poj1080

题目大意是:给定两组DNA序列,要你求出它们的最大相似度

每个字母与其他字母或自身和空格对应都有一个打分,求在这两个字符串中插入空格,让这两个字符串的匹配分数最大

 

思路:忙着效率刷题,一时间没想到思路借鉴了一下网上的思路。。。。该题的动态规划推导如下:

dp[i][j]=max(dp[i-1][j-1]+m(s1[i],s2[j]),dp[i][j-1]+m('-',s2[j]),dp[i-1][j]+m(s1[i],'-'));

i表示s1字符串中,第i个字符

j表示s2字符串中,第j个字符

边界条件无非就是处理dp[i][0](0<=i<=n1)时和dp[0][j](0<=j<=n2)时的情况

#include<cstdio>
#include<iostream>
#include<cstring>
#include<map>
using namespace std;
int dp[200][200];
int m[][5]={{5,-1,-2,-1,-3},  
                {-1,5,-3,-2,-4},  
                {-2,-3,5,-2,-2},  
                {-1,-2,-2,5,-1},  
                {-3,-4,-2,-1,0}};
map<int,int> mp; 
void init()
{
	mp.clear();
	mp['A']=0;
	mp['C']=1;
	mp['G']=2;
	mp['T']=3;
	mp['-']=4;
}
int main()
{
	//FILE *fp=fopen("t.txt","r");
	int n,n1,n2;
	char s1[200],s2[200];
	init();
	scanf("%d",&n);
	while(n--)
	{
		scanf("%d%s%d%s",&n1,s1+1,&n2,s2+1);
		dp[0][0]=0;
		int t=0;
		for(int i=1;i<=n1;i++)
		{
			
			 t+=m[mp[s1[i]]][4];
			 dp[i][0]=t;			
		}
		t=0;
		for(int i=1;i<=n2;i++)
		{
			
			 t+=m[4][mp[s2[i]]];
			 dp[0][i]=t;			
		}
		for(int i=1;i<=n1;i++)
		{
			for(int j=1;j<=n2;j++)
			{
				dp[i][j]=max(dp[i-1][j-1]+m[mp[s1[i]]][mp[s2[j]]],dp[i][j-1]+m[4][mp[s2[j]]]);
				dp[i][j]=max(dp[i][j],dp[i-1][j]+m[mp[s1[i]]][4]);
			}
		}
		printf("%d\n",dp[n1][n2]);
	}
	return 0;
}

 

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