读取医学CT图像(.nii.gz/.dicom)

最新推荐文章于 2024-02-20 20:20:50 发布
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分类专栏： 医学图像 文章标签： python pytorch 深度学习
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SimpleITK和nibabel

SimpleITK 和 Nibabel 区别在于：（nii图像可以看成2维，也可以看成三维）

SimpleITK读取数据是（X，Y，Z）显示，Nibabel读取图像是（Z，Y，X）显示，也就是Nibabel加载的图像会旋转90°，其中X表示通道数，即切片层数。

SimpleITK

A_img = sitk.ReadImage(A_path)     
A1 = sitk.GetArrayFromImage(A_img)

nibabel

img_nii = nib.load(os.path.join(data_dir, name))
img_array = img_nii.get_fdata()
qq_44976409
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DICOM-RT struct转换为nii.gz
啷个哩个啷
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SimpleITK使用——6. DICOM-RT格式转换为nii.gz格式
啷个哩个啷
04-26 1671
其实Github上有很多这样的库和脚本，但是都大同小异，掌握关键那部分代码就可以。 要明确一点，SimpleITK不支持对DICOM-RT struct格式 大部分脚本都是用pydicom读取，然后再用numpy等进行切片等操作。 1. 使用MIScnn库来完成转换 安装 sudo pip install miscnn # linux pip install miscnn --user # Windows 使用 from miscnn.data_loading.interfaces.dicom_io
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09-16
主要介绍了读取nii或nii.gz文件中的信息即输出图像操作，具有很好的参考价值，希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
nii和.nii.gz医学图像数据的读取
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mvpboy123的博客
10-09 2077
#查看和显示nii.gz文件 import matplotlib matplotlib.use('TkAgg') from matplotlib import pylab as plt import nibabel as nib from nibabel import nifti1 from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D example_filename = r'C:\Users\320133514\Desktop\MY data\lung_data\nii.
医学图像nii.gz(dicom)文件转图片png
qq_44976409的博客
04-28 2763
nii2png import os import cv2 import numpy as np import nibabel as nib import SimpleITK as sitk from PIL import Image file_root = r'F:\' save_path = r'F:\' #file_list file_list = os.listdir(file_root) print(file_list) for img_name in file_list: if img
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weixin_45625450的博客
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