题目链接:http://poj.org/problem?id=1080
题干要求:
给定两个字符串(ATCG)用-补齐,不同的字符对(--无定义)会有不同权值,要求权值和最大
(字符串长度不超过100)
考虑:
一开始的思路是找最大子列,但是思考以后有以下几个问题:
当有两个相同长度的最大子列时如何处理
当最大子列一个对应尾端一个对应非尾端,是否有可能添加-导致和更小,如果有怎么处理
那么简单的通过寻找最大子列并不能较好的解决问题,然后寻找其他最优子结构:
由于后项字符不影响前子字符串的结果,即满足最优子结构
记字符串X的长度为n,字符串Y的长度为m
考虑以下状态转移方程
如果X[i]==Y[j]
DP[i][j]=DP[i-1][j-1]+权值
如果不相等
DP[i][j]=max(DP[i][j-1]+权值,DP[i-1][j]+权值,DP[i-1][j-1]+权值)
解释一下相等情况下很好想,去掉末尾总和加5
不相等的情况分别对应(-,Y[j]) (X[i],-)(X[i],Y[j]) //其实还有(-,-)的可能但是无定义所以不考虑
观察到存在重叠子结构特征,故dp有效
附上ac代码
#include<iostream>
#include<cstring>
#include<cstdio>
#include<algorithm>
#include<map>
#define MEMSET(a) memset(a,0,sizeof(a))
#define GI(a) Getindex[a]
using namespace std;
const int MAXN=105;
int V[5][5]={
{5,-1,-2,-1,-3},
{-1,5,-3,-2,-4},
{-2,-3,5,-2,-2},
{-1,-2,-2,5,-1},
{-3,-4,-2,-1,0}
};
int n,m;
char X[MAXN];
char Y[MAXN];
int DP[MAXN][MAXN];
map<char,int> Getindex;
int dp(int i,int j){
if(DP[i][j])
return DP[i][j];
if(i==0&&j==0)
DP[i][j]=0;
else if(i==0&&j)
DP[i][j]=dp(i,j-1)+V[GI('-')][GI(Y[j])];
else if(j==0&&i)
DP[i][j]=dp(i-1,j)+V[GI(X[i])][GI('-')];
else{
if(X[i]==Y[j])
DP[i][j]=dp(i-1,j-1)+5;
else{
int t1,t2,t3;
t1=dp(i-1,j-1)+V[GI(X[i])][GI(Y[j])];
t2=dp(i-1,j)+V[GI(X[i])][GI('-')];
t3=dp(i,j-1)+V[GI('-')][GI(Y[j])];
DP[i][j]=max(t1,max(t2,t3));
}
}
return DP[i][j];
}
int main(){
Getindex.clear();
Getindex['A']=0;
Getindex['C']=1;
Getindex['G']=2;
Getindex['T']=3;
Getindex['-']=4;
int T;
scanf("%d",&T);
while(T--){
MEMSET(X);
MEMSET(Y);
MEMSET(DP);
scanf("%d",&n);
scanf("%s",&X[1]);
scanf("%d",&m);
scanf("%s",&Y[1]);
dp(n,m);
printf("%d\n",DP[n][m]);
}
return 0;
}