Biomedical images dataset findings（1 Brain page）

Brain:

BraTs 12-20

MICCAI子会议；多模态（Flair, T1, T1c, T2）脑胶质瘤MRI图像及分级亚区标注（、肿瘤情况&年龄&生存时间记录）；数据来源：TCIA GBM + TCGA LGG 。需申请。

数据集分期：12-13,14-16,17-19,20.原始12-13数据集是由专家手动标注的，14-16使用的数据集混合了术前和术后的情况并且其标注是在12-13年排名靠前的算法基础上进行了融合的，17-19摒弃了14-16的数据使用12-13的数据，20版，对12-13数据做了评估、术前和术后做了区分并对术前的数据进行了标示。

数据集大小：.nii 18版 352例 285例train 67例valid

MRBrainS（13）

MICCAI子会议；3T下多模态(T1_1mm, T1, T1_IR, T2_Flair)脑MRI脑结构（灰、白、脑脊液）分割；数据来源：the UMC Utrecht (the Netherlands) of patients。需申请。

数据集大小：20例 5例train 15例valid

RSNA

19 Intracranial Hemorrhage Detect

检测急性颅内出血及其亚型（5种的probability）；需申请。

数据集大小：.dcm（帧） 72w+ train 12w+ test

OASIS

Longitudinal Neuroimaging, Clinical, and Cognitive Dataset for Normal Aging and Alzheimer’s Disease

正常衰老和阿尔茨海默氏病的纵向神经影像，临床和认知数据集；open

数据集大小：1000+例 2000+多模态MR（T1w, T2w, FLAIR, ASL, SWI, time of flight, resting-state BOLD, and DTI sequences） 1500+PET

Longitudinal MRI Data in Nondemented and Demented Older Adults

非痴呆和痴呆老年人的纵向MRI数据；open

数据集大小：150例 2-3次就诊/例 共计373次成像 单次3-4 T1w

Cross-sectional MRI Data in Young, Middle Aged, Nondemented and Demented Older Adults

年轻人，中年人，非痴呆症和痴呆症老年人的横截面MRI数据；open

数据集大小：416例 1-2次就诊/例 共430+次成像 单次3-4 T1w

ABIDE

自闭症患者预处理过的脑神经影像；open

数据集大小：539例 ASD患者 和 573例典型对照 共1112例结构和功能fMRI及其他信息

ADNI

阿尔兹海默症神经影像学倡议机构：旨在开发临床，影像学，遗传和生化生物标志物，以及早发现和追踪阿尔茨海默氏病（AD）。需申请

数据类型：临床、MRI、PET（、基因、生物样本）。其中MRI包括ADNI几期结构MRI，Flair，DTI，fMRI等预处理过或后处理过的，PET包含ADNI几期预处理或者后处理过的。

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ELSE ABOUT THE BRAIN：

IXI Dataset

Normal & healthy brain；open

数据集大小：近600例 1.5T 3T MR（T1, T2, PD-weighted, MRA, DWI）

Designed Database of MR Brain Images of Healthy Volunteers（10）

100位健康受试者的大脑多模态（T1, T2, MRA, DTI）图像；open

数据集大小：5G 100例

CuRIOUS19

MICCAI子会议；术前图像与术中脑超声图像（iUS）配准指导肿瘤切除；需申请

数据集大小：minc-2 nifit-1 33例 23例train 10例valid 术前MRI T1c & T2 Flair 术中iUS模态下标志物

brainTumorRetrieval（15）

南方医科大学个人；多脑肿瘤分类（3类）标签；open

数据集大小：233例 T1c图像单帧共计3064 

NeoBrainS（12）

MICCAI子会议；比较（半）自动算法，对新生儿脑组织进行分割，并使用T1和T2加权MRI扫描对相应的体积进行测量。

墓碑：目前比赛已结束，数据不可下载，但仍可用于算法评估。

Grand Challenges in Dental X-ray Image Analysis（15）

Challenge #1: A Grand Challenge for Automated Detection of Anatomical Landmarks and Analysis for Diagnosis in Cephalometric X-ray Image

头影X射线图像自动检测解剖位置和诊断分析；open

数据集：400例头部X线照片；train 150例；test1（线下） 150例；test2（现场） 100例

Challenge #2: A Grand Challenge for Computer-Automated Detection of Caries in Bitewing Radiography

咬翼射线图像中计算机自动检测龋齿；open

数据集：官方链接已失效；120例咬翼射线图像；train 40例；test1 40例；test2 40例

StructSeg（19）

MICCAI子会议；对鼻咽癌和肺癌这两种类型的癌症的危险器官（OAR）和总目标体积（GTV）进行分割；需申请

task 1：从头部和颈部CT扫描中进行器官风险分割。 task 2：鼻咽癌的总目标体积分割。 task 3：胸部CT扫描中的器官风险分割。 task 4：肺癌总目标体积分割。

数据集：task 1 train20 oar；test 10 oar；task 2 train 50 gtv；10 test gtv；task 3 train 6 oar；test 10 oar；task 4 50 train gtv；10 test

HECKTOR（20）

MICCAI子会议；在FDG-PET和CT图像中自动分割头颈部（H＆N）原发性肿瘤（重点是口咽癌）；需申请

数据集：train 201例 PET+ Ct +GTV标注；valid 53例

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Structures in brain:

Hippocampus

Target: Hippocampus head and body 

Modality: Mono-modal MRI 

Size: 394 3D volumes (263 Training + 131 Testing)

Source: Vanderbilt University Medical Center

Challenge: Segmenting two neighbouring small structures with high precision

Caudate: CAUSE '07

MICCAI子会议；比较不同算法从脑MRI中分割尾状核的性能；open

数据集：train 183M BWH 15例; IBSR 18例; valid 224M BWH 14例; UNC 33例

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暂不清楚：

DTI Tractography Challenge（12）

MICCAI子会议；比较使用软件生成的DTI mask在受控环境中以及在神经外科病例的临床工作流程中重建皮质脊髓束的束线照相算法性能；需申请

数据集：暂不清楚

FITBIR

联邦机构间创伤性脑损伤研究机构；针对颅脑外伤（TBI）美国国立卫生研究院（NIH）与国防部（DoD）牵头合作，旨在在整个TBI研究领域共享数据，并促进实验室之间的协作以及与其他信息学平台的互连性；

数据集：暂不清楚