RDKit新手入门

RDKit新手入门

一、RDKit是什么？

开源的化学信息工具包

• 采用了商业友好的BSD协议
• 核心数据结构和算法用C++实现
• 通过Boost.Python技术对RDKit进行封装，提供Python2/Python3的接口
• 通过SWIG技术提供Java 和C# 接口
• 提供了大量对化学分子2D/3D的计算操作
• 生成用于机器学习的分子描述符
• 基于PostgreSQL搭建分子数据库
• KNIME中的化学信息计算支持（https://www.knime.com/rdkit）

二、安装

打开anaconda promt,直接在base环境下安装rdkit,当然也可以换一个环境。

conda install -c rdkit rdkit

或者

pip install rdkit

在anaconda promt 中测试是否安装成功。在cmd中输入

python
>import rdkit
>r