘖角度做关联分析：
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可以看到具体的表型数据，以下是具体的结果，可以看到在9号染色体这个区段有一个非常显著的QTL位点，效应非常强：
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表型数据还是非常新的，稻米品质类数据都有：
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产量数据：
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最后用生育期数据做一个GWAS分析图：
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具体的GWAS结果也可以下载：
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ricevarmap
相较于韩斌院士的杂交水稻GWAS分析网站，华中农业大学的这个网站，应该大部分比较熟悉，但还是有很多人不会使用。
网站地址：http://ricevarmap.ncpgr.cn/
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网站的功能也是非常强大的，我们今天专门看下GWAS部分：
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选择所有种质资源的生育期表型进行全基因组关联分析：
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结果如下，提供了表型分布图：
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表型的具体信息：
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CottonMD
华中农业大学构建的棉花数据库，数据库内容非常丰富，功能齐全。
网站地址：https://yanglab.hzau.edu.cn/CottonMD
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功能模块：
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GWAS、eQTL等在线分析：
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结果分析图：
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棉花数据库还是非常齐全，分析图片也非常精美，希望对大家有用！
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