Opencv系列4_opencv读取指定路径DCM并批量另存为JPG图像

 实例4：opencv读取指定路径DCM并批量另存为JPG图像

#include <iostream>
#include <io.h>  // 当中含有_finddata_t
#include <string>
#include <vector>

#include <opencv2/core/core.hpp>
#include <opencv2/highgui/highgui.hpp>
#include <opencv2/imgproc/imgproc.hpp>

#include <vtkSmartPointer.h>
#include <vtkImageViewer2.h>
#include <vtkImageCast.h>
#include <vtkDICOMImageReader.h>
#include <vtkRenderWindow.h>
#include <vtkRenderWindowInteractor.h>
#include <vtkRenderer.h>
#include <vtkImageData.h>
#include <vtkCoordinate.h>

using namespace std;
using namespace cv;

// 读入一个CT图，返回它的像素矩阵，使用OpenCV的Mat类型返回
// VTK读取DICOM图像并将像素值转给OpenCV的Mat对象
void dicomread(string inputFilename, Mat &img,vtkSmartPointer<vtkDICOMImageReader> &reader)
{
    img.create(512,512,CV_32SC1); 

	vtkSmartPointer<vtkImageCast> imageCast = 
		vtkSmartPointer<vtkImageCast>::New();

    reader->SetFileName(inputFilename.c_str());
	
    reader->Update();

	imageCast->SetInputConnection(reader->GetOutputPort());
	imageCast->SetOutputScalarTypeToInt();
	imageCast->Update();

	// 图像的基本信息
	int dims[3];
	reader->GetOutput()->GetDimensions(dims);
	
	//图像的像素值
	for(int k=0;k<dims[2];k++)
	{
	    for(int j=0;j<dims[1];j++)
		{
		    for(int i=0;i<dims[0];i++)
			{
				//转换数据类型，使用imagecast转到double（或float）
			    int* pixel = 
					(int*)(imageCast->GetOutput()->GetScalarPointer(i,j,k)); // 第i列第j行的像素值
				img.at<int>(j,i) = int(*pixel); // 第j行第i列的像素值
			}
		}
	}
}
//可视化DICOM图像
void showdicom(Mat I)
{
	double maxx=0,minn=0;
    double *max = &maxx;
	double *min = &minn;
	I.convertTo(I,CV_64FC1);
	minMaxIdx(I,min,max);
	for(int i=0;i<I.rows;i++)
	{
	    for(int j=0;j<I.cols;j++)
		{
		    I.at<double>(i,j) = 255*(I.at<double>(i,j)-minn)*1/(maxx-minn);
		}
	}
	
	minMaxIdx(I,min,max);
	for(int i=0;i<I.rows;i++)
	{
		for(int j=0;j<I.cols;j++)
			I.at<double>(i,j) = (I.at<double>(i,j)-minn)*1/(maxx-minn);
	}
	//cout << I <<endl;  //I为图像的像素值
	imshow("DICOM Image",I);
	waitKey(0);//等待键盘输入，程序继续运行
}

int main()
{
	//要读取的CT数据文件名
	string vc[8] = 
	{ 
		"1066244_20110617_CT_102_215_001.dcm" ,
		"1066244_20110617_CT_102_215_011.dcm" ,
		"1066244_20110617_CT_102_215_021.dcm" ,
		"1066244_20110617_CT_102_215_031.dcm" ,
		"1066244_20110617_CT_102_215_041.dcm" ,
		"1066244_20110617_CT_102_215_051.dcm" ,
		"1066244_20110617_CT_102_215_061.dcm" ,
		"1066244_20110617_CT_102_215_071.dcm" ,
	};
	int i = 0;
	char ad[128] = { 0 };
	for (int j = 0;j < 8;j++) {
		//指定要读取的CT数据文件位置
		string filename = "F:\\Software\\VTK8.2.0\\vtk1\\helloVtk\\CT\\" +   vc[i];//quarter  CT000895  1066244_20110617_CT_102_215_001
		i++;
		Mat I1;//I1为原图，G1为转化图
		vtkSmartPointer<vtkDICOMImageReader> reader =
			vtkSmartPointer<vtkDICOMImageReader>::New();
		// 读入dicom图
		dicomread(filename, I1, reader);
		//翻转图像
		flip(I1, I1, 0);
		//显示得到的Mat对象I1的信息*(单通道 大小512*512)
		cout << I1.channels() << "  " << I1.size() << endl;
		showdicom(I1);
		//指定路径对图像进行批量另存为JPG格式图像
		//给的另存路径和文件格式
		sprintf_s(ad, "F:\\Software\\VTK8.2.0\\vtk1\\helloVtk\\JPG_images\\%d.jpg", j);
		//保存
		imwrite(ad, I1);
	}
}

每按下空格，进行下一张图像读取和显示：

    

程序运行完后，在F:\Software\VTK8.2.0\vtk1\helloVtk\JPG_images路径下便可以查看另存的JPG图像：

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