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悟道西方

踏实工作,认真修养;与人为善,合作共赢;玉汝于成,追求卓越。

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转载 推荐一款生信分析工具的集大成者

https://www.expasy.org/往期精品(点击图片直达文字对应教程)机器学习后台回复“生信宝典福利第一波”或点击阅读原文获取教程合集 ...

2021-07-31 22:12:00 168

转载 重磅预售 | 分子生物学与遗传学经典名著——《Lewin基因XII》(中译本)

《基因》系列自问世以来的几十年间共修订了12次。这不仅反映了基因研究的迅猛发展和所取得的丰硕成果,同时也表明了《基因》系列深受广大读者的喜爱。科学出版社于2005年引进出版《基因VIII》...

2021-07-30 21:17:00 1494

转载 限时免费!Cell旗下 Heliyon 多学科特刊征稿

交叉学科InterdisciplinaryHeliyon是Cell Press旗下的一本全学科的开放获取期刊,出版科学准确的、有价值的且遵守公认的伦理和科学出版标准的研究。不论是原创研究、...

2021-07-29 20:58:00 2997

转载 最后3天!生信入门转录组和可视化学习捷径

转录组分析是目前应用最广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较,寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本,并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。转录组的测序...

2021-07-27 20:51:14 518

转载 外国小哥,把整个 CNN 都给可视化了,卷积、池化清清楚楚!

最近,有个项目在社交媒体上火起来了,项目作者是来自维也纳的3D特效师。创建这样一个CNN可视化工具,是它在硕士论文完成,因为当初学的就是神经网络,学的过程中很难明白卷积层之间是如何相互连接...

2021-07-25 15:00:00 242

转载 你和PPT高手之间,就只差一个iSlide,新版本支持Mac、WPS、Office

你和PPT高手之间,就只差一个iSlide文中介绍了islide的几个功能和示例应用,很受欢迎。具体功能使用见下图,获取方式为访问网址 https://www.islide.cc (为方便...

2021-07-25 15:00:00 2645

转载 mSystems:苏晓泉、徐健-基于大数据引擎的全球微生物组转化网络

一个无标度、完全关联的全球转化网络是已知微生物组多样性的基础A Scale-Free, Fully Connected Global Transition Network Underlie...

2021-07-24 15:40:00 375

转载 人的“肥胖”基因FTO可促进水稻和土豆增产50% - 中国粮食、中国饭碗

随着世界人口的快速增长,至2050年粮食产量需要再增加50%才能完全满足需求,如何进一步提高作物产量是亟待解决的严峻问题。加之近年来全球气候变暖、土地干旱半干旱加剧、极端天气等也给粮食安全...

2021-07-24 15:40:00 713

转载 互联网之父公开拍卖万维网源代码,3400万买下后发现居然有bug

博雯 发自 凹非寺量子位 报道 | 公众号 QbitAI本文经AI新媒体量子位(公众号 ID: QbitAI)授权转载,转载请联系出处上个月,万维网源代码在网上公开拍卖:没错,就是1990...

2021-07-22 22:00:00 133

转载 吴思涵国内首场肿瘤ecDNA学术报告|深度揭秘半个世纪ecDNA的研究成果及突破性进展...

·「ecDNA研究回顾」·yr1965年54年前,The Lancet《柳叶刀》首次报道了染色体外DNA的存在。yr2019年吴思涵作为第一作者发表Nature,第一次正面解析了癌基因所在...

2021-07-21 19:00:00 519

转载 U盘文件系统无法识别,数据怎么恢复?

昨天偷懒直接打开U盘里面的PPT文件,更新这次课程的教案。一路修改、一路保存,都没问题。晚上把盘带回去,打不开了,提示“无法识别的文件系统”。换了个电脑,依然识别不了,修改了一天的PPT就...

2021-07-20 20:13:00 1665

转载 给老板做PPT必备:文字加拼音

汉字博大精深、读法也多,有些词的读法可能需要现学现用。在辅助老板做PPT或撰写文稿时,认为可能有些不太能分清的文字发音,最好加一下拼音注释,你好我好他也好。所需字体需要自己安装,百度搜索“...

2021-07-19 22:24:00 424

转载 最后一周!导师推荐的转录组和可视化学习捷径

转录组分析是目前应用最广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较,寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本,并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。转录组的测序...

2021-07-18 10:00:00 1126

转载 摸鱼也要讲究方法:工作学习中玩手机并不能缓解无聊和疲劳

撰文| 王聪编辑| nagashi排版| 水成文智能手机的出现,对社会产生了深远的影响,人们不仅可以用智能手机来拨打电话或发送短信,还用于处理各种应用程序。当代社会,手机早已成为人们...

2021-07-18 10:00:00 145

转载 AlphaFold2开源了,不是土豪也不会编程的你怎么蹭一波?

2020年,AlphaFold2在CASP14蛋白质结构预测关键评估大赛中夺得透明,其预测的大部分结构达到了空前的准确度,不仅与实验方法不相上下,还远超解析新蛋白质结构的其他方法。经过2个...

2021-07-16 14:25:00 8607 1

转载 最后一周 | 微生物组-扩增子16S分析和可视化(线上/线下同时开课,2021.7)

福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、转录组的线上/线下同时开课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下...

2021-07-16 14:25:00 613

转载 使用阿基米德螺线进行数据可视化

最近开发了一个新的R包spiralize,可以使用阿基米德螺线对数据进行可视化。在数据可视化中,螺线具有以下两个优点:1. 可以可视化具有非常长的数据轴的数据,同时能够提高可视化的分辨率;...

2021-07-15 22:00:00 794

转载 采用circlize包绘制Circos图

本文采用circlize包自带的示例数据绘制Circos图,简要描述了circlize包的用法,以及几个常用参数的作用。Circos图(圈图)功能可展示的数据:基因密度、基因功能注释、CG...

2021-07-13 12:00:00 3268

转载 The Innovation | clusterProfiler:聚焦海量组学数据核心生物学意义

导 读clusterProfiler4.0同步支持最新版GO和KEGG数据,支持数千物种的功能分析,应对不同来源的基因功能注释(如cell markers, COVID-19等)提供了通用...

2021-07-12 11:56:00 827

转载 西湖大学生命科学学院杨剑教授实验室招聘启事

西湖大学生命科学学院杨剑教授实验室招聘启事课题组简介西湖大学生命科学学院统计遗传学实验室主要致力于人类基因组变异研究,解析基因组变异与疾病或健康的关联,为实现人类疾病的预防、诊断和治疗提供...

2021-07-11 17:00:00 287

转载 山东大学微生物国家重点实验室刘双江组招聘(肠道微生物方向)

一、实验室介绍肠道微生物实验室主要开展肠道微生物的分离培养、生理代谢、遗传以及与宿主互作等。实验室学术带头人刘双江教授曾经获得国家杰出青年基金项目(2007)和中科院“百人计划”项目支持(...

2021-07-11 17:00:00 443

转载 我在哥大读博的五年,万字总结

本文仅供学习参考,如有侵权请联系删除!知乎:https://zhuanlan.zhihu.com/p/338193330作者:Showthem0. 写在前面「开始写这边总结的时候是三月,纽...

2021-07-10 09:00:00 671

转载 把你的科室做成蛋糕,你能想象是什么样子吗?

正经的内科充满童趣的儿科大尺度的妇产科“大刀阔斧”的外科大外科大外科下有几大门派,很血腥,很暴力,一起来细细品味一下。普外科骨科心胸外科泌尿外科血管外科这个坏疽有点破坏整体美感...整形外...

2021-07-10 09:00:00 125

转载 科研分享|一个论文关系网络可视化网站

简介四月开始啦!每个月开头都会逛一逛“统计之都[1]“,因为每月的统计月读[2]更新啦!三月的统计月读有一个内容真的让人心动,而且非常实用!推荐人是:孔令仁,网址链接为:https://w...

2021-07-09 13:00:00 1049

转载 什么是安斯库姆四重奏?为什么统计分析之前必须要作图?

欢迎关注"R语言和统计"~~Anscombe's quartet,Wikipedia就现在的习惯来说,统计表格和作图往往是同时出现的。比如,在使用表格呈现相关或回归...

2021-07-08 21:30:00 3757

转载 视频演示 | 功能新增 | 增强版在线LEFSe分析和可视化鉴定标志性基因或物种

LEfSe分析即LDA Effect Size分析,是一种用于发现和解释高维度数据 生物标识(基因、通路和分类单元等)的分析工具,可以进行两个或多个分组的比较,它强调统计意义和生物相关性,...

2021-07-07 16:30:00 249

转载 外显子和基因组基本概念(一)

聊生信团队近期梳理了一些外显子和基因组相关的基本概念,便于理解后续的相关生信分析。基因组(Genome):分子生物学和遗传学领域中指生物体所有遗传物质的总和,包括DNA或RNA(病毒)。D...

2021-07-06 15:00:00 7158 3

转载 还在担心没有服务器做不了数据分析?这个免费资源看一下!

长久以来,超级计算机一直是各国竞相角逐的科技制高点,也是国家综合科技实力的体现,尤其是近几年,中国和美国在超算领域的竞争已经进入“白热化”。2020年,我国超级计算机在《全球超级计算机50...

2021-07-05 09:59:42 145

转载 精选| 2021年5月R新包推荐(第54期)

翻译:黄小伟,资深大数据分析从业者。目前就职杭州有赞数据分析团队!知乎专栏:中国R语言社区、R语言中文社区|26,000+关注、150万+阅读知乎圈子:数据分析圈|11,000+加入20...

2021-07-04 15:00:00 517

转载 清华姚班教师劝退文:读博,你真的想好了吗?

作者 | 张焕晨编辑| 琰琰第一次在知乎写东西就是一篇劝退贴 :D先简单介绍一下我的背景。我本科在University of Wisconsin-Madison,然后去CMU念了个PhD...

2021-07-03 10:00:00 219

转载 高薪招聘生物信息工程师-中国科学院深圳先进技术研究院合成所合成生物大设施...

合成生物大设施简介“合成生物研究重大科技基础设施”项目(以下简称“合成生物大设施”)是深圳市光明科学城优先启动和布局的重点项目之一,计划总投资约20亿人民币,中国科学院深圳先进技术研究院为...

2021-07-02 10:00:00 438

原创 这篇Nature子刊文章的蛋白组学数据PCA分析竟花费了我两天时间来重现|附全过程代码...

复现PCA原图之蛋白组学数据NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流程)、...

2021-07-02 10:00:00 887

转载 短小精悍-机器学习核心概念、模型、基础知识点简明手册-免费分享

该手册只有130页,整理了几乎所有关机机器学习的概念、模型、基础知识点,它将帮助读者快速回顾关于机器学习相关的核心知识点和重要公式、模型、概念。涉及概率模型、处理离散数据的生成模型...

2021-07-01 10:00:00 122

Masterminds of programming

  Description    Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. Think along with Adin D. Falkoff (APL), James Gosling (Java), Bjarne Stroustrup (C++), and others whose vision and hard work helped shape the computer industry. You'll find advice you can apply to systems you're developing, even if you don't use the specific languages being discussed.   Full Description   Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. In this unique collection, you'll learn about the processes that led to specific design decisions, including the goals they had in mind, the trade-offs they had to make, and how their experiences have left an impact on programming today. Masterminds of Programming includes individual interviews with:   * Adin D. Falkoff: APL   * Thomas E. Kurtz: BASIC   * Charles H. Moore: FORTH   * Robin Milner: ML   * Donald D. Chamberlin: SQL   * Alfred Aho, Peter Weinberger, and Brian Kernighan: AWK   * Charles Geschke and John Warnock: PostScript   * Bjarne Stroustrup: C++   * Bertrand Meyer: Eiffel   * Brad Cox and Tom Love: Objective-C   * Larry Wall: Perl   * Simon Peyton Jones, Paul Hudak, Philip Wadler, and John Hughes: Haskell   * Guido van Rossum: Python   * Luiz Henrique de Figueiredo and Roberto Ierusalimschy: Lua   * James Gosling: Java   * Grady Booch, Ivar Jacobson, and James Rumbaugh: UML   * Anders Hejlsberg: Delphi inventor and lead developer of C#   If you're interested in the people whose vision and hard work helped shape the computer industry, you'll find Masterminds of Programming fascinating.  

2010-12-26

gvim常用插件及其配置文件配置(下载解压即可使用)

gvim常用插件及其配置文件 支持c,perl,python,latex。 需要自己安装ctags .vim: after compiler doc indent ltags perl-support skeleton syntax autoload c-support ftdetect keymap Makefile plugin snipMate.vim.ct tools colors CVIMSYN ftplugin latextags Makefile.in README.csupport snippets .vim/after: ftplugin plugin syntax .vim/after/ftplugin: c_snippets.vim java_snippets.vim python_pydiction.vim python_snippets.vim sh_snippets.vim .vim/after/plugin: .vim/after/syntax: cpp.vim c.vim java.vim .vim/autoload: acp.vim perlsupportgui.vim perlsupportprofiling.vim perlsupportregex.vim snipMate.vim .vim/colors: desertEx.vim peachpuff.vim zenburn.vim .vim/compiler: tex.vim .vim/c-support: codesnippets doc rc scripts templates wordlists .vim/c-support/codesnippets: calloc_double_matrix.c main.cc print_array.cc.noindent calloc_int_matrix.c Makefile print_double_array.c.noindent main.c Makefile.multi-target.template print_int_array.c.noindent .vim/c-support/doc: ChangeLog c-hotkeys.pdf c-hotkeys.tex .vim/c-support/rc: customization.ctags customization.gvimrc customization.indent.pro customization.vimrc .vim/c-support/scripts: wrapper.sh .vim/c-support/templates: c.comments.template cpp.comments.template cpp.preprocessor.template c.statements.template c.cpp.template cpp.cpp.template cpp.statements.template Templates c.idioms.template cpp.idioms.template c.preprocessor.template Templates~ .vim/c-support/wordlists: c-c++-keywords.list c-c++-keywords.list.bak k+r.list stl_index.list .vim/CVIMSYN: engspchk.contraction engspchk.dialect engspchk.dict engspchk.match engspchk.proper engspchk.rare .vim/doc: acp.jax latexhelp.txt latex-suite-quickstart.css Makefile taglist.txt acp.txt latex-suite latex-suite-quickstart.html Makefile.in tags catalog.xml la

2010-08-17

Data Mining in Bioinformatics 生物信息中的数据挖掘

Jason T.L. Wang, Mohammed J. Zaki,Hannu T.T. Toivonen and Dennis Shasha (Eds) Summary The aim of this book is to introduce the reader to some of the best techniques for data mining in bioinformatics in the hope that the reader will build on them to make new discoveries on his or her own. The book contains twelve chapters in four parts, namely, overview, sequence and structure alignment, biological data mining, and biological data management.

2010-03-02

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition I. Clustering, II. Document retrieval and representation, III. Email surveillance and filtering, and IV. Anomaly detection. 著名大师Michael W. Berry的经典力作!

2010-03-02

比perl好的生物信息学语言python

比perl好的生物信息学语言python,简明教程!

2009-09-26

空空如也

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