RNA的.fasta数据转换为数字数据

最新推荐文章于 2022-11-20 16:38:47 发布
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分类专栏： 毕业设计 文章标签： python 生物 数据
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这篇博客介绍了如何将RNA的.fasta数据转换为数字数据，重点在于将.fasta格式的RNA_m5c数据集手动转化为.csv格式，并通过Anaconda_Spyder使用Python实现这一过程，最终生成了带有标签的m5c_N.csv和m5c_P.csv文件。
摘要由CSDN通过智能技术生成

特征转换：.fasta->.numerical

将.fasta格式的数据转换为数字格式的数据

.fasta格式1

在生物信息学中，FASTA格式（又称为Pearson格式），是一种基于文本用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来编码，且允许在序列前添加序列名及注释。— [百度百科]

RNA_m5c数据集

Supporting Information S1. The benchmark dataset consists of a positive dataset and a negative dataset. The former contains 120 true m5C site containing sequences with the m5C site in the center, while the latter contains 120 false m5C site containing sequences. Each of these segments is 41-bp long.
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BlueFishMan
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中原的博客
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DNA序列翻译为氨基酸
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perl 代码写的 DNA序列比对，用的是smith比对的算法，只要提交输入比较比对即可
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