结果展示
需要的数据结构
Q:这个表哪里来的?
A:他来自我的教程第一章开头介绍的,只不过把第一行改成了Symbol, a, b, c…
看过上一篇文章后,你需要自己整理好数据,这里我筛选出所需基因排序。
绘制方法
请仔细阅读代码,并修改部分你需要改的数据
library(pheatmap)
gene = read.csv(file.choose(), header = T, row.names = 1)
pheatmap(log2(gene[,
1:6 #1:6指的是,我的数据是从第一列到第六列是需要计算的数据(B-G),Excel是从第0列开始数的,请按自己数据改
]+1),labels_row = gene$
Symbol #需要改,这里是文档第一列开头名,按自己改
,main=
"Heatmap" #标题名,可自己改
,color = colorRampPalette(c("blue","white","red"))(256)
)
输入后回车,选择你的数据文件即可