nii格式和mat格式转化（只针对功能磁共振成像）

问题描述：

我是在对壳核分割的时候出现的这个问题，因为我要用分割出来的壳核或者是从wfupickatlas中定义的ROI来和自己设置的ROI来进行combine取交集。这时就出现了一个问题，前面定义的出来的格式是nii格式的，而用MarsBar定义的ROI是mat格式的，并且MarsBar只能识别mat格式的roi。于是上网查两者的格式如何转化，也有好多方法来实现互相转化，这里就不说了，因为并没有解决我的这个问题，我将nii转换为mat后MarsBar并不能识别。困惑了好久，才发现MarsBar本身就可以实现。。。。（有点尴尬）

具体方法：

方法其实很简单，MarsBar界面有个ROI definition，这个选项下面就有Import/Export两个按钮（之前一直没管过是干什么的，以后还是得多注意），直接演示吧。

nii转mat

因为MarsBar是mat格式的，因此选择Import导入按钮来进行转化：

点击Import，如下：

选择cluster image，点击：

然后，选择nii格式的图片，done

选择输出路径，然后Done，如下：

其他的默认就行

之后就转化成功了，如下，这里之所以是两个mat是因为Putamen是经过左右合并后的：

之后就可以选择view来查看了：

mat转nii

这里使用Export选项，操作如下：

点击cluster image，如下：

选择mat文件，done，如下：

选择输出文件：

文件名设置如下，回车即可。

nii结果如下：