ADAM的使用~大数据工程师基因编程~~~

首先下载adam(我使用的是linux CentOS7)

git clone https://github.com/bigdatagenomics/adam.git

下载完毕后会出现一个adam的文件夹，我们去这个文件夹下

cd adam

之后准备安装，注意：adam是用scala和java,python写的。你必须有这2种环境，其中scala也是用java写的。

所以JDK必备（jdk很好安装，随便百度一下就弄好了，这里只是adam教程，不是给完全不懂计算机的小白准备的）

adam需要使用Mvn 构建安装，所以这里需要maven。地址http://maven.apache.org/install.html

下载了Linux的tar包后，丢到服务器上，然后根据上面的install安装（都很简单）

已经丢上去了，然后安装mvn

（根据官网安装完毕，我原来添加环境变量是在profile中，官网使用export,用完后真爽，在也不用profile了）

接下来在adam文件夹中，安装adam

mvn install

艹，然后报错了..它一些问题在处理poms文件的时候出现了错误。从错误上看，应该是pom文件出现了问题。

我在想原因，可能是因为，国内有墙的缘故，下载不下来。也许需要配置镜像源。于是去官网看了下

于是我查看了下hadoop version ...

发现是2.7,于是我又重新输入命令

 

成功了，哎英语不好，还不翻译，还要硬看，结果就是，给自己找麻烦。

真鸡儿慢~我觉得等我下好了，我是不是应该把它放到我的网站里，造福大家，提供个国内镜像？

最后，擦

还是报错，说明中国不能下载。

所以，我打算去官网向adam申请一下，中国的编译版本。等他们发给我，然后我在弄个国内的adam