基因测序
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闲看庭前雪
热爱学习,热爱科研,热爱学习的大雪人,用爱来爱每一个爱我的人,用心去做每一件值得用心去做的事。
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GWAS处理流程(全基因组关联分析)——对从ADNI数据库下载的SNP数据及进行质控(QC)
对从ADNI数据库下载的SNP数据及进行质控(QC)简介一、先查看数据中的个体和SNP缺失情况1.查看2.生成绘图以可视化缺失结果。二、QC第一步:删除缺失度大于某个数值的SNP和个体1.删除SNP2.删除个体3.重复1操作4.重复2操作三、QC第二步:检查性别(非必要步骤)1.检查性别2.可视化结果3.以下两个脚本可用于处理性别差异的个体。(可选,但是我没做)1.删除存在性别差异的个体1)找出并生成相应文本2)根据文本删除个体数据2.修改 input-sex四、QC第三步:最小等位基因频率(MAF)定义:原创 2021-01-27 12:00:20 · 8374 阅读 · 17 评论 -
论文小结——基于聚类演化随机森林的阿尔兹海默症的多模态数据分析
系列文章目录提示:这里可以添加系列文章的所有文章的目录,目录需要自己手动添加例如:第一章 Python 机器学习入门之pandas的使用基于聚类演化随机森林的阿尔兹海默症的多模态数据分析系列文章目录前言一、全局总览二、使用步骤1.引入库2.读入数据总结前言这篇博客只是我总结自己对这篇论文的理解,还存在许多理解不到位和理解错误的地方,还请大家批评和指正。这篇论文题目为:Multimodal Data Analysis of Alzheimer’s Disease Based on Clus原创 2020-11-30 15:28:01 · 2270 阅读 · 2 评论 -
基于多模态成像遗传学数据来预测帕金森病相关基因和大脑区域的新型CERNNE方法
基于多峰成像遗传学数据的帕金森病相关基因和大脑区域预测的新型GERNNE方法前言阅览文章之前记得一键三联哦,做文章不容易,十分感谢大家的鼓励。一、提纲1.概述2.学术简称二、背景与问题1.背景2.问题三、目标与步骤1.目标2.步骤四、方法与创新点1.多峰数据集和预处理2.提取融合特征3.pearson相关分析方法4.GERNNE二、使用步骤二、使用步骤总结前言这几天在看一篇论文,想和大家分享一下。阅览文章之前记得一键三联哦,做文章不容易,十分感谢大家的鼓励。这里我只是用自己的话简单概括了文章的大.原创 2020-11-12 15:24:34 · 1225 阅读 · 7 评论