GAT代码理解

GAT核心公式在这里插入图片描述

一、在layers.py中计算GraphAttentionLayer,选框内系数α的求法如下:在这里插入图片描述
W的求法如下:在这里插入图片描述
【1. 其中涉及到的xavier初始化方法
是为了使得每一层输出的方差应该尽量相等
在这里插入图片描述

#初始化w参数
nn.init.xavier_uniform_(self.W.data, gain=1.414)


计算Wh在这里插入图片描述
计算e在这里插入图片描述
需要注意的是此处求得的e值是所有顶点之间的e值,到了后面torch.where的时候才是计算的相邻节点之间的e值。在这里插入图片描述
计算Wh2的时候注意a的取值,感觉它是取了各自向量对应的权重,所以Wh1和Wh2不一样。在这里插入图片描述
张量之间维度不一样时相加
在这里插入图片描述

计算第二个公式,第一个attention即连接边对应的e值,第二个attention就是求得的注意力系数:在这里插入图片描述
【2. 此处torch.where涉及知识点:
torch.where(condition,a,b)其中输入参数condition:条件限制,如果满足条件,则选择a,否则选择b作为输出

attention = torch.where(adj > 0, e, zero_vec)

3 nn.softmax()函数中参数dim的用法。
对求得的attention系数进行dropout:在这里插入图片描述
(上图内容的参考资料)
在这里插入图片描述
计算第三个公式:在这里插入图片描述
【4. matmul维度不一样的矩阵做乘法时
5. 在下载数据集部分[utils.py],得到了a. 邻接矩阵;b. 特征; c. 标签; d. idx_train 训练索引; e. idx_val 验证索引;f. idx_test 测试索引
首先通过np.genfromtxt 导入数据
然后就是得到标签的独热编码在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
6. 等号两边的self.不一样,等号左边的是实例,等号右边的是参数
定义类的时候,若是添加_init_方法,那么在创建类的实例的时候,实例会自动调用这个方法,一般用来对实例的属性进行初始化
7.init函数的作用:对实例的属性进行初始化
8. 更详细的GAT解读可参考如下链接:https://blog.csdn.net/weixin_36474809/article/details/89401552】
以上。本次参考资料都已标明出处。

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### 回答1: GCN(Graph Convolutional Network)是一种用于图数据的深度学习模型,广泛应用于社交网络、推荐系统、生物学等领域。而PyTorch是一个基于Python深度学习框架,提供了高效的自动求导机制和丰富的神经网络模块。 在PyTorch中实现GCN通常包括以下几个步骤: 1. 数据准备:将图数据表示为邻接矩阵和特征矩阵的形式。邻接矩阵描述了图中节点之间的连接关系,特征矩阵则包含了每个节点的特征向量。 2. 定义图卷积层:在PyTorch中,可以通过定义一个继承自`nn.Module`的新类来实现图卷积层。此类通常包括权重矩阵、激活函数和前向传播函数。权重矩阵用于将当前节点的特征与相邻节点的特征进行线性组合,激活函数则引入非线性变换。 3. 构建GCN模型:利用上述定义的图卷积层构建一个多层的GCN模型。在PyTorch中,可以通过将多个图卷积层串联起来构建一个`nn.Sequential`模型。 4. 定义损失函数和优化器:根据任务的不同,可以选择适合的损失函数来评估模型的性能,如交叉熵损失函数。同时,需要选择合适的优化器,如Adam优化器,用于更新模型的参数。 5. 训练模型:使用训练数据对模型进行训练。在每个训练迭代中,通过前向传播计算模型的输出,并与真实标签进行比较以计算损失。然后,使用反向传播算法计算梯度,并利用优化器更新模型的参数。 6. 测试模型:使用测试数据对训练好的模型进行测试。通过前向传播计算模型的输出,并与真实标签进行比较以评估模型的性能。 需要注意的是,在实现GCN过程中,还可以对模型进行一些调优,如添加正则化项、使用dropout技术等,以增强模型的泛化能力。此外,还可以使用一些效果更好的GCN变体,如GraphSAGE、GAT等。 综上所述,使用PyTorch实现GCN的过程涉及数据准备、图卷积层定义、GCN模型构建、损失函数和优化器选择、模型训练和测试等环节。掌握了这些步骤后,就可以利用PyTorch实现自己的GCN模型,并在图数据上进行监督学习任务。 ### 回答2: Graph Convolutional Network (GCN) 是一种用于图数据的深度学习模型,它在节点级别上进行特征表示学习和预测。下面是对GCN代码PyTorch中的讲解。 GCN代码的主要结构如下: 1. 定义图结构:首先,需要定义节点之间的图结构。常见的方式是使用邻接矩阵来表示图中的连接关系。 2. 定义图卷积层:GCN的核心是图卷积层,它采用邻居节点的特征来更新目标节点的特征。在PyTorch中,可以使用torch.nn模块中的GraphConvolution类来实现。 - 在GraphConvolution类中,首先需要定义输入特征的维度和输出特征的维度。 - 在forward方法中,通过邻接矩阵和输入特征,计算每个节点的邻居节点的加权和。 - 然后,通过激活函数(如ReLU)进行非线性变换,得到更新后的特征表示。 - 最后,返回更新后的节点特征。 3. 定义整个GCN模型:GCN模型由多个图卷积层组成。在PyTorch中,可以通过定义一个包含多个图卷积层的类来实现。 - 在类的初始化方法中,定义每一层的输入特征维度、输出特征维度以及层数。 - 在forward方法中,将输入特征作为第一层的输入,并通过多个图卷积层进行特征的传递和更新。 - 返回最后一层的节点特征表示。 4. 数据准备和训练:在训练GCN模型之前,需要准备好带标签的图数据集。可以使用常见的数据处理库(如DGL、NetworkX等)来加载和处理图数据。然后,使用PyTorch的数据加载工具(如DataLoader)将数据转换为可供GCN模型使用的格式。 5. 定义损失函数和优化器:根据具体的问题,选择适合的损失函数和优化器。常见的损失函数包括交叉熵损失函数(CrossEntropyLoss),均方误差损失函数(MSELoss)等。优化器一般选择Adam、SGD等。 6. 模型训练和验证:使用准备好的训练数据和测试数据,对GCN模型进行训练和验证。通过计算损失函数进行参数更新,并根据验证结果确定模型的优化方向。 以上就是对GCN代码PyTorch中的基本讲解。通过构建图结构、定义图卷积层和整个GCN模型,准备数据并进行训练,可以实现对图数据进行特征表示学习和预测的任务。 ### 回答3: GCN(Graph Convolutional Network)是一种用于图结构数据的深度学习模型,旨在解决图结构数据上的节点分类、链接预测等问题。PyTorch是一种广泛使用的深度学习框架,提供了灵活且高效的计算图表示和自动微分功能。 GCN的PyTorch代码讲解可以从以下几个方面展开: 1. 数据准备:首先,需要将图结构数据表示为邻接矩阵或稀疏矩阵的形式,并将其作为PyTorch的Tensor输入。同时,还需准备标签数据作为模型的监督信号。 2. 模型定义:使用PyTorch构建GCN模型,可以继承`torch.nn.Module`类,并在`forward`函数中定义模型的前向传播逻辑。在GCN中,通常包括图卷积层和非线性激活函数。可以使用`torch.nn`模块提供的函数或自定义函数实现这些操作。 3. 图卷积层:GCN的核心是图卷积层,它在前一层节点的特征基础上,通过邻居节点的信息来更新每个节点的特征表示。可以使用`torch_geometric`等第三方库提供的图卷积层实现,也可以自己编写代码实现。 4. 优化器和损失函数:将模型输出与标签数据进行比较,并定义损失函数衡量模型预测与真实标签之间的差异。可选择常见的损失函数,例如交叉熵损失函数,并使用PyTorch提供的优化器,如随机梯度下降(SGD)或Adam优化器。 5. 训练过程:定义训练过程的具体逻辑,包括正向传播、计算损失、反向传播、更新模型参数等步骤。可以设置训练迭代次数和学习率等超参数,并使用训练集和验证集对模型进行训练和评估。 总之,GCN的PyTorch代码实现主要包括数据准备、模型定义、图卷积层的实现、优化器和损失函数的选择、以及训练过程的编写。深入理解GCN模型的原理和PyTorch的使用,可以更好地理解和运用GCN的PyTorch代码
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