X射线肺炎图像的检测(Detecting Pneumonia in X-Ray Image)

灵感:利用CNN网络从医学图像中检测和分类人类疾病的自动化方法。

1、首先我们先对图片进行相应的分析,胸部X线影像(前 - 后)选自广州市广州妇女儿童医学中心一至五岁儿科患者的胸透图片。总共有5840张图片,用其中的5216张用于训练模型,614用于测试,训练集中有3875张是患有肺炎的图片,1341张是正常的。所有胸部X射线成像均作为患者常规临床护理的一部分判定之一。

如下图为随机的两张正常的X射线图片
这里写图片描述

下面的是患有肺炎的X射线图
这里写图片描述
这里写图片描述
对于非专业的人来说,完全无法分辨是否患有肺炎。如果使用机器学习中的CNN网络实现对肺炎图片的分类,将会在很大程度上减少医生的工作量。

本次数据集分为3个文件夹(train,test,val(本次程序验证集直接使用的测试集)),并包含每个图像类别(Pneumonia / Normal)的子文件夹。有5,863个X射线图像(JPEG)和2个类别(肺炎/正常)。

相应的代码实现如下:

import numpy as np
from tensorflow.python import keras
from keras import layers
from keras.models import Model, Sequential
from keras.optimizers import Adam
from keras.preprocessing.image import ImageDataGenerator
from sklearn.metrics import classification_report, confusion_matrix
from mlxtend.plotting import plot_confusion_matrix
import matplotlib.pyplot as plt

导入需要用到的模块,用到的核心模块为keras模块,主要提供了卷积神经网络(CNN)的模型搭建函数,优化器,损失函数,图片预处理等实用的函数(keras官网:https://keras-cn.readthedocs.io/en/latest/)
创建训练集和测试集目录,如果要加入验证集,可以同时创建验证集目录,本次的验证集我直接调用的是测试集。

train_dir = "D:\\
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针对现有基于大数据和深度学习的目标检测框架对于高分辨率复杂大场景低分辨率小目标识别效果较差、多目标检测的精度和实时性难以平衡的问题,改进了基于深度学习的目标检测框架 SSD(single shot multibox detector),提出一种改进的多目标检测框架DRZ-SSD,将其专用于复杂大交通场景多目标检测检测以从粗到细的策略进行,分别训练一个低分辨率粗略检测器和一个高分辨率精细检测器,对高分辨率图像进行下采样获得低分辨率版本,设计了一种基于增强学习的动态区域放大网络框架(DRZN);动态放大低分辨率弱小目标区域至高分辨率再使用精细检测进行检测识别,剩余图像区域使用粗略检测进行检测,对弱小目标的检测与识别精度以及运算效率的提高效果明显;采用模糊阈值法调整自适应阈值策略在避免适应数据集的同时提高了模型的决策能力,显著降低了检测漏警率和虚警率。实验表明,改进后的DRZ-SSD在应对弱小目标、多目标、杂乱背景、遮挡等检测难度较大的情况时均能获得较好的效果。通过在指定数据集上的测试,相比于其他基于深度学习的目标检测框架,各类目标识别的平均准确率提高了4%~15%,平均准确率均值提高了约9%~16%,多目标检测率提高了13%~34%,检测识别速率达到38 fps,实现了算法精度与运行速率的平衡。
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