生信宝典-CSDN博客

原创基于 R 语言的深度学习——简单回归案例

近年来深度学习在人工智能领域飞速发展，各行业的学者、研究人员纷纷涌入研究热潮。本文将从 R 语言角度来介绍深度学习并解决以下几个问题：什么是深度学习？相关深度学习包有哪些？如何配置工作环境？如何使用神经网络建立模型？；。

2024-09-02 16:43:35 1235

凌晨四点，终于交了论文。囫囵一觉醒来，打开手机就看到了导师简单的评注：“论文不错，图表重做。”好消息：论文过了。坏消息：论文没有全过......毕业证离自己可能就差这么几张图，可这不就是几个统计图表嘛，配图难在哪里？？打开互联网，随便一搜，立刻就被前人总结的小坑大坑超大坑淹没：1. 图表有基本错误，横轴纵轴不清晰，标示缺损2.图表数量太少，不能多角度展示数据特点3.图表种类单一，图像语言不够丰...

2024-09-01 00:03:05 83

转载解锁R语言绘图魅力，通晓数据可视化之道

【科研新风尚，R语言绘图新篇章】在这个数据驱动的时代，科研成果的可视化展示已成为学术交流的重要窗口《R语言科研绘图与学术图表绘制从入门到精通》为科研工作者们送上了一把解锁视觉表达新境界的钥匙！【热点融合，技能升级】随着大数据、人工智能等前沿科技的飞速发展，高质量的科研图表成为衡量研究成果直观性与影响力的关键。本书紧跟时代步伐，不仅深入浅出地讲解了R语言在数据处理、图形绘制方面的强大功能，还紧密结合...

2024-08-30 21:02:05 23441

原创 ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色)

作者：严涛浙江大学作物遗传育种在读研究生（生物信息学方向）伪码农，R语言爱好者，爱开源

2024-08-30 11:43:55 1688

原创 Genome Alert!：临床常规基因组变异重新解释和自动化基因-表型再评估的标准化程序

针对不同的临床适应症，基因检测越来越多地被纳入医疗保健途径。一些国家已经发展了人口基因组学的组织，这些组织正在革新医疗实践。然而，由于分析时基因组和医学知识的局限性，这些一部分基因组分析仍然没有结论。美国医学遗传学与基因组学学会/分子病理学协会（ACMG/AMP）关于变异分类的建议旨在在医学解释的背景下，使基因组中心的变异解释实践标准化。最近，已经发布了根据这些建议自动分类基因组变异的工具。与此同时，不断发展的医学知识和临床基因组测序的迅速采用影响了标准实践，并创造了额外的需求。该领域当前的

2024-08-30 11:14:30 1044

转载祖先序列重构拓展三萜2"-O-糖基化酶底物谱| 清华大学李春联合北理工冯旭东最新ANGEW...

1. 论文的研究目标和意义本论文在2024年8月22日在线发表于ANGEW。旨在开发高效的生物催化剂,用于合成带有线性三糖的三萜皂苷。三萜皂苷是一类重要的植物天然产物,在医药和农业领域有广泛应用。然而,由于其疏水的碳骨架,三萜皂苷的水溶性较差,限制了其生物利用度和临床应用。糖基化修饰,尤其是三糖修饰,可显著提高其水溶性和药理活性。Glycosylation is a crucial method ...

2024-08-29 21:01:54 282

转载里程碑！数据分享全球，主权留在国内，中医证候研究数据采集模块在CNCB-NGDC平台成功上线...

质量是中药研究的核心问题，回答“质量是什么？”、解析“质量是如何形成的”，需要以临床需求为导向。生命组学数据作为现代生物学研究的核心，为“用现代科学解读中医药学原理”提供了坚实的基础，其不仅是中医药各学科研究不可或缺的工具，更是推动中医药领域不断创新发展的重要动力。近日，在国家基因组科学数据中心NGDC-中医药分中心（依托单位为中国中医科学院医学实验中心）推动下，在NGDC组学原始数据归档库GSA...

2024-08-29 21:01:54 220

原创典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Limma差异分析、火山图、功能富集

为了分析发炎和未发炎组织的差异表达，我们需要构建一个线性模型。线性模式是实验数据分析的常用方法，适用于几乎任何复杂的实验设计。

2024-08-29 17:23:28 1180

原创单细胞测序做到啥程度能毕业|博士篇

来具体看一下内容，值得注意的是，这是一篇以数据分析为主的论文。不仅是上皮细胞，作者将内皮细胞分为了两个亚群：肿瘤内皮细胞(TEC)和正常内皮细胞(NEC)，通过差异分析及火山图可视化发现肿瘤内皮细胞中上调的基因主要与细胞外基质重塑、血管生成、脉管系统生成、肿瘤侵袭、细胞粘附等过程相关(emm，也许这里少一个。除了这两篇之外我还读了一篇博士论文，该论文的篇幅也在一百页左右，主要内容是20只不同分组的模式动物的单细胞测序分析，并且没有实验验证内容(包含一些临床样本的免疫荧光验证)。正常活化成纤维细胞,NAF；

2024-08-29 17:21:11 1319

原创对一篇单细胞RNA综述的评述：细胞和基因质控参数的选择

在本篇综述中，作者讨论了这些新技术的基本原理，重点强调单细胞转录组分析中的重要概念。具体地说就是总结了单细胞过滤的质控方法、由于mRNA捕获率低需要进行的标准化和归一化方法和用于降维数据绘制二维图的聚类和可视化的算法。

2024-08-28 16:06:41 1300

原创这个神奇的网站提供各种图的R代码供您参考！

点击去每一个都有代码和数据。

2024-08-28 16:03:52 232

转载共探生物信息学前沿科技——中国生物信息学学会（筹）多组学与整合生物学专委会2024年会盛大召开...

2024年8月18日，重庆市迎来了生物信息学领域的一场学术盛宴——中国生物信息学学会（筹）多组学与整合生物学专委会2024年会。本次会议由重庆市生物信息学会承办，旨在汇聚国内外顶尖的生物信息学专家、学者及行业精英，共同探讨生物信息学在医药健康领域的最新进展与未来趋势，进一步推动生物信息学技术的创新与应用。会议吸引了来自中国科学院、清华大学、天津医科大学、同济大学、南京医科大学、山东大学齐鲁医院、中...

2024-08-28 12:02:49 48

转载无限免费使用，强烈建议所有科研人都安装！！

2024年，AI进一步爆发各种各样的AI工具也汹涌而至！用AI翻译论文、分析Excel、自动搭建模型……科研人的焦虑瞬间被点燃！AI抢走人的饭碗，连招呼都不打事实上……第一波会用AI做科研的人，早就碾压同龄人了！为了帮助各位科研人抓住AI风口，增加竞争力????知乎知学堂特发起：行业前沿资源——AI智能办公训练营掌握20+AI工具，让科研&工作效率飞速提升！已为本号粉丝开通免费领取权限，预计...

2024-08-28 12:02:49 47

转载 iMetaOmics主编于君教授位列“2024年中国最佳女科学家排名”第一

iMetaOmics主编于君教授位列“2024年中国最佳女科学家排名”第一同时位列Research.com发布“2024年世界最佳女科学家排名”第96位。近日，Research.com发布的第三版世界顶级女科学家年度排名，热心肠智库专家、香港中文大学于君教授位居“2024年中国最佳女科学家排名”第1位、“2024年世界最佳女科学家排名”第96位。Research.com是科学排名的头号研究门户网站...

2024-08-27 21:00:43 34

转载视频回放 | 陈哲生-怎么写一篇高影响力的综述

iMeta讲座十How to write an impactful review acticle?怎么写一篇高影响力的综述更多推荐（▼ 点击跳转）高引文章 ▸▸▸▸iMeta | 引用7000+，海普洛斯陈实富发布新版fastp，更快更好地处理FASTQ数据高引文章 ▸▸▸▸iMeta | 德国国家肿瘤中心顾祖光发表复杂热图(ComplexHeatmap)可视化方法高引文章▸▸▸▸iMeta | ...

2024-08-27 21:00:43 44

原创十年之后，又见刘江

乘电梯登上中国科学院北京基因组研究所的大楼，穿过大厅最中央宽敞的研究生办公区域，便可以径直来到与之相通的中国科学院大学博士生导师、中国科学院北京基因组研究所研究员刘江的办公室。

2024-08-27 13:58:11 517

原创多图示例：如何呈现论文结果中的各种图表

本文根据《Journal of the American College of Cardiology》上曾发表的一篇文章《Making Sense of Statistics in Clinical Trial Reports》，来全面而具体地说明临床试验论文中，各种类型数据与结果使用图表的正确展示方法。

2024-08-27 13:55:35 827

原创 Matter主编社论：当编辑1万小时后，我有以下10点想说 | Cell Press论文速递

通过投入时间、学习材料、完成作业、参加考试、撰写论文，你就会成为真正意义上的“专家”。我也经历了长达10多年的艰辛和挑战，这一过程“吞噬”了我的20多岁的青春年华。

2024-08-27 13:54:11 460

原创 Nucleic Acids Res | 陈润生/何顺民团队发表非编码RNA相互作用数据库NPInter v5.0

研究团队对非编码RNA分子多维度的相互作用以及相关分子进行了详细的注释以及可视化，提供了一个全面、系统的非编码RNA相互作用的研究平台。

2024-08-27 13:52:26 829

转载 Nature Commun | 海南大学/崖州湾国家实验室罗杰团队揭示脂肪酸代谢基因簇对水稻产量的调控机制...

责编 | 王一植物代谢物可分为初生代谢物和次生代谢物两大类，初生代谢物为植物生长发育所必需，而次生代谢物则主要参与植物逆境响应。在植物基因组中，代谢基因簇由至少三个基因编码的不同酶组成，这些酶参与控制代谢物积累的同一代谢途径。大多数报道的代谢基因簇是合成次生代谢物，参与植物生长发育中的初生代谢基因簇尚未被报道。近日，海南大学/崖州湾国家实验室罗杰团队在Nature Communications上在...

2024-08-26 21:02:37 16

转载 Plant Journal | 中国药科大学秦民坚/赵玉成团队解密植物C-苷黄酮地上部分特异性累积的生物学效应...

黄酮C-苷是黄酮苷类化合物主要存在的形式之一，其结构特征是糖通过C-C键直接连接到黄酮骨架上。相对于黄酮O-苷，其结构更稳定，不易被酸水解，并具备独特的药用特性和植物生理功能。据报道，黄酮C-苷的糖基化主要发生在类黄酮骨架的C6和/或C8位置，其中牡荆素、异牡荆素及其衍生物是分布最广的黄酮C-糖苷类化合物。目前，已从69个科300种植物中分离和鉴定了754种黄酮C-糖苷及其衍生物，并发现它...

2024-08-25 21:00:23 33

转载 Nature Genetics | 朱玉贤院士团队发布首个棉花基因组完整图谱，阐述棉族独特折叠胚胎形成的分子与演化机制...

植物种子及其周围结构提供的营养维持了人类文明的延续与发展。植物种子胚胎是营养的储存器，展现出丰富的结构多样性，反映了植物在进化过程中对环境适应的独特策略。1946年，早期植物学家A. C. Martin根据种子胚胎大小和形态特征，将植物种子胚胎划分为10种类型 (Martin, 1946)，其中被子植物的胚胎通常表现为叶轴型（Foliate axile types, FA），包含了四种基本类型，即...

2024-08-25 21:00:23 36

转载 Nature Biotechnology：m6A定量测序新方法 | 何川、陈建军、陈梦洁、胡璐璐等合作开发...

以往认为中心法则中DNA主要发挥模板的作用而信使RNA（mRNA）则扮演着信息传递者的角色。mRNA表观修饰的发现拓展了mRNA的功能。在RNA水平上的转录后修饰可通过顺式或者反式机理调控基因表达，对细胞功能、细胞命运决定至关重要。尽管科学家们长时间以来了解RNA上存在转录后修饰，而这些修饰直到近年来才被认为从另一层面增加了基因表达调控的复杂性。迄今为止，RNA上共发现有多于150种化学修饰，包括...

2024-08-24 21:00:24 52

原创从头测序+重测序 | 利用细菌二/三代测序组装全基因组草图，注释，并应用于遗传分析

假设你分离到了一株菌，是一种当前研究地少、或新发现的物种，NCBI也无参考基因组，那么：① 需要从头组装；②二代测序Reads太短，为了获得最大的contig或染色体，就可能需要加些三代测序数据；③ 组装好了之后就要注释，获得能看得懂的基因名称(Symbol)，并很清楚地了解其功能、掌握其序列；

2024-08-23 11:01:31 276

原创北京基因组所（国家生物信息中心）发布全转录组关联研究知识库TWAS Atlas

中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research在线发表。

2024-08-23 10:59:40 303

转载国自然发布在即！《Nature》专访国家自然科学基金委员会主任窦贤康：改革支持青年科学家，尤其是女性研究人员...

近日，《Nature》专访中国国家自然科学基金委员会（NSFC）主任窦贤康，详细介绍了他上任以来在支持青年科学家，特别是女性研究人员方面的改革举措。主要任务展望窦贤康指出，NSFC的主要任务在于资助基础研究项目和支持优秀的青年科学家。他强调要延续过去取得的成功，并表示在过去一年中，已经推出多项改革举措，包括扩大对青年科学家的资助和支持，以及开放“优秀青年科学基金”项目；并且将申请“杰青”的女性年龄...

2024-08-22 21:00:54 20

转载专家点评Nat Metab | 薛宇/贾大团队合作揭示生酮饮食发挥作用的新机制

点评 | 王秀杰（中国科学院遗传与发育生物学研究所）、赵英明（美国芝加哥大学）生酮饮食（Ketogenic Diet, KD）是一种以高脂肪、极低碳水化合物和适量蛋白质为比例的饮食方式，自20世纪20年代初以来一直被临床用来治疗癫痫等疾病。生酮饮食减少了葡萄糖的利用，导致游离脂肪酸在肝脏中转化为酮体，包括乙酰乙酸、β-羟基丁酸（β-OHB）和丙酮，其中β-羟基丁酸是最丰富的形式。迄今为止，生酮饮食...

2024-08-22 21:00:54 56

转载 NAR | 做qPCR实验更简单！西南大学卢坤等团队更新了基因特异性qPCR引物数据库，涵盖1172种生物...

高质量的引物设计对于所有基于聚合酶链反应(PCR)的实验的成功至关重要。研究之前建立了一个基于热力学的基因特异性定量PCR (qPCR)引物数据库，用于147个生物的基因表达研究。然而，数据库中生物的数量和功能的不完善限制了其潜在的应用。2024年8月9日，西南大学卢坤、李田、张凯在Nucleic Acids Research在线发表题为“qPrimerDB 2.0: an updated co...

2024-08-22 21:00:54 29

原创 R中6种读入表格数据的方式哪个最快？结果出人意料！

R怎么读入表格数据最快？R中有6个常用数据读取函数：utils::read.csv: 默认使用的读入方式 (read.table)readr::read_csv:readr包中的读入函数 (RStudio中默认也包含了这一方式)data.table::fread: 来自data.table包base::load: 加载rda文件base::readRDS: 读取二进制数据feather::read_feather: 一种新的feather格式的二进制数据

2024-08-22 16:57:19 557

原创别人运行的好好的R代码，到我这怎么就冲突了？你应该这么做！！！

培训时，同一段代码，大家都运行的好好的，而你却出现问题了，一般都是考虑包里的函数冲突了。这时需要一个个去排查到底是哪个函数发生了冲突，有没有更好的办法呢？本文介绍一个包conflicted，可以列出所有冲突的函数，并可以设置优先使用哪个函数来处理冲突。

2024-08-22 16:54:51 428

转载宣武医院张兰、中医药学院王伽伯、暨南大学鞠振宇、美国凯斯西储大学罗广彬教授等合作发现传统中药何首乌改善造血干细胞衰老机制...

-- 宣医药学 --宣武医院张兰教授团队合作发现传统中药何首乌改善造血干细胞衰老机制近日，首都医科大学宣武医院张兰教授团队，与中医药学院王伽伯教授团队、暨南大学鞠振宇教授团队、美国凯斯西储大学罗广彬教授合作，在《Journal of Advanced Research》杂志（IF=10.7）在线发表了题为“Tetrahydroxy stilbene glucoside rejuvenates ...

2024-08-21 21:01:05 20

转载北京市科协青年科技人才跨界交流活动：青年说-智慧“药食同源”，助力主动健康学术交流圆满举办...

2024年8月17日上午，由北京市科学技术协会指导，北京药理学会、北京科技社团服务中心主办，中国中医科学院中药研究所/青蒿素研究中心承办的青年科技人才跨界交流活动——青年说-智慧“药食同源”，助力主动健康学术交流在中国中医科学院报告厅圆满举办。中国中医科学院科研管理处杨阳副处长、国家卫生健康委医药卫生科技发展研究中心王敏副处长、北京药理学会张兰理事长莅临指导并致辞，国家卫生健康委医药卫生科技发展研...

2024-08-21 21:01:05 16

原创一篇综述翻译解读文章的发出也需要数易其稿

这篇综述写的确实好，涵盖了转录组的很多方面。不管是新学者还是有一些基础或者自认为经验很多的人，总能在里面看到、学到一些新的知识点。好的综述不只是现有知识的汇总，更包含着很多作者的看法和经验，值得反复去读。

2024-08-21 14:16:00 216

原创蛋白质组学研究概述

古希腊，一个神一样的存在，不只有雅典娜，更孕育了“ome”等一批高大上的词汇。组学表示一组物质整体的表现。蛋白质组学表示特定系统内蛋白质集合的研究。

2024-08-21 14:13:55 960

转载 iMeta大会2024 (10.11-13深圳) 第一轮通知

iMeta大会2024：构建创新型科研生态iMetaiMeta期刊是生物技术、微生物组和生物信息交叉学科期刊，主编刘双江和傅静远教授，影响因子23.7，位于全球微生物学科研究类第一，全球排名前千分之五(107/21848)，中国大陆排名11/514，广东省第一。子刊iMetaOmics主编赵方庆和于君教授，定位IF > 10的高水平交叉学科综合期刊，欢迎投稿！iMeta大会是由iMeta编...

2024-08-20 21:00:28 45

转载 Nature Genetics | 唯一通讯单位，河南省农科院团队在花生基因组变异和重要农艺性状遗传解析方面取得了重大进展...

近日，河南省农科院作为唯一通讯单位，在遗传学领域国际著名期刊《自然-遗传学》（Nature Genetics）杂志上发表题为“Chloroplast and whole-genome sequencing shed light on the evolutionary history and phenotypic diversification of peanuts”的研究论文。该研究成果是张新友院...

2024-08-20 21:00:28 27

原创宏蛋白质组学分析一站式工具集iMetaLab Suite(加拿大渥太华大学Figeys组)

iMetaLab Suite：宏蛋白质组学分析一站式工具集https://doi.org/10.1002/imt2.25SHORT COMMUNICATION●2022年5月21日，加拿大渥太华大学医学部药学院Daniel Figeys团队在iMeta在线发表了题为“iMetaLab Suite: A one-stop toolset for metaproteomics”的文章。● 该研究开发了一套名为iMetaLab Suite的免费一站式分析工具集，涵盖了宏蛋白组学中最常用的功能、分类和统计分析。●

2024-08-20 17:16:59 600

原创三个重复通过抽样得到适合于做网络的样本量--是否可行？

很多做环境的朋友，测定微生物群落还是测三个，但是这样的话，确实做网络的可行度很差，而网络在环境生态中的应用却很是广泛，所以有一些朋友发微信问我，说可不可以进行抽样，抽取几个重复，合并在一起做网络？关于这个问题，我也不好说，这里通过一个例子给大家看一下。注意这并不是意味着这是一个通用的规律，这批数据是植物根际微生物组数据，后面有别的数据我也会运行一下告诉大家。为了测试网络的稳健程度，我们对单个土壤提取了100个重复，后面我将用这100个样本，随机抽样，看看网络到底到在多少个重复的时候就达到了稳健。

2024-08-20 17:13:27 300

转载 New Phytologist丨华南农业大学沈荣鑫、王海洋、衡月芹等利用多组学手段揭示了茉莉酸调控水稻花时的分子网络...

研究背景水稻颖花开放时间（花时）是指水稻扬花期颖花在一天中的开花时间或开花持续时间。水稻花时是水稻生命周期中一个关键的时期，涉及雄蕊花丝伸长、花药开裂、花粉释放以及授粉，这些活动对植物受精结实至关重要。开花植物能够根据外界环境变化调整自身花时，从而提高植物的适应性。花时也是控制水稻杂交制种效率的关键农艺性状。在杂交稻生产中，恢复系是花粉供体，雄性不育系是花粉受体。只有当双亲颖花的开花时间相遇时，才...

2024-08-19 21:02:42 20

转载中山大学公共卫生学院郭城课题组诚招博士后和研究生

课题组及PI信息课题组PI郭城，副教授，博士生导师。曾就职于美国哥伦比亚大学医学院感染与免疫研究中心以及美国环境保护署担任生信团队负责人和生物信息研究员等职务。多年来聚焦病原组学检测技术的创新，以及其在新发和不明原因感染性疾病研究中的应用，包括：①参与发明病原捕获测序和高通量血清学检测技术，利用创新的探针设计、样本处理体系和生信分析流程，使新方法的灵敏度较传统方法提升近千倍；②在临床或自然场景中开...

2024-08-19 21:02:42 24

Masterminds of programming

　　Description 　　 Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. Think along with Adin D. Falkoff (APL), James Gosling (Java), Bjarne Stroustrup (C++), and others whose vision and hard work helped shape the computer industry. You'll find advice you can apply to systems you're developing, even if you don't use the specific languages being discussed. 　　Full Description 　　Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. In this unique collection, you'll learn about the processes that led to specific design decisions, including the goals they had in mind, the trade-offs they had to make, and how their experiences have left an impact on programming today. Masterminds of Programming includes individual interviews with: 　　* Adin D. Falkoff: APL 　　* Thomas E. Kurtz: BASIC 　　* Charles H. Moore: FORTH 　　* Robin Milner: ML 　　* Donald D. Chamberlin: SQL 　　* Alfred Aho, Peter Weinberger, and Brian Kernighan: AWK 　　* Charles Geschke and John Warnock: PostScript 　　* Bjarne Stroustrup: C++ 　　* Bertrand Meyer: Eiffel 　　* Brad Cox and Tom Love: Objective-C 　　* Larry Wall: Perl 　　* Simon Peyton Jones, Paul Hudak, Philip Wadler, and John Hughes: Haskell 　　* Guido van Rossum: Python 　　* Luiz Henrique de Figueiredo and Roberto Ierusalimschy: Lua 　　* James Gosling: Java 　　* Grady Booch, Ivar Jacobson, and James Rumbaugh: UML 　　* Anders Hejlsberg: Delphi inventor and lead developer of C# 　　If you're interested in the people whose vision and hard work helped shape the computer industry, you'll find Masterminds of Programming fascinating.　　

2010-12-26

Python在Unix和Linux系统管理中的应用

作者：Noah Gift,Jeremy M. Jones 出版日期：2009年4月出版社：O'Reilly 页数：433 ISBN：978-7-80205-738-8 文件格式：PDF 《Python在Unix和Linux系统管理中的应用》展示了Python语言如何提供一种更加高效的方式来处理Unix和Linux服务器管理工作中的各种任务。本书的每一章都会提出一个特定的管理问题，例如并发或数据备份，然后通过实际的例子提供基于Python的解决方案。你将学习使用 Python开发一套属于自己的命令行工具，并用来解决一系列范围很广的问题。本书作者们还构建了一个可以免费下载的Ubuntu虚拟机。该虚拟机包含了这本书的源代码，还可以用来运行书中的实例，包括SNMP、IPython、SQLAlchemy和许多其他工具。通过这本书，你将发现Python是怎样帮助你： * 读入文本文件并提取信息 * 使用线程和派生子进程的选项并发地运行多个任务 * 使用网络工具从一个进程传送信息到另一个进程 * 创建更易互动的可点击图形界面工具 * 通过与SNMP交互来用程序监控大型多个集群机器 * 掌握IPython的命令环境来替代或增强Bash、Korn或Z-Shell的功能 * 将云计算集成到基础架构中并编写一个基于谷歌应用程序引擎的应用 * 利用定制脚本来解决特殊的数据备份的挑战 * 使用Django、SQLAlchemy和Storm对象关系模型来与数据库交互通过本书及其辅助虚拟机，你将学习如何打包并部署Python应用程序和库文件，以及如何编写在多个Unix和Linux平台下都运行良好的代码。 “这本书适用于Python新手，不管他们是否具有命令环境脚本编写的经验或者总体上相对而言就是编程初学者。Jeremy和Noah都很注意为自己的理由给出支持材料，并且解释这些代码实例在实际中的运用。与许多轻易就让新手不堪重负的编程书籍不同，本书尽一切努力来让这些新手们获得自信和成功。” ——Ruth Suehle和Bascha Harris，Red Hat杂志 Noah Gift在加州理工学院、迪斯尼、Feature Animation和Turner Studios具有十年以上的Unix和Linux开发经验。他是Giftcs和Cloud Seed软件公司的合伙人。 Jeremy M.Jones是Predictix公司的软件工程师，同时也是开源项目Munkware、ediplex和podgrabber的作者。

2010-12-18

gvim常用插件及其配置文件配置（下载解压即可使用）

gvim常用插件及其配置文件支持c，perl，python，latex。需要自己安装ctags .vim: after compiler doc indent ltags perl-support skeleton syntax autoload c-support ftdetect keymap Makefile plugin snipMate.vim.ct tools colors CVIMSYN ftplugin latextags Makefile.in README.csupport snippets .vim/after: ftplugin plugin syntax .vim/after/ftplugin: c_snippets.vim java_snippets.vim python_pydiction.vim python_snippets.vim sh_snippets.vim .vim/after/plugin: .vim/after/syntax: cpp.vim c.vim java.vim .vim/autoload: acp.vim perlsupportgui.vim perlsupportprofiling.vim perlsupportregex.vim snipMate.vim .vim/colors: desertEx.vim peachpuff.vim zenburn.vim .vim/compiler: tex.vim .vim/c-support: codesnippets doc rc scripts templates wordlists .vim/c-support/codesnippets: calloc_double_matrix.c main.cc print_array.cc.noindent calloc_int_matrix.c Makefile print_double_array.c.noindent main.c Makefile.multi-target.template print_int_array.c.noindent .vim/c-support/doc: ChangeLog c-hotkeys.pdf c-hotkeys.tex .vim/c-support/rc: customization.ctags customization.gvimrc customization.indent.pro customization.vimrc .vim/c-support/scripts: wrapper.sh .vim/c-support/templates: c.comments.template cpp.comments.template cpp.preprocessor.template c.statements.template c.cpp.template cpp.cpp.template cpp.statements.template Templates c.idioms.template cpp.idioms.template c.preprocessor.template Templates~ .vim/c-support/wordlists: c-c++-keywords.list c-c++-keywords.list.bak k+r.list stl_index.list .vim/CVIMSYN: engspchk.contraction engspchk.dialect engspchk.dict engspchk.match engspchk.proper engspchk.rare .vim/doc: acp.jax latexhelp.txt latex-suite-quickstart.css Makefile taglist.txt acp.txt latex-suite latex-suite-quickstart.html Makefile.in tags catalog.xml la

2010-08-17

Data Mining in Bioinformatics 生物信息中的数据挖掘

Jason T.L. Wang, Mohammed J. Zaki,Hannu T.T. Toivonen and Dennis Shasha (Eds) Summary The aim of this book is to introduce the reader to some of the best techniques for data mining in bioinformatics in the hope that the reader will build on them to make new discoveries on his or her own. The book contains twelve chapters in four parts, namely, overview, sequence and structure alignment, biological data mining, and biological data management.

2010-03-02

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition I. Clustering, II. Document retrieval and representation, III. Email surveillance and filtering, and IV. Anomaly detection. 著名大师Michael W. Berry的经典力作！

2010-03-02

比perl好的生物信息学语言python

比perl好的生物信息学语言python，简明教程！

2009-09-26

空空如也

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