文献Stepwise selection on homeologous PRR genes controlling flowering and maturity……

2020年Nature Genetics(SoyZH13_11G141200,SoyZH13_12G067700)

作物驯化的概念已经提出很久了，但是克隆到的驯化基因少之又少。本文作者克隆到两个控制大豆花期和成熟期的驯化基因Tof11和Tof12，二者通过抑制LHYs间接地促进E1表达，从而在长日照下推迟大豆开花。通过与大豆中其他三个重要的驯化基因比较，作者提出，在两个位点受到选择的过程中，伴随着大豆落粒性减弱以及种子休眠的打破过程，这些变化可能促进了作物向纬度扩展的趋势。

结果1:大豆品系的重测序
从跨越黄淮及华北地区收集到424个大豆品系并对其进行重测序。将重测序得到的全基因组SNPs标记用于系统进化树和PCA分析，划分得到三个组，即野生种、地方种、栽培种。观察花期和成熟期表型发现，相比于栽培种，野生种的花期和成熟期都显著推迟。说明大豆驯化、改良过程中都对花期进行了选择。

结果2:Tof11和Tof12位点的鉴定
Tof11和Tof12两个位点的初定位结果是通过三个群体共同得到的，分别是上述重测序的包含424个系的关联群体、之前报道过的包含809个系的关联群体、由H3和Harosoy为亲本的双亲F2群体。三个不同群体对两个位点的共定位足以说明，这两个位点在大豆进化过程中对其花期适应性变化的重要性。