决策树入门
决策树介绍
决策树是一种常见的分类模型，在金融分控、医疗辅助诊断等诸多行业具有较为广泛的应用。决策树的核心思想是基于树结构对数据进行划分，这种思想是人类处理问题时的本能方法。例如在婚恋市场中，女方通常会先看男方是否有房产，如果有房产再看是否有车产，如果有车产再看是否有稳定工作……最后得出是否要深入了解的判断。
决策树的主要优点：
具有很好的解释性，模型可以生成可以理解的规则。
可以发现特征的重要程度。
模型的计算复杂度较低。
决策树的主要缺点：
模型容易过拟合，需要采用减枝技术处理。
不能很好利用连续型特征。
预测能力有限，无法达到其他强监督模型效果。
方差较高，数据分布的轻微改变很容易造成树结构完全不同。
伪代码流程：
决策树的构建过程是一个递归过程。函数存在三种返回状态：（1）当前节点包含的样本全部属于同一类别，无需继续划分；（2）当前属性集为空或者所有样本在某个属性上的取值相同，无法继续划分；（3）当前节点包含的样本集合为空，无法划分。
决策树的关键在于line6.从A中选择最优划分属性a∗，一般我们希望决策树每次划分节点中包含的样本尽量属于同一类别，也就是节点的“纯度”更高。
划分选择
1.信息增益
信息熵是一种衡量数据混乱程度的指标，信息熵越小，则数据的“纯度”越高
其中pk代表了第k类样本在D中占有的比例。
一般的信息增益越大，则意味着使用特征a来进行划分的效果越好。
决策树实践
第一步导入库函数
## 基础函数库
import numpy as np
import pandas as pd
## 绘图函数库
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
第二步数据载入
## 我们利用Pandas自带的read_csv函数读取并转化为DataFrame格式
data = pd.read_csv('datalab/531811/Datawhale/penguins_raw.csv')
## 为了方便我们仅选取四个简单的特征，有兴趣的同学可以研究下其他特征的含义以及使用方法
data = data[['Species','Culmen Length (mm)','Culmen Depth (mm)',
'Flipper Length (mm)','Body Mass (g)']]
本次我们选择企鹅数据（palmerpenguins）进行方法的尝试训练，该数据集一共包含8个变量，其中7个特征变量，1个目标分类变量。共有150个样本，目标变量为 企鹅的类别 其都属于企鹅类的三个亚属，分别是(Adélie, Chinstrap and Gentoo)。包含的三种种企鹅的七个特征，分别是所在岛屿，嘴巴长度，嘴巴深度，脚蹼长度，身体体积，性别以及年龄。
第三步查看数据
## 利用.info()查看数据的整体信息
data.info()
## <class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
## RangeIndex: 344 entries, 0 to 343
## Data columns (total 5 columns):
## Species 344 non-null object
## Culmen Length (mm) 342 non-null float64
## Culmen Depth (mm) 342 non-null float64
## Flipper Length (mm) 342 non-null float64
## Body Mass (g) 342 non-null float64
## dtypes: float64(4), object(1)
## memory usage: 13.6+ KB
## 进行简单的数据查看，我们可以利用 .head() 头部.tail()尾部
data.head()
这里我们发现数据集中存在NaN，一般的我们认为NaN在数据集中代表了缺失值，可能是数据采集或处理时产生的一种错误。这里我们采用-1将缺失值进行填补。
data = data.fillna(-1)
data.tail()
## 其对应的类别标签为'Adelie Penguin', 'Gentoo penguin', 'Chinstrap penguin'三种不同企鹅的类别。
data['Species'].unique()
## array(['Adelie Penguin (Pygoscelis adeliae)',
## 'Gentoo penguin (Pygoscelis papua)',
## 'Chinstrap penguin (Pygoscelis antarctica)'], dtype=object)
## 利用value_counts函数查看每个类别数量
pd.Series(data['Species']).value_counts()
## Adelie Penguin (Pygoscelis adeliae) 152
## Gentoo penguin (Pygoscelis papua) 124
## Chinstrap penguin (Pygoscelis antarctica) 68
## Name: Species, dtype: int64
## 对于特征进行一些统计描述
data.describe()
第四步可视化描述
## 特征与标签组合的散点可视化
sns.pairplot(data=data, diag_kind='hist', hue= 'Species')
plt.show()
'''为了方便我们将标签转化为数字
'Adelie Penguin (Pygoscelis adeliae)' ------0
'Gentoo penguin (Pygoscelis papua)' ------1
'Chinstrap penguin (Pygoscelis antarctica) ------2 '''
def trans(x):
if x == data['Species'].unique()[0]:
return 0
if x == data['Species'].unique()[1]:
return 1
if x == data['Species'].unique()[2]:
return 2
data['Species'] = data['Species'].apply(trans)
for col in data.columns:
if col != 'Species':
sns.boxplot(x='Species', y=col, saturation=0.5, palette='pastel', data=data)
plt.title(col)
plt.show()
# 选取其前三个特征绘制三维散点图
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
fig = plt.figure(figsize=(10,8))
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
data_class0 = data[data['Species']==0].values
data_class1 = data[data['Species']==1].values
data_class2 = data[data['Species']==2].values
# 'setosa'(0), 'versicolor'(1), 'virginica'(2)
ax.scatter(data_class0[:,0], data_class0[:,1], data_class0[:,2],label=data['Species'].unique()[0])
ax.scatter(data_class1[:,0], data_class1[:,1], data_class1[:,2],label=data['Species'].unique()[1])
ax.scatter(data_class2[:,0], data_class2[:,1], data_class2[:,2],label=data['Species'].unique()[2])
plt.legend()
plt.show()
第五步建模预测
## 为了正确评估模型性能，将数据划分为训练集和测试集，并在训练集上训练模型，在测试集上验证模型性能。
from sklearn.model_selection import train_test_split
## 选择其类别为0和1的样本 （不包括类别为2的样本）
data_target_part = data[data['Species'].isin([0,1])][['Species']]
data_features_part = data[data['Species'].isin([0,1])][['Culmen Length (mm)','Culmen Depth (mm)',
'Flipper Length (mm)','Body Mass (g)']]
## 测试集大小为20%， 80%/20%分
x_train, x_test, y_train, y_test = train_test_split(data_features_part, data_target_part, test_size = 0.2, random_state = 2020)
## 从sklearn中导入决策树模型
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
from sklearn import tree
## 定义 决策树模型
clf = DecisionTreeClassifier(criterion='entropy')
## 在训练集上训练决策树模型
clf.fit(x_train, y_train)
## DecisionTreeClassifier(class_weight=None, criterion='entropy', max_depth=None,
## max_features=None, max_leaf_nodes=None,
## min_impurity_decrease=0.0, min_impurity_split=None,
## min_samples_leaf=1, min_samples_split=2,
## min_weight_fraction_leaf=0.0, presort=False, random_state=None,
## splitter='best')
## 可视化
## 本段代码实际效果为本地生成PDF可视化文档，在体验过程中可以不运行，可能无法正常展示结果；
## 代码生成的可视化结果会截图展示实际效果
import graphviz
dot_data = tree.export_graphviz(clf, out_file=None)
graph = graphviz.Source(dot_data)
graph.render("penguins")
## 'penguins.pdf'
## 在训练集和测试集上分布利用训练好的模型进行预测
train_predict = clf.predict(x_train)
test_predict = clf.predict(x_test)
from sklearn import metrics
## 利用accuracy（准确度）【预测正确的样本数目占总预测样本数目的比例】评估模型效果
print('The accuracy of the Logistic Regression is:',metrics.accuracy_score(y_train,train_predict))
print('The accuracy of the Logistic Regression is:',metrics.accuracy_score(y_test,test_predict))
## 查看混淆矩阵 (预测值和真实值的各类情况统计矩阵)
confusion_matrix_result = metrics.confusion_matrix(test_predict,y_test)
print('The confusion matrix result:\n',confusion_matrix_result)
# 利用热力图对于结果进行可视化
plt.figure(figsize=(8, 6))
sns.heatmap(confusion_matrix_result, annot=True, cmap='Blues')
plt.xlabel('Predicted labels')
plt.ylabel('True labels')
plt.show()
## The accuracy of the Logistic Regression is: 0.9954545454545455
## The accuracy of the Logistic Regression is: 1.0
## The confusion matrix result:
## [[31 0]
## [ 0 25]]
在三分类(多分类)上 进行训练和预测
## 测试集大小为20%， 80%/20%分
x_train, x_test, y_train, y_test = train_test_split(data[['Culmen Length (mm)','Culmen Depth (mm)',
'Flipper Length (mm)','Body Mass (g)']], data[['Species']], test_size = 0.2, random_state = 2020)
## 定义 决策树模型
clf = DecisionTreeClassifier()
# 在训练集上训练决策树模型
clf.fit(x_train, y_train)
## DecisionTreeClassifier(class_weight=None, criterion='gini', max_depth=None,
## max_features=None, max_leaf_nodes=None,
## min_impurity_decrease=0.0, min_impurity_split=None,
## min_samples_leaf=1, min_samples_split=2,
## min_weight_fraction_leaf=0.0, presort=False, random_state=None,
## splitter='best')
## 在训练集和测试集上分布利用训练好的模型进行预测
train_predict = clf.predict(x_train)
test_predict = clf.predict(x_test)
## 由于逻辑回归模型是概率预测模型（前文介绍的 p = p(y=1|x,\theta)）,所有我们可以利用 predict_proba 函数预测其概率
train_predict_proba = clf.predict_proba(x_train)
test_predict_proba = clf.predict_proba(x_test)
print('The test predict Probability of each class:\n',test_predict_proba)
## 其中第一列代表预测为0类的概率，第二列代表预测为1类的概率，第三列代表预测为2类的概率。
## 利用accuracy（准确度）【预测正确的样本数目占总预测样本数目的比例】评估模型效果
print('The accuracy of the Logistic Regression is:',metrics.accuracy_score(y_train,train_predict))
print('The accuracy of the Logistic Regression is:',metrics.accuracy_score(y_test,test_predict))
# The test predict Probability of each class:
# [[0. 0. 1.]
# [0. 1. 0.]
# [0. 1. 0.]
# [1. 0. 0.]
# …………
# [0. 1. 0.]
# [0. 0. 1.]
# [1. 0. 0.]
# [1. 0. 0.]]
# The accuracy of the Logistic Regression is: 0.996363636364
# The accuracy of the Logistic Regression is: 0.971014492754
## 查看混淆矩阵
confusion_matrix_result = metrics.confusion_matrix(test_predict,y_test)
print('The confusion matrix result:\n',confusion_matrix_result)
# 利用热力图对于结果进行可视化
plt.figure(figsize=(8, 6))
sns.heatmap(confusion_matrix_result, annot=True, cmap='Blues')
plt.xlabel('Predicted labels')
plt.ylabel('True labels')
plt.show()
# The confusion matrix result:
# [[30 1 0]
# [ 0 23 0]
# [ 2 0 13]]
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