经常遇到ct数据重采样,常规流程是将ct数据转为nifti数据,重采样,但是网上很少有人提到如何将nifti数据重新转换为dicom序列(我自己找的资料,基本上都有缺点,比如:成不了序列,序列逆序,灰度有问题等),为此我研究了一下。
在ct->nifti这个过程中,会丢失很多信息,如果要转换回来就要将必要数据补回来。我的做法是选择原ct文件的一个dcm数据作为模板,通过写入数据流和必要的信息来形成新的ct序列。
针对部分问题,我不细细说怎么做了,仅提供思路。
逆序,逆序一般是由于选择的工具导致的,比如你使用simpleitk和nibabel读nii.gz格式的数据,读出来的数据顺序就不一样,可以自己去查
灰度问题,ct值和hu值的概念要先搞清楚,和灰度显示的几个tag都在0028 tag里面,包括intercept,slope,Pixel Representation。搞清楚这几个tag的功能,就能避免灰度显示过白等其他问题
其他问题等我回头有时间再说