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分类专栏： tips 文章标签： github

于 2021-05-18 09:35:43 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/qq_40226557/article/details/116975839

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软件

zsh下的homebrew安装与使用
- 安装
- 使用
MACBOOK如何编辑pdf文件
SExtractor使用
- 格式：
- 关于sextractor中的模型拟合：
WebbPSF
- webbpsf的网址在[这里](https://webbpsf.readthedocs.io/en/latest/intro.html)
DS9
FAST code
- best fit的图纵坐标有问题
FASTpp code
TexShop
- TexShop 使用 .bib 文件来引用参考文献：
Photutils, GALFIT, Source Extractor 坐标问题

zsh下的homebrew安装与使用

安装

用中科大的镜像：

/usr/bin/ruby -e "$(curl -fsSL https://cdn.jsdelivr.net/gh/ineo6/homebrew-install/install)"

如果出现下面问题：

==> Tapping homebrew/core
Cloning into '/usr/local/Homebrew/Library/Taps/homebrew/homebrew-core'...

用control+c中断并执行以下命令：

cd "$(brew --repo)/Library/Taps/"
mkdir homebrew && cd homebrew
git clone git://mirrors.ustc.edu.cn/homebrew-core.git

安装成功，会有提示。
安装教程参见：https://blog.csdn.net/Alphoseven/article/details/104373758

使用

用brew --help查看可用命令，brew可用命令如下：

Example usage:
  brew search TEXT|/REGEX/
  brew info [FORMULA|CASK...]
  brew install FORMULA|CASK...
  brew update
  brew upgrade [FORMULA|CASK...]
  brew uninstall FORMULA|CASK...
  brew list [FORMULA|CASK...]

Troubleshooting:
  brew config
  brew doctor
  brew install --verbose --debug FORMULA|CASK

Contributing:
  brew create URL [--no-fetch]
  brew edit [FORMULA|CASK...]

Further help:
  brew commands
  brew help [COMMAND]
  man brew
  https://docs.brew.sh

MACBOOK如何编辑pdf文件

macbook自带的preview功能很强大，可以插入文字，签名，还能插入图片。
插入文字，签名：tools -> annotate
或者直接点工具栏的铅笔外面有圆圈的图标就好了。
插入图片，原文在这里url：先用preview打开你要插入的图片。command+A 选中图片，command+C 复制图片，command+V 粘贴图片成物体(object)，注意这个时候你粘贴的图片会覆盖原来的图片，所以最好把原图copy一个再操作。然后再command+C 复制这个object，现在可以打开pdf文件，粘贴了。

SExtractor使用

格式：

sex xxx.fits -c xxx.sex

关于sextractor中的模型拟合：

如果需要sextractor去拟合sersic模型等，需要提供psf文件。这个psf官方是用psfex来生成的，当然可以自己叠加恒星生成psf图像。
但是通过自己叠加恒星生成的图像需要修改才能被sextractor用。
具体改以下几项，下面是生成108x108的psf，x都是根据数据来改的，其他的都固定，除了3个PSFAXIS：

LOADED=X
ACCEPTED=X
CHI2=X
POLNAXIS=0
POLNGRP=0
PSF_FWHM=X
PSF_SAMP=X
PSFNAXIS=3
PSFAXIS1=108
PSFAXIS2=108
PSFAXIS3=1

WebbPSF

webbpsf的网址在这里

安装之前要卸载系统里已经有的webbpsf和poppy！
可以直接

$ pip install webbpsf

但是这种方法没办法及时获取更新，比如会使用jwst还没上天的psf模型等，这个没上天之前的psf的大小比上天之后在轨测试的psf小。
使用官网的github安装方式：

$ pip install -e git+https://github.com/spacetelescope/poppy.git#egg=poppy
$ pip install -e git+https://github.com/spacetelescope/webbpsf.git#egg=webbpsf

有时候会报错：

error: subprocess-exited-with-error
note: This error originates from a subprocess, and is likely not a problem with pip.

这是因为你系统中安装的setuptools版本太低了，这种错通常还伴随提示：

/private/var/folders/ml/2xwf3qp50n90n4n64349v4gr0000gn/T/pip-build-env-5j_uea_y/overlay/lib/python3.8/site-packages/setuptools_scm/integration.py:27: RuntimeWarning:
    ERROR: setuptools==41.2.0 is used in combination with setuptools_scm>=6.x
    
    Your build configuration is incomplete and previously worked by accident!
    setuptools_scm requires setuptools>=45
    
    
    This happens as setuptools is unable to replace itself when a activated build dependency
    requires a more recent setuptools version
    (it does not respect "setuptools>X" in setup_requires).
    
    
    setuptools>=31 is required for setup.cfg metadata support
    setuptools>=42 is required for pyproject.toml configuration support
    
    Suggested workarounds if applicable:
     - preinstalling build dependencies like setuptools_scm before running setup.py
     - installing setuptools_scm using the system package manager to ensure consistency
     - migrating from the deprecated setup_requires mechanism to pep517/518
       and using a pyproject.toml to declare build dependencies
       which are reliably pre-installed before running the build tools

解决方法就是，先卸载系统里的低版本setuptools，然后再安装高版本setuptools：

$ sudo pip uninstall setuptools
$ pip install setuptools

然后再从github上安装webbpsf和poppy。或者从github上clone下来，然后直接进到文件夹里pip安装。

$ git clone https://github.com/spacetelescope/poppy.git#egg=poppy
$ git clone https://github.com/spacetelescope/webbpsf.git#egg=webbpsf
$ pip install -e webbpsf
$ pip install -e poppy

参考这个网址

DS9

哈佛网站，之前更新过一次，后来的新下载地址在这里

FAST code

Mariska Kriek (University of California, Berkeley)
网址，现在这个网址进不去了。。。可能开始使用FASTpp了，不推FAST了
找到download，选择最新的版本下载
下载好解压以后，运行execution，然后报错，说是idl版本太低。
然后查上面的网址的FAQ，说是可以通过从新制作execution解决，解决方法如下：
在下载fast的根目录里还有一个文件是mkexe.idl，也一并下载下来
然后把这个文件拷到刚刚下载的fast包中的idl文件夹，然后从这个idl文件夹下进入终端，输入下列命令：
idl mkexe.idl -arg fast
然后就会在当前目录生成一个新的fast的execution，替换原来fast文件夹下的execution就可以了。
起初我以为是把mkexe.idl拷到当时安装idl语言的文件夹下，然后就出错了。