RDKit新手入门

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RDKit新手入门

一、RDKit是什么?

开源的化学信息工具包

  • 采用了商业友好的BSD协议
  • 核心数据结构和算法用C++实现
  • 通过Boost.Python技术对RDKit进行封装,提供Python2/Python3的接口
  • 通过SWIG技术提供Java 和C# 接口
  • 提供了大量对化学分子2D/3D的计算操作
  • 生成用于机器学习的分子描述符
  • 基于PostgreSQL搭建分子数据库
  • KNIME中的化学信息计算支持(https://www.knime.com/rdkit)

二、安装

打开anaconda promt,直接在base环境下安装rdkit,当然也可以换一个环境。

_images/conda_prompt2020-02-07_144539.460282.png

conda install -c rdkit rdkit

或者

pip install rdkit

在anaconda promt 中测试是否安装成功。在cmd中输入

python
>import rdkit
>
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