自定义博客皮肤VIP专享

*博客头图:

格式为PNG、JPG,宽度*高度大于1920*100像素,不超过2MB,主视觉建议放在右侧,请参照线上博客头图

请上传大于1920*100像素的图片!

博客底图:

图片格式为PNG、JPG,不超过1MB,可上下左右平铺至整个背景

栏目图:

图片格式为PNG、JPG,图片宽度*高度为300*38像素,不超过0.5MB

主标题颜色:

RGB颜色,例如:#AFAFAF

Hover:

RGB颜色,例如:#AFAFAF

副标题颜色:

RGB颜色,例如:#AFAFAF

自定义博客皮肤

-+
  • 博客(5)
  • 收藏
  • 关注

原创 R语言零基础基因/数据差异分析-KEGG/MF/CC/BP分析(四)

这里写目录标题数据获取David数据获取David数据分析KEGG绘图GO绘图CC绘图BP绘图数据获取David数据获取David数据分析KEGG绘图GO绘图CC绘图BP绘图

2021-08-08 16:38:00 155

原创 R语言零基础基因/数据差异分析-热图分析(四)

文章目录结果展示需要的数据结构绘制方法结果展示需要的数据结构看过上一篇文章后,你需要自己整理好数据,这里我筛选出所需基因排序。绘制方法请仔细阅读代码,并修改部分你需要改的数据library(pheatmap)gene = read.csv(file.choose(), header = T, row.names = 1)pheatmap(log2(gene[, 1:6 #1:6指的是,我的数据是从第一列到第六列是需要计算的数据(B-G),Excel是从第0列开始数的,请按自己数

2021-07-16 14:25:34 174

原创 踩坑记录-GB_ACC转换基因-不允许有重复的‘row.names‘-R语言零基础基因/数据差异分析(三)

文章目录GB_ACC转换成基因基因的排序准备工具不允许有重复的'row.names'解决问题GB_ACC转换成基因在上个系列中,我们记住了 GB_ACC ,但制作热图,需要我们将其转换成基因,如果你不需要转换,前参考下一篇。转换方法如下:要复制的列:但在复制选择的列之前,我们需要对它进行排序,这个非常重要再删除重复,如图之后打开David,地址:https://david.ncifcrf.gov/由于我做的是人类基因,所以下图步骤3选择可能不同,请自己选择之后我们可点击下载文件

2021-07-16 14:11:51 541

原创 R语言零基础基因/数据差异分析(二)

文章目录结果展示安装ggplot2包制作方法注意,本 系列 有连贯性,每一步都很详细,每一步都很重要,请耐心读完!!结果展示安装ggplot2包如图操作找到并勾上即可。制作方法关于 基因啊选定标准,即logFC和FDR,请仔细阅读代码修改即可,这里给出的标准是:|log2(FC)| > 1 且 FDR < 0.01```r#选择文件df=read.csv(file.choose(), header = T #是否有标题,T表示有,F反之 )#加载包(反正多余

2021-07-15 15:20:54 180

原创 R语言零基础基因/数据差异分析(一)

文章目录介绍环境搭建软件下载结果展示基因数据下载流程基因数据处理利用GEO分析绘制拟火山图注意,本 系列 有连贯性,每一步都很详细,每一步都很重要,请耐心读完!!介绍 本系列文主要依据真实论文制图流程,详细说明制图过程, 其中包括: 1. 基因数据下载 2. 制图所需数据格式 3. 火山图制作流程 4. 聚类热图制作流程环境搭建软件下载移步至此学习结果展示基因数据处理注意删除末行注释基因数据下载流程以GSE137578基因为例,先下载 如图所示文件,并解压如图。

2021-07-15 14:47:17 213

空空如也

空空如也

空空如也

TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹

TA关注的人 TA的粉丝

提示
确定要删除当前文章?
取消 删除