R手册--目录

R手册

说明：本手册所列包基本来自AwesomeR ，结合 GitHub 和help(package="pk_name")官方文档整理所得，有助于使用时下最实用的包对R进行深入的学习。
致谢，ApacheCN 中文开源组织：致力于官方文档及AI书籍中文翻译。

其中

• 标记 ☑️ 是必修课
• 标记 ⬜️ 待定
• 标记 ❤️ 是选修课

Common

• ☑️ R语言入门: 包括Rstudio介绍，R的数据结构和基础语法等
• ☑️ R语言基础包：base, stats等基础包函数
• ☑️ R6 and S4：面向对象
• ☑️ tidyverse+tibble：Hadley包集合，核心包(ggplot2,tibble,tidyr,readr,purrr,dplyr)
• ☑️ data.table：简短的代码实现快速操作数据
• ❤️ devtools：使开发R包变得更简单(Hadley) (Update according to [cheat sheets][sheet])
• ❤️ rpy2：Python 通过rpy2调用 R语言

Syntax

• ☑️ purrr：函数化编程(FP, functional programming) (Hadley)
• ⬜️ lambda.r：R中的函数式编程和简单模式匹配
• ☑️ magrittr：Let’s pipe it
• ❤️ pipeR：多范式管道编程

Import

• ☑️ readr：快速读取文本型数据(csv,tsv,and fwf).(Hadley)
• ☑️ readxl：for excel files.(Hadley)
• ☑️ openxlsx：丰富的excel处理工具
• ❤️ jsonlite：JSON处理.(Hadley)
• ⬜️ haven：for SPSS,SAS and Stata files.(Hadley)
• ❤️ feather：for sharing with Python and other languages.(Hadley)

DATABASE MANAGEMENT

• ❤️ DBI：数据库统一接口(Hadley)
• ❤️ RHive：通过Apache Hive促进分布式计算的R扩展

WEB TECHNOLOGIES

• ❤️ RCurl：用于R的通用网络(HTTP/FTP/ …)接口
• ☑️ httr：for web APIs (RCurl升级版) (Hadley) (Update according to GitHub)
• ☑️ rvest：web scraping (Hadley) (Update according to GitHub)
• ☑️ xml2：解析XML文件 (Hadley) (Update according to GitHub)

Tidy+Transform

DATA MANIPULATION

• ☑️ tidyr：清理数据，reshape2替代版(Hadley)
• ☑️ dplyr and plyr：数据操作(Hadley)
• ⬜️ rlist：用于list(非规整)数据操作工具箱
• ☑️ stringr：for strings.(Hadley)
• ⬜️ utf8：处理和修复R中的多种文本编码问题
• ☑️ 正则表达式：Regular Expression
• ☑️ lubridate+hms：for date and times(Hadley)
• ☑️ forcats：for factors(Hadley)
• ⬜️ sjmisc：各种实用功能的集合，支持数据重编码，缺失值处理等，与dplyr包无缝协作。
• ☑️ naniar：缺失数据概述和可视化
• ☑️ simputation：缺失数据插补框架

LARGE DATASETS

• ⬜️ ff：在内存外存储数据，处理起来和在内存一样
• ⬜️ bigmemory：内存外存储，操作，big 系列包提供了其他工具，包括线性模型 (biglm) 和随机森林 (bigrf)。

Visualise

GRAPHIC DISPLAYS

• ☑️ RColorBrewer and extrafont：调色板和字体
• ☑️ ggmap+baidumap：使用ggplot2在R中绘制静态地图
• ☑️ ggpubr：ggplot2封装，用于绘制适合出版物要求的图形
• ❤️ corrplot：相关矩阵或一般矩阵的图形显示
• ⬜️ misc3d：处理3D图，等值面等
• ☑️ ggplot2：强大的绘图系统，并实现了许多扩展(Hadley)
• ☑️ ggplot2 extensions: ggplot2扩展，包括各种补充图形，坐标系统，主题等。

HTML WIDGETS

• ❤️ leaflet+leafletCN：最流行的JavaScript库交互式地图之一，动态交互地图。
• ☑️ Remap：简易动态交互地图(基于Echarts)。
• ❤️ rCharts：来自R的交互式JS图表。
• ⬜️ DiagrammeR：在R中创建JS图形和流程图。
• ⬜️ rbokeh：R与Bokeh的接口。
• ❤️ plotly：R的交互式图形库，基于ggplot2 和shiny。

Parallel Computing

• ❤️ foreach：在循环(loop)中并行化运算

MapReduce

• ❤️ SparkR：Spark的R前端
• ❤️ sparklyr：来自RStudio的Apache Spark的R接口，提供dplyr后端

Model Tools

• ☑️ broom：用于将统计模型的结果整理成数据框形式(Hadley)
• ☑️ modelr：管道建模辅助包(Hadley)
• ❤️ caret：分类和回归问题的数据训练综合工具包（包括交叉验证，网格搜索等）

Machine Learning

• ☑️ mlr：机器学习（分类，回归，生存分析，聚类等）的可扩展框架，提供了用于分析的整套工具，包括重抽样，缺失值插补，模型评估(cv,etc)，超参数调优(grid-search,etc)，特征选择，可视化(ROC,learnning-curve,etc)等
• ⬜️ mlapi：提供模型的统一接口，以便机器学习流程化(借鉴python scikit-learn，尚未开发完整)
• ☑️ xgboost：以其速度和性能而著称的eXtreme Gradient Boosting Tree模型
• ☑️ arules：关联规则挖掘和频繁项集
• ⬜️ survival：生存分析模型
• ⬜️ nnet：神经网络

Deep Learning

• ❤️ tensorflow：Google开源的最受欢迎的深度学习框架
• ❤️ h2o：深度学习框架 (Update according to [cheat sheets][sheet])
• ❤️ keras：以 tensorflow/theano/CNTK 为后端的深度学习封装库

NLP (Natural Language Processing)

• ☑️ jiebaR：中文分词包
• ⬜️ Rwordseg：中文分词包，安装复杂
• ☑️ wordcloud2：词云
• ⬜️ tm： 一个全面的文本挖掘框架
• ❤️ quanteda：文本挖掘 (Update according to [cheat sheets][sheet])
• ❤️ tidytex：简单文本挖掘，结合dplyr，ggplot2和其他简洁工具
• ☑️ text2vec：一个快速文本挖掘框架（jiebaR推荐包） (Update according to GitHub)

Time Series

• ☑️ zoo：定义了规则和不规则时间序列S3类 (Update according to GitHub)
• ❤️ xts：对时间序列数据(zoo)的一种扩展实现，统一时间序列的操作接口 (Update according to GitHub)
• ☑️ prophet：线性或非线性模型高质量时间序列预测，它最适合日常数据
• ☑️ forecast：时间序列建模和预测
• ☑️ forecastHybrid：结合forcast包时间序列模型混合预测
• ⬜️ CausalImpact：使用贝叶斯结构时间序列模型进行因果推理

Finance

• ⬜️ quantmod：定量金融建模与交易框架（股票）
• ⬜️ PerformanceAnalytics：用于性能和风险分析的计量经济学工具

Communicate

• ☑️ R Markdown：用于创建可重复性报告和动态文档
• ⬜️ rticles：提供了一套RMarkdown模板
• ⬜️ flexdashboard：基于rmarkdown，可以轻松的创建仪表盘
• ⬜️ slidify：从Rmarkdown生成可重现的html5幻灯片
• ⬜️ knitr：用于在PDF和HTML文档中嵌入R代码块
• ☑️ shiny：使用R语言开发交互式web应用程序的工具

Learning R

• ☑️ Advanced R
• ☑️ R packages
• ☑️ R for Data Science
• ☑️ AwesomeR：R包大全
• ☑️ RStudio Cheat Sheets
• ☑️ TaskViews：CRAN Task Views
• ☑️ Search：Google search engine

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