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原创 conda出问题

连续几天用conda安装软件,或者更新conda都出现这个问题。一开始以为是不是要更新conda了,但是死活都是输出这个结果,上网搜索发现需要删除一个文件,试了一下,很灵,虽然不造为毛线……

2022-11-14 17:58:13 285 1

转载 Unix环境下PS1变量的设置

Unix环境下PS1变量的设置我的ps1命令提示符:export PS1="\[\e[31;1m\]\u @ \[\e[34;1m\]\h \[\e[36;1m\]\w \[\e[33;1m\]\t $ \[\e[37;1m\]\n"显示效果如下:1. 设置ps1变脸的显示 PS1(是数字1而不是字母l),每个版本bash的PS1变量内的特殊符号可能有些小的差异,你可以先man bash 一下。下面是FC4环境下默认的特殊符号所代表的意义:\d :代表日期,格式为we...

2021-10-07 13:50:56 404

原创 总结实验室对转录组及lncRNA数据分析的思路

     继师兄详细地讲述这个思路之后,我进行一个归纳总结(师兄说,首先要建立一个思想上的流程,再来纠结软件、命令这些细节!!!!!!)     首先你得了解 raw_data / 参考基因组  .fa / 注释文件 .gtf / 索引文件 indexes(通过hisat2-build ,根据基因组文件新建索引文件)     raw_data 原始数据     参考基因组  .fa  ...

2018-09-13 21:56:36 5862 1

原创 HISAT2+STRINGTIE+BALLGOWN 分析转录组数据

师兄推荐这篇文章,按照里面的命令,先做一套转录组分析。参考文献:Pertea M, Kim D,Pertea G M, et al. Transcript-level expression analysis of RNA-seq experimentswith HISAT, StringTie and Ballgown.[J]. Nature Protocols, 2016, 11(9):...

2018-08-20 20:31:06 18626 10

原创 学习大神使用R画火山图详细步骤

R软件 ggplot2一、导入包       library(ggplot2)二、改变工作路径,将工作路径改变到数据存放的文件夹下       getwd()       setwd()三、读取数据,我的是别人博客里下载的volcano.txt       data = read.table(file = "C:/Users/Administrator/Document...

2018-08-16 21:58:35 18250 1

空空如也

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