1.下载fslinstaller.py
官网下载地址:https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsldownloads_registration
或者去我的百度网盘取:
链接:https://pan.baidu.com/s/1d5eHm48oamFdYdKm84nifw
提取码:6ff9
2.将base环境改成python2.0版本
本来想在服务器安装,服务器没有sudo权限,网上很多教程都装不了,于是就自己安装虚拟机再装了一个ubuntu,然后安装了python2环境,再开始装fsl,fslinstaller.py需要在python2环境安装
2.1 查看python版本
ls /usr/bin/python*
如果有python2就修改一下python环境,如果本来就是python2,就直接跳到第三步。
2.2.1 修改python版本
在命令行输入:
vim ~/.bashrc
在文件末尾修改为自己的python2环境:
alias python='/usr/bin/python2.7'
然后按Esc健,输入:wq!保存修改,然后在命令行输入:
source ~/.bashrc
在命令行输入,查看python版本
python --version
2.2.2 安装python2
如果有python2了,可以跳过这一步,直接看下一步,因为我的虚拟机的ubuntu没有python2,所以重新安装了python2。
参考这个链接:
https://blog.csdn.net/weixin_41836744/article/details/89737978
3.安装FSL
3.1 运行fslinstaller.py
下载好fslinstaller.py安装程序后,终端cd到fslinstaller.py的存放目录后,在命令行输入:
python fslinstaller.py
会自动下载安装fsl软件并安装,期间一直按enter键就行。
安装过程有两个stage,第二个stage2可能会卡很久,耐心等待。结束后的显示内容如下:
因为还没有修改配置环境,现在输入fsl,还打不开
3.2 修改配置环境
在命令行输入:
vim ~/.bashrc
在文件末尾加上:
FSLDIR=/usr/local/fsl
. ${FSLDIR}/etc/fslconf/fsl.sh
PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH}
export FSLDIR PATH
然后按Esc健,输入:wq!保存修改,然后在命令行输入:
source ~/.bashrc
最后在命令行输入:
fsl
成功运行