linux 下使用ITK-SNAP

itk-snap 在windows安装比较简单,但是在linux就不尽人意了,下面就讲解以下我如何在linux下使用itk-snap的

首先去他们的官网下在压缩包

ITK-SNAP Home

右上角有个download选项进去后一步步下载自己所需要版本的压缩包(我使用的是3.6版本,貌似3.8版本看样子少几个动态库,我没试过,需要用3.8版本的可以自己试试),然后在压缩包所在的位置使用下面的解压命令,后面的tar.gz是你压缩包的名字,后面是

tar zxvf pythontab.tar.gz

解压后的可执行文件被放在了lib里面,感觉该软件是c++开发的(qt和好多动态库文件),想要使用的话需要运行这个文件,一般是通过命令行执行,在执行文件所在的目录下打开终端,运行如下命令,前面是链接动态库(连接到本目录) 后面是执行本目录下的目标文件

LD_LIBRARY_PATH=./ ./ITK-SNAP

下面是运行结果

 

 

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itk-SNAP是一款非常流行的医学图像处理软件,用户可以使用它进行医学图像的分割、三维重建和可视化。下面是itk-SNAP使用教程。 首先,打开itk-SNAP软件。在菜单栏中选择“文件”-“打开图像”,然后选择要处理的医学图像文件。软件支持常见的医学图像格式,如DICOM、Nifti等。 图像打开后,可以通过鼠标和键盘进行操作。鼠标左键用于选择ROI(感兴趣区域),通过在图像上拖动,可以创建一个ROI。可以使用鼠标滚轮调整图像的缩放比例和平移。 通过选择“标签”菜单,可以创建标签并将其分配给ROI。可以选择不同的颜色和透明度来标记不同的结构或组织。通过选择“分割”菜单,可以进行分割操作。用户可以手动绘制轮廓或使用自动分割算法。 选择“编辑”菜单,可以进行一些编辑操作,如剪切、粘贴、填充等。选择“测量”菜单,可以进行一些测量操作,如测量ROI的体积、表面积等。 在完成分割和编辑操作后,可以选择“保存”菜单将结果保存到本地文件中。还可以选择“导出”菜单将结果导出为其他格式的图像文件。 此外,itk-SNAP还提供了一些高级功能,如多模态图像配准、三维重建和可视化。用户可以通过选择菜单上的相应选项来使用这些功能。 需要注意的是,itk-SNAP是一款功能强大但也复杂的软件,初学者可能需要花费一些时间来熟悉其操作。可以参考软件自带的帮助文档或在线教程,深入了解各种功能的使用方法。 希望这个简要的itk-SNAP使用教程能够帮助你入门并顺利进行医学图像处理工作。

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