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RSS订阅转载 用stringr处理字符串
1. 准备工作 2. 字符串基础 2.1 创建字符串或字符向量 2.2 字符串长度：str_length() 函数 2.3 字符串组合：str_c() 函数 2.4 字符串取子集：str_sub() 函数 2.5 区域设置 3. 用正则表达式进行模式匹配：str_view()函数 3.1 基础匹配 3.2 锚点 3.3 字符类与字符选项 ..
2021-09-08 10:32:09
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翻译 gWQS包的使用
介绍加权量化和（WQS）回归是一种统计模型，用于环境暴露、表观/基因组学和代谢组学研究等常见的高维数据集的多变量回归。该模型构建了一个加权指数，估计所有预测变量对结果的混合效应，然后可以在带有相关协变量的回归模型中使用，以检验该指数与因变量或结果的关联。然后，每个单独的预测因素对整体指数效应的贡献可以通过模型分配给每个变量的权重的相对强度来评估。gWQS包将WQS回归扩展到具有连续和分类结果的应用中，并实现了随机子集WQS和重复保持WQS。在实践中，分析的主要产出将是参数估计和预测变量的总体指数效应
2021-09-07 15:00:23
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转载 临床研究统计分析的要求和报告规范
1）总体要求所有稿件都应在“方法部分”，简单描述主要分析和次要分析的内容，以及样本量和统计功效。所有稿件都应在“方法部分”，交代缺失数据的处理方法。除非缺失非常罕见，否则，所谓“包括所有病例”的分析是不可能的，所以是不可接受的，研究者应该根据数据缺失的原因或机制采取适当的处理方法。比如，对于随机缺失的数据，可采用多重填补法（multiple imputation）或逆向概率加权法（inverse probability case weights）；如果缺失数据不是随机的，且有一定的规律性
2021-09-06 22:41:06
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转载 微生物网络构建原理: SparCC, MENA, LSA, CoNet
主要参考这个网站，是由CoNet的作者写的(点阅读原文直达)。http://psbweb05.psb.ugent.be/conet/microbialnetworks/index.phpMicrobial association network construction tutorial宏基因组公众号之前对该网站进行了翻译整理：微生物相关网络构建教程：MENA, LSA,SparCC和CoNet但是后来网站又增加了新的方法SPIEC-EASI。另外他们还做了一
2021-09-01 16:49:58
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转载 微生物相关网络构建教程：MENA, LSA, SparCC和CoNet
简介Introduction本文提供MENA, LSA, SparCC和 CoNet四种网络构建方法，作者为CoNet作者。由宏基因组公众号翻译整理，并补充及更新部分程序参数。说明：计算过程在Ubuntu16.04系统的服务器，没服务器的伙伴可以使用QIIME提供的虚拟机；网络可视化在Win10上安装Cytoscape展示及导出。必须软件Prerequisites 最新版Windows版 Cytoscape下载并安装 http://www.cytoscape.org/ 在Cyto.
2021-09-01 16:33:18
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如何批量地将数据集中的分类变量设置成因子变量
2019-04-02
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